Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G164101.7,Sobic.007G164101.1,Sobic.007G164101.3,Sobic.007G164101.2,Sobic.007G164101.5,Sobic.007G164101.6,Sobic.007G164101.4
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RB65 , A0A1Z5RAB3 , A0A1Z5RAB2 , A0A1Z5RAE7 , A0A1Z5RAU2 , A0A1Z5RBC4 , A0A1Z5RA96
Pfam PF00627 PF12796
Panther DB PTHR24198 PTHR24198:SF67
NCBI CDD KOG4214; Myotrophin and similar proteins KOG0508Ankyrin repeat protein KOG441226S proteasome regulatory complex, subunit PSMD10
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28880 : Ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38460.1 : RNA recognition motif family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004265 , Zm00025a050394 , Zm00025a042700
Brachypodium KQJ86193 , PNT62472
Barley HORVU5Hr1G020960.34 , HORVU5Hr1G020960.35 , HORVU5Hr1G020960.32 , HORVU5Hr1G020960.33 , HORVU5Hr1G020960.30 , HORVU5Hr1G020960.31 , HORVU7Hr1G042100.8 , HORVU7Hr1G042100.9 , HORVU7Hr1G042100.6 , HORVU7Hr1G042100.7 , HORVU7Hr1G042100.4 , HORVU7Hr1G042100.5 , HORVU7Hr1G042100.2 , HORVU7Hr1G042100.3 , HORVU5Hr1G020960.12 , HORVU5Hr1G020960.23 , HORVU5Hr1G020960.22 , HORVU5Hr1G020960.25 , HORVU5Hr1G020960.24
Wheat TraesCS5B02G086100 , TraesCS5A02G079800 , TraesCS5D02G092300 , TraesCS5D02G092300 , TraesCS5B02G085900 , TraesCS5B02G085900 , TraesCS5D02G092200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G183450 - -
2 Sobic.006G147350 - -
3 Sobic.003G128575 - -
4 Sobic.006G017266 - -
5 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
7 Sobic.006G020350 - -
8 Sobic.006G005550 - -
9 Sobic.009G069450 - -
10 Sobic.001G249900 - -
11 Sobic.008G035633 - -
12 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
13 Sobic.003G255850 - -
14 Sobic.003G290050 - -
15 Sobic.006G078450 - -
16 Sobic.007G149750 - -
17 Sobic.003G079725 - -
18 Sobic.002G322101 - -
19 Sobic.001G365332 - -
20 Sobic.004G346800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G164101 Sobic007G164101 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic007G164101--Sobic005G183450 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic007G164101--Sobic006G147350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic007G164101--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic007G164101--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic007G164101--Sobic005G093600 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic007G164101--Sobic010G173600 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic007G164101--Sobic006G020350 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic007G164101--Sobic006G005550 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic007G164101--Sobic009G069450 Sobic005G183450--Sobic003G128575 Sobic005G183450--Sobic006G017266 Sobic005G183450--Sobic006G020350 Sobic005G183450--Sobic005G093600 Sobic005G183450--Sobic010G173600 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G183450--Sobic006G124850 Sobic005G183450--Sobic006G147350 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic005G183450--Sobic001G365332 Sobic005G183450--Sobic006G005550 Sobic006G147350--Sobic010G173600 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic006G147350--Sobic001G249900 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic006G147350--Sobic003G255850 Sobic006G147350--Sobic005G093600 Sobic006G147350--Sobic003G128575 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic006G147350--Sobic002G322101 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic006G147350--Sobic007G149750 Sobic006G147350--Sobic006G017266 Sobic006G147350--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic003G128575--Sobic007G149750 Sobic006G017266--Sobic003G128575 Sobic006G017266--Sobic005G183450 Sobic006G017266--Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic005G093600 Sobic006G017266--Sobic010G173600 Sobic006G017266--Sobic006G124850 Sobic006G017266--Sobic006G147350 Sobic006G017266--Sobic003G255850 Sobic006G017266--Sobic001G365332 Sobic005G093600--Sobic003G128575 Sobic005G093600--Sobic010G173600 Sobic005G093600--Sobic006G017266 Sobic005G093600--Sobic006G020350 Sobic005G093600--Sobic005G183450 Sobic005G093600--Sobic006G147350 Sobic005G093600--Sobic006G124850 Sobic005G093600--Sobic003G255850 Sobic005G093600--Sobic007G149750 Sobic010G173600--Sobic005G093600 Sobic010G173600--Sobic003G128575 Sobic010G173600--Sobic006G147350 Sobic010G173600--Sobic006G017266 Sobic010G173600--Sobic006G020350 Sobic010G173600--Sobic003G255850 Sobic010G173600--Sobic007G149750 Sobic010G173600--Sobic005G183450 Sobic010G173600--Sobic002G322101 Sobic006G020350--Sobic003G128575 Sobic006G020350--Sobic006G017266 Sobic006G020350--Sobic005G183450 Sobic006G020350--Sobic005G093600 Sobic006G020350--Sobic010G173600 Sobic006G020350--Sobic006G124850 Sobic006G020350--Sobic006G147350 Sobic006G020350--Sobic003G255850 Sobic006G020350--Sobic001G365332 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic006G005550--Sobic003G168350 Sobic006G005550--Sobic001G365332 Sobic006G005550--Sobic005G183450 Sobic006G005550--Sobic006G020350 Sobic006G005550--Sobic003G128575 Sobic006G005550--Sobic006G017266 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G005550--Sobic008G157700 Sobic006G005550--Sobic005G093600 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic006G005550--Sobic004G198701 Sobic009G069450--Sobic005G183450 Sobic009G069450--Sobic006G020350 Sobic009G069450--Sobic006G017266 Sobic009G069450--Sobic003G128575 Sobic009G069450--Sobic008G157700 Sobic009G069450--Sobic006G124850 Sobic009G069450--Sobic006G147350 Sobic009G069450--Sobic005G093600 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic009G069450--Sobic003G290050
Octagon: transcription factors


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