Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G084600.1
Synonym Sb04g006970, SHN1, WIN1
Functional annotation similar to Putative uncharacterized protein (PubMedID : 29862293)
AP2 domain containing protein, expressed
UniProt A0A194YPI8
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31194 PTHR31194:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G15360 : Integrase-type DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g10760.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019536 , Zm00025a051285 , Zm00025a042228
Brachypodium KQJ93914 , KQJ93915
Barley HORVU6Hr1G038120.1 , HORVU6Hr1G038120.2 , HORVU6Hr1G038120.3 , HORVU6Hr1G038120.4 , HORVU6Hr1G038120.5 , HORVU6Hr1G038120.6 , HORVU6Hr1G038120.7
Wheat TraesCS6B02G210300 , TraesCS6A02G181400 , TraesCS6A02G181400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G171901 - -
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16 Sobic.010G163666 - -
17 Sobic.009G026700 expressed protein -
18 Sobic.009G192400 - -
19 Sobic.001G191500 expressed protein -
20 Sobic.004G255550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G084600--Sobic002G171901 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic004G084600--Sobic006G072701 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic004G084600--Sobic004G030850 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G084600--Sobic006G041200 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic004G084600--Sobic006G111000 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic004G084600--Sobic003G336550 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G084600--Sobic007G203800 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G084600--Sobic010G088100 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic004G084600--Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic006G072701--Sobic008G083100 Sobic006G072701--Sobic004G084600 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic006G072701--Sobic001G191500 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic006G072701--Sobic009G026700 Sobic006G072701--Sobic002G171901 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic006G041200 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic006G072701--Sobic009G074800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic006G072701--Sobic001G250750 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic006G041200 Sobic006G041200--Sobic006G111000 Sobic006G041200--Sobic004G255550 Sobic006G041200--Sobic007G182300 Sobic006G041200--Sobic003G336550 Sobic006G041200--Sobic004G084600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G041200--Sobic003G219300 Sobic006G041200--Sobic002G171901 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic006G041200--Sobic002G200400 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic006G041200--Sobic004G180950 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G111000--Sobic009G176100 Sobic003G336550--Sobic004G030850 Sobic003G336550--Sobic006G041200 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic004G084600 Sobic003G336550--Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic004G255550 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic003G336550--Sobic001G485901 Sobic003G336550--Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic008G113200 Sobic007G203800--Sobic002G171901 Sobic007G203800--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic006G041200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G203800--Sobic007G225050 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic003G336550 Sobic007G203800--Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic008G085800 Sobic010G088100--Sobic004G030850 Sobic010G088100--Sobic004G084600 Sobic003G058300 Sobic003G058300 Sobic010G088100--Sobic003G058300 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic010G088100--Sobic004G118000 Sobic010G088100--Sobic002G171901 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic010G088100--Sobic002G033200 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic010G088100--Sobic009G137401 Sobic010G088100--Sobic003G336550 Sobic010G088100--Sobic001G191500 Sobic004G117850--Sobic006G111000 Sobic004G117850--Sobic002G171901 Sobic004G117850--Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic004G084600 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic007G203800 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic004G117850--Sobic003G329300
Octagon: transcription factors


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