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Transcriptome id Sobic.001G485901.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SB47
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G336550 - -
2 Sobic.007G108600 - -
3 Sobic.004G030850 - -
4 Sobic.003G313600 - -
5 Sobic.003G253100 - -
6 Sobic.004G118000 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
7 Sobic.008G113200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.009G026700 expressed protein -
9 Sobic.004G255550 - -
10 Sobic.006G041200 - -
11 Sobic.003G272000 expressed protein -
12 Sobic.003G135900 OsRhmbd3 - Putative Rhomboid homologue, expressed K09651: rhomboid domain-containing protein 1
13 Sobic.006G211300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -
14 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G074800 - -
16 Sobic.001G159250 - -
17 Sobic.008G039200 - -
18 Sobic.008G083100 expressed protein -
19 Sobic.003G109150 - -
20 Sobic.009G199750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic001G485901--Sobic003G336550 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic001G485901--Sobic007G108600 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic001G485901--Sobic004G030850 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G485901--Sobic003G313600 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G485901--Sobic003G253100 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic001G485901--Sobic004G118000 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic001G485901--Sobic008G113200 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic001G485901--Sobic009G026700 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic001G485901--Sobic004G255550 Sobic003G336550--Sobic004G030850 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic003G336550--Sobic006G041200 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic003G336550--Sobic006G021100 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic003G336550--Sobic004G084600 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic006G111000 Sobic003G336550--Sobic004G255550 Sobic003G336550--Sobic001G485901 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic007G203800 Sobic003G336550--Sobic008G113200 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic007G108600--Sobic006G016950 Sobic007G108600--Sobic001G485901 Sobic007G108600--Sobic003G253100 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic007G108600--Sobic006G205300 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic007G108600--Sobic002G200400 Sobic007G108600--Sobic003G313600 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic007G108600--Sobic001G352633 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G108600--Sobic006G097600 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic007G108600--Sobic009G199750 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic006G041200 Sobic002G072050 Sobic002G072050 Sobic003G313600--Sobic002G072050 Sobic003G313600--Sobic006G205300 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic003G313600--Sobic004G160350 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G313600--Sobic010G169950 Sobic003G313600--Sobic003G253100 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic003G313600--Sobic010G264150 Sobic003G313600--Sobic003G336550 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic003G313600--Sobic008G039200 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic003G313600--Sobic007G113000 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic003G253100--Sobic001G283800 Sobic003G253100--Sobic008G039200 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic003G253100--Sobic001G523150 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic003G253100--Sobic007G052500 Sobic003G253100--Sobic007G108600 Sobic003G253100--Sobic003G313600 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic003G253100--Sobic006G162750 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic003G253100--Sobic001G094550 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic003G253100--Sobic006G128150 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic004G118000--Sobic004G033650 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic004G118000--Sobic001G191500 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic004G118000--Sobic002G209450 Sobic004G118000--Sobic006G072701 Sobic004G118000--Sobic010G088100 Sobic004G118000--Sobic006G041200 Sobic002G413700 Sobic002G413700 Sobic004G118000--Sobic002G413700 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic004G118000--Sobic008G083100 Sobic004G118000--Sobic009G026700 Sobic008G113200--Sobic004G255550 Sobic008G113200--Sobic008G083100 Sobic008G113200--Sobic004G030850 Sobic008G113200--Sobic006G111000 Sobic008G113200--Sobic003G336550 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic008G113200--Sobic002G226200 Sobic008G113200--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic008G113200--Sobic009G192400 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic008G113200--Sobic009G137401 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic009G026700--Sobic009G074800 Sobic009G026700--Sobic006G072701 Sobic009G026700--Sobic004G033650 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic009G026700--Sobic008G142200 Sobic009G026700--Sobic008G083100 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic009G026700--Sobic010G183350 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic009G026700--Sobic008G190600 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G026700--Sobic001G001800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic009G026700--Sobic001G250750 Sobic004G255550--Sobic006G041200 Sobic004G255550--Sobic008G113200 Sobic004G255550--Sobic002G226200 Sobic004G255550--Sobic006G111000 Sobic004G255550--Sobic003G336550 Sobic004G255550--Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic004G030850 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic004G255550--Sobic007G182300 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic004G255550--Sobic007G078700
Octagon: transcription factors


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