Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G201800.3,Sobic.004G201800.1
Synonym Sb04g024800
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XWJ2 , A0A194YRU0
Pfam -
Panther DB PTHR34665
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24700 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g38170.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021317
Brachypodium KQK00156
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G008101 - -
2 Sobic.007G223250 - -
3 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G048300 - -
5 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
6 Sobic.002G150032 - -
7 Sobic.003G290050 - -
8 Sobic.001G266000 OsClp10 - Putative Clp protease homologue, expressed -
9 Sobic.004G251400 - -
10 Sobic.002G288700 - K02711: photosystem II PsbJ protein
11 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
12 Sobic.002G149966 - -
13 Sobic.010G254000 cycloartenol synthase, putative, expressed K19011: achilleol B synthase
14 Sobic.002G222000 - -
15 Sobic.004G337600 - -
16 Sobic.003G173266 - K02956: RP-S15, MRPS15, small subunit ribosomal protein S15
17 Sobic.006G123800 - -
18 Sobic.009G069450 - -
19 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
20 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16


Gene co-expression network
sample Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic004G201800--Sobic005G008101 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic004G201800--Sobic007G223250 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic004G201800--Sobic002G014900 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic004G201800--Sobic001G048300 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic004G201800--Sobic003G172900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic004G201800--Sobic002G150032 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic004G201800--Sobic003G290050 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic004G201800--Sobic001G266000 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic004G201800--Sobic004G251400 Sobic005G008101--Sobic004G201800 Sobic005G008101--Sobic003G290050 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic005G008101--Sobic006G078450 Sobic003G089700 Sobic003G089700 Sobic005G008101--Sobic003G089700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic005G008101--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic005G008101--Sobic006G020350 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G008101--Sobic006G124850 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic005G008101--Sobic008G035633 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic005G008101--Sobic006G017266 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic007G223250--Sobic002G288700 Sobic007G223250--Sobic002G014900 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic007G223250--Sobic004G087000 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic007G223250--Sobic006G123800 Sobic007G223250--Sobic001G266000 Sobic007G223250--Sobic002G150032 Sobic007G223250--Sobic003G172900 Sobic007G223250--Sobic004G251400 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic007G223250--Sobic007G109200 Sobic002G014900--Sobic002G150032 Sobic002G014900--Sobic001G266000 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic002G014900--Sobic002G149966 Sobic002G014900--Sobic003G172900 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic002G014900--Sobic003G172850 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic002G014900--Sobic002G044500 Sobic002G014900--Sobic006G124850 Sobic002G014900--Sobic004G251400 Sobic002G014900--Sobic003G290050 Sobic001G048300--Sobic004G201800 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic001G048300--Sobic006G087250 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic001G048300--Sobic001G195550 Sobic001G048300--Sobic003G290050 Sobic001G048300--Sobic001G266000 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic001G048300--Sobic001G448350 Sobic001G048300--Sobic002G014900 Sobic001G048300--Sobic002G150032 Sobic001G048300--Sobic002G149966 Sobic003G172900--Sobic004G251400 Sobic003G172900--Sobic002G150032 Sobic003G172900--Sobic001G266000 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G172900--Sobic003G173266 Sobic003G172900--Sobic004G087000 Sobic003G172900--Sobic003G172850 Sobic003G172900--Sobic002G044500 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G172900--Sobic002G222000 Sobic003G172900--Sobic002G149966 Sobic002G150032--Sobic002G149966 Sobic002G150032--Sobic002G014900 Sobic002G150032--Sobic001G266000 Sobic002G150032--Sobic003G172900 Sobic002G150032--Sobic002G044500 Sobic002G150032--Sobic003G172850 Sobic002G150032--Sobic003G290050 Sobic002G150032--Sobic006G124850 Sobic002G150032--Sobic004G251400 Sobic003G290050--Sobic006G124850 Sobic003G290050--Sobic002G149966 Sobic003G290050--Sobic002G150032 Sobic003G290050--Sobic002G044500 Sobic003G290050--Sobic001G266000 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic003G290050--Sobic003G169400 Sobic003G290050--Sobic002G014900 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G290050--Sobic003G168500 Sobic003G290050--Sobic003G172850 Sobic001G266000--Sobic002G150032 Sobic001G266000--Sobic003G172900 Sobic001G266000--Sobic002G149966 Sobic001G266000--Sobic003G172850 Sobic001G266000--Sobic003G173266 Sobic001G266000--Sobic002G014900 Sobic001G266000--Sobic002G044500 Sobic001G266000--Sobic002G222000 Sobic001G266000--Sobic006G123800 Sobic004G251400--Sobic003G172900 Sobic004G251400--Sobic004G087000 Sobic004G251400--Sobic007G109200 Sobic004G251400--Sobic003G173266 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic004G251400--Sobic003G169300 Sobic004G251400--Sobic003G172850 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G251400--Sobic004G337600 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic004G251400--Sobic003G172701 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic004G251400--Sobic005G110493
Octagon: transcription factors


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