Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G030850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5XTV4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G336550 - -
2 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G088100 ADP-ribosylation factor 1, putative, expressed K07977: Arf/Sar family, other
4 Sobic.008G113200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.006G072701 - -
6 Sobic.004G255550 - -
7 Sobic.002G171901 - -
8 Sobic.003G053750 - -
9 Sobic.006G041200 - -
10 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
11 Sobic.006G111000 expressed protein -
12 Sobic.009G137401 - -
13 Sobic.001G191500 expressed protein -
14 Sobic.002G033200 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
15 Sobic.005G031400 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G026700 expressed protein -
17 Sobic.001G485901 - -
18 Sobic.008G083100 expressed protein -
19 Sobic.008G190600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@oxidoreductase, putative, expressed K07007: 3-dehydro-bile acid Delta4,6-reductase
20 Sobic.009G074800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G030850--Sobic006G041200 Sobic003G336550--Sobic004G030850 Sobic003G336550--Sobic006G041200 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic004G084600 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic004G255550 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic003G336550--Sobic001G485901 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic008G113200 Sobic004G084600--Sobic002G171901 Sobic004G084600--Sobic006G072701 Sobic004G084600--Sobic004G030850 Sobic004G084600--Sobic006G041200 Sobic004G084600--Sobic006G111000 Sobic004G084600--Sobic003G336550 Sobic004G084600--Sobic007G203800 Sobic004G084600--Sobic010G088100 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic004G084600--Sobic004G117850 Sobic010G088100--Sobic004G030850 Sobic010G088100--Sobic004G084600 Sobic003G058300 Sobic003G058300 Sobic010G088100--Sobic003G058300 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic010G088100--Sobic004G118000 Sobic010G088100--Sobic002G171901 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic010G088100--Sobic002G033200 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic010G088100--Sobic009G137401 Sobic010G088100--Sobic003G336550 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic010G088100--Sobic001G191500 Sobic008G113200--Sobic004G255550 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic008G113200--Sobic008G083100 Sobic008G113200--Sobic004G030850 Sobic008G113200--Sobic006G111000 Sobic008G113200--Sobic003G336550 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic008G113200--Sobic002G226200 Sobic008G113200--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic008G113200--Sobic009G192400 Sobic008G113200--Sobic009G137401 Sobic006G072701--Sobic008G083100 Sobic006G072701--Sobic004G084600 Sobic006G072701--Sobic001G191500 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic006G072701--Sobic009G026700 Sobic006G072701--Sobic002G171901 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic006G041200 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic006G072701--Sobic009G074800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic006G072701--Sobic001G250750 Sobic004G255550--Sobic006G041200 Sobic004G255550--Sobic008G113200 Sobic004G255550--Sobic002G226200 Sobic004G255550--Sobic006G111000 Sobic004G255550--Sobic003G336550 Sobic004G255550--Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic004G030850 Sobic004G255550--Sobic007G182300 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic004G255550--Sobic007G078700 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic003G053750--Sobic004G030850 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic003G053750--Sobic003G429600 Sobic003G053750--Sobic009G137401 Sobic003G053750--Sobic006G021100 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic003G053750--Sobic009G176100 Sobic003G053750--Sobic002G033200 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G053750--Sobic003G329300 Sobic003G053750--Sobic001G191500 Sobic003G053750--Sobic008G113200 Sobic006G041200--Sobic006G111000 Sobic006G041200--Sobic004G255550 Sobic006G041200--Sobic007G182300 Sobic006G041200--Sobic003G336550 Sobic006G041200--Sobic004G084600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G041200--Sobic003G219300 Sobic006G041200--Sobic002G171901 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic006G041200--Sobic002G200400 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic006G041200--Sobic004G180950
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.