Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G108600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PHE9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G016950 - -
2 Sobic.001G485901 - -
3 Sobic.003G253100 - -
4 Sobic.006G205300 - -
5 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.003G313600 - -
7 Sobic.001G352633 - -
8 Sobic.006G097600 - -
9 Sobic.009G199750 - -
10 Sobic.007G126150 - -
11 Sobic.001G283800 - -
12 Sobic.002G204050 - -
13 Sobic.004G150300 - -
14 Sobic.008G039200 - -
15 Sobic.004G183701 - -
16 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
17 Sobic.006G041200 - -
18 Sobic.001G283400 CSLD1 - cellulose synthase-like family D, expressed -
19 Sobic.005G018400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G180950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic007G108600--Sobic006G016950 Sobic001G485901 Sobic001G485901 Sobic007G108600--Sobic001G485901 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic007G108600--Sobic003G253100 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic007G108600--Sobic006G205300 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic007G108600--Sobic002G200400 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic007G108600--Sobic003G313600 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic007G108600--Sobic001G352633 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G108600--Sobic006G097600 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic007G108600--Sobic009G199750 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic006G016950--Sobic002G358450 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic006G016950--Sobic001G502801 Sobic006G016950--Sobic007G108600 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic006G016950--Sobic007G183200 Sobic006G016950--Sobic001G352633 Sobic006G016950--Sobic006G205300 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic006G016950--Sobic001G182700 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic006G016950--Sobic009G143750 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic006G016950--Sobic002G401533 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic001G485901--Sobic003G336550 Sobic001G485901--Sobic007G108600 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic001G485901--Sobic004G030850 Sobic001G485901--Sobic003G313600 Sobic001G485901--Sobic003G253100 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic001G485901--Sobic004G118000 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic001G485901--Sobic008G113200 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic001G485901--Sobic009G026700 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic001G485901--Sobic004G255550 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic003G253100--Sobic001G283800 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic003G253100--Sobic008G039200 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic003G253100--Sobic001G523150 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic003G253100--Sobic007G052500 Sobic003G253100--Sobic007G108600 Sobic003G253100--Sobic003G313600 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic003G253100--Sobic006G162750 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic003G253100--Sobic001G094550 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic003G253100--Sobic006G128150 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic006G205300--Sobic004G183701 Sobic006G205300--Sobic002G200400 Sobic006G205300--Sobic002G358450 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic006G205300--Sobic001G261444 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic006G205300--Sobic001G475950 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic006G205300--Sobic010G169950 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic006G205300--Sobic006G107700 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic006G205300--Sobic001G383350 SobicK032200 SobicK032200 Sobic006G205300--SobicK032200 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic004G180950 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic002G200400--Sobic001G283400 Sobic002G200400--Sobic009G199750 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G200400--Sobic010G155000 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic002G200400--Sobic004G072300 Sobic002G200400--Sobic006G205300 Sobic002G200400--Sobic004G183701 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic001G352633 Sobic002G072050 Sobic002G072050 Sobic003G313600--Sobic002G072050 Sobic003G313600--Sobic006G205300 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic003G313600--Sobic004G160350 Sobic003G313600--Sobic010G169950 Sobic003G313600--Sobic003G253100 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic003G313600--Sobic010G264150 Sobic003G313600--Sobic003G336550 Sobic003G313600--Sobic008G039200 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic003G313600--Sobic007G113000 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic001G352633--Sobic004G150300 Sobic001G352633--Sobic002G200400 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic001G352633--Sobic007G182300 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic001G352633--Sobic001G250750 Sobic001G352633--Sobic006G205300 Sobic001G352633--Sobic004G183701 Sobic001G352633--Sobic006G016950 Sobic003G272000 Sobic003G272000 Sobic001G352633--Sobic003G272000 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic001G352633--Sobic003G219300 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic006G097600--Sobic001G471050 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic006G097600--Sobic007G042700 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic006G097600--Sobic003G129700 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic006G097600--Sobic009G145200 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic006G097600--Sobic005G018400 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic006G097600--Sobic006G053601 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic006G097600--Sobic002G178900 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic006G097600--Sobic009G170050 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic006G097600--Sobic007G226900 Sobic009G199750--Sobic004G180950 Sobic009G199750--Sobic001G283400 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic009G199750--Sobic007G206400 Sobic009G199750--Sobic002G200400 Sobic009G199750--Sobic005G018400 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic009G199750--Sobic002G129900 Sobic009G199750--Sobic010G155000 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic009G199750--Sobic006G041200 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic009G199750--Sobic003G230800
Octagon: transcription factors


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