Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G113200.2,Sobic.008G113200.1
Synonym Sb08g016710
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5YP84 , A0A1Z5R779
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF27
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G02820 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g34340.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054403
Brachypodium KQJ86532
Barley HORVU5Hr1G027150.2 , HORVU5Hr1G027150.1
Wheat TraesCS5D02G112000 , TraesCS5B02G104900 , TraesCS5A02G099700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G113200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic008G113200--Sobic004G255550 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic008G113200--Sobic008G083100 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic008G113200--Sobic004G030850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic008G113200--Sobic006G111000 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic008G113200--Sobic003G336550 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic008G113200--Sobic002G226200 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic008G113200--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic008G113200--Sobic009G192400 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic008G113200--Sobic009G137401 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G255550--Sobic006G041200 Sobic004G255550--Sobic008G113200 Sobic004G255550--Sobic002G226200 Sobic004G255550--Sobic006G111000 Sobic004G255550--Sobic003G336550 Sobic004G255550--Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic004G030850 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic004G255550--Sobic007G182300 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic004G255550--Sobic007G078700 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic008G083100--Sobic006G072701 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic008G083100--Sobic004G033650 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic008G083100--Sobic001G191500 Sobic008G083100--Sobic008G113200 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic008G083100--Sobic009G074800 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic008G083100--Sobic009G026700 Sobic008G083100--Sobic007G182300 Sobic008G083100--Sobic002G226200 Sobic008G083100--Sobic004G255550 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G111000--Sobic009G176100 Sobic003G336550--Sobic004G030850 Sobic003G336550--Sobic006G041200 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic004G084600 Sobic003G336550--Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic004G255550 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic003G336550--Sobic001G485901 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic008G113200 Sobic002G226200--Sobic004G255550 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic002G226200--Sobic003G219300 Sobic002G226200--Sobic008G083100 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic002G226200--Sobic003G267600 Sobic002G226200--Sobic006G041200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic002G226200--Sobic008G190600 Sobic002G226200--Sobic001G191500 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic002G226200--Sobic007G016200 Sobic002G226200--Sobic006G021100 Sobic004G084600--Sobic002G171901 Sobic004G084600--Sobic006G072701 Sobic004G084600--Sobic004G030850 Sobic004G084600--Sobic006G041200 Sobic004G084600--Sobic006G111000 Sobic004G084600--Sobic003G336550 Sobic004G084600--Sobic007G203800 Sobic004G084600--Sobic010G088100 Sobic004G084600--Sobic004G117850 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic009G192400--Sobic010G155000 Sobic009G192400--Sobic003G267600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic009G192400--Sobic003G334400 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic009G192400--Sobic001G283400 Sobic009G192400--Sobic007G182300 Sobic009G192400--Sobic006G041200 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic009G192400--Sobic007G206400 Sobic009G192400--Sobic007G203800 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic009G192400--Sobic006G128150 Sobic009G137401--Sobic001G191500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic009G137401--Sobic001G190900 Sobic009G137401--Sobic003G053750 Sobic009G137401--Sobic004G030850 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic009G137401--Sobic003G429600 Sobic009G137401--Sobic008G113200 Sobic001G528900 Sobic001G528900 Sobic009G137401--Sobic001G528900 Sobic009G137401--Sobic008G083100 Sobic009G137401--Sobic006G072701
Octagon: transcription factors


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