Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G205300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PN12
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.006G205300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G183701 - -
2 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
3 Sobic.002G358450 - -
4 Sobic.001G261444 - -
5 Sobic.001G475950 - -
6 Sobic.010G169950 - -
7 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
8 Sobic.001G383350 - -
9 Sobic.K032200 ATP synthase protein MI25, putative, expressed -
10 Sobic.001G352633 - -
11 Sobic.010G201332 - -
12 Sobic.002G401533 - -
13 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
14 Sobic.002G204050 - -
15 Sobic.003G056200 - -
16 Sobic.003G313600 - -
17 Sobic.006G029850 - -
18 Sobic.006G016950 - -
19 Sobic.004G180950 - -
20 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta


Gene co-expression network
sample Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic006G205300--Sobic004G183701 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic006G205300--Sobic002G200400 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic006G205300--Sobic002G358450 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic006G205300--Sobic001G261444 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic006G205300--Sobic001G475950 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic006G205300--Sobic010G169950 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic006G205300--Sobic006G107700 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic006G205300--Sobic001G383350 SobicK032200 SobicK032200 Sobic006G205300--SobicK032200 Sobic004G183701--Sobic006G205300 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G183701--Sobic010G219200 Sobic004G183701--Sobic001G383350 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G183701--Sobic002G134800 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic004G183701--Sobic006G029850 SobicK032400 SobicK032400 Sobic004G183701--SobicK032400 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic004G183701--Sobic004G072300 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic004G183701--Sobic010G201332 Sobic004G183701--Sobic002G200400 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic004G180950 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic002G200400--Sobic001G283400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic002G200400--Sobic009G199750 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G200400--Sobic010G155000 Sobic002G200400--Sobic004G072300 Sobic002G200400--Sobic006G205300 Sobic002G200400--Sobic004G183701 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic003G085533 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic002G200400--Sobic001G352633 Sobic002G358450--Sobic010G201332 Sobic002G358450--Sobic001G475950 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic002G358450--Sobic007G183200 Sobic002G358450--SobicK032200 Sobic005G065800 Sobic005G065800 Sobic002G358450--Sobic005G065800 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic002G358450--Sobic004G126050 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G358450--Sobic003G056200 Sobic002G358450--Sobic001G261444 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic002G358450--Sobic002G401533 Sobic001G261444--SobicK032200 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic001G261444--Sobic007G200700 Sobic001G261444--Sobic001G383350 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic001G261444--Sobic004G115100 Sobic001G261444--Sobic001G475950 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G261444--Sobic003G161900 Sobic001G261444--Sobic006G029850 Sobic001G261444--Sobic010G201332 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic001G261444--Sobic008G100201 Sobic001G475950--SobicK032200 Sobic001G475950--Sobic003G056200 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic001G475950--Sobic003G172966 Sobic001G475950--Sobic001G261444 Sobic001G475950--Sobic002G358450 Sobic001G475950--Sobic010G201332 Sobic001G475950--Sobic004G126050 Sobic001G475950--Sobic006G107700 Sobic001G475950--Sobic002G401533 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic010G169950--Sobic001G037033 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic010G169950--Sobic009G257000 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic010G169950--Sobic007G113000 Sobic010G169950--Sobic002G401533 Sobic010G169950--Sobic006G107700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic010G169950--Sobic004G133201 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic010G169950--Sobic001G373850 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic010G169950--Sobic009G210250 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic010G169950--Sobic008G100900 Sobic006G107700--Sobic003G056200 Sobic006G107700--Sobic002G401533 Sobic006G107700--Sobic009G257000 Sobic006G107700--Sobic003G172966 Sobic006G107700--Sobic001G475950 Sobic006G107700--Sobic003G161900 Sobic006G107700--Sobic001G261444 Sobic006G107700--SobicK032200 Sobic006G107700--Sobic001G037033 Sobic001G383350--Sobic006G029850 Sobic001G383350--Sobic007G200700 Sobic001G383350--Sobic004G115100 Sobic001G383350--Sobic001G261444 Sobic001G383350--SobicK032400 Sobic001G383350--SobicK032200 SobicK032600 SobicK032600 Sobic001G383350--SobicK032600 Sobic001G383350--Sobic008G100201 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G383350--Sobic002G112500 SobicK032200--Sobic001G475950 SobicK032200--Sobic001G261444 SobicK032200--Sobic010G201332 SobicK032200--Sobic003G172966 SobicK032200--Sobic004G126050 SobicK032200--Sobic003G056200 SobicK032200--Sobic001G383350 Sobic001G506200 Sobic001G506200 SobicK032200--Sobic001G506200 SobicK032200--Sobic006G029850
Octagon: transcription factors


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