Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G048300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHC0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G201800 expressed protein -
2 Sobic.006G087250 - -
3 Sobic.001G195550 - -
4 Sobic.003G290050 - -
5 Sobic.001G266000 OsClp10 - Putative Clp protease homologue, expressed -
6 Sobic.001G448350 - -
7 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G150032 - -
9 Sobic.002G149966 - -
10 Sobic.007G223250 - -
11 Sobic.001G134900 exostosin, putative, expressed -
12 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
13 Sobic.005G008101 - -
14 Sobic.006G247400 transferase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G069450 - -
16 Sobic.006G123800 - -
17 Sobic.001G071250 - -
18 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16
19 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
20 Sobic.004G198701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic001G048300--Sobic004G201800 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic001G048300--Sobic006G087250 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic001G048300--Sobic001G195550 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic001G048300--Sobic003G290050 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic001G048300--Sobic001G266000 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic001G048300--Sobic001G448350 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic001G048300--Sobic002G014900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic001G048300--Sobic002G150032 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic001G048300--Sobic002G149966 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic004G201800--Sobic005G008101 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic004G201800--Sobic007G223250 Sobic004G201800--Sobic002G014900 Sobic004G201800--Sobic001G048300 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic004G201800--Sobic003G172900 Sobic004G201800--Sobic002G150032 Sobic004G201800--Sobic003G290050 Sobic004G201800--Sobic001G266000 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic004G201800--Sobic004G251400 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic006G087250--Sobic007G135301 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic006G087250--Sobic004G346800 Sobic006G087250--Sobic001G048300 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic006G087250--Sobic003G137300 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic001G071250 Sobic007G226300 Sobic007G226300 Sobic006G087250--Sobic007G226300 Sobic006G087250--Sobic001G195550 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic006G087250--Sobic009G069450 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic006G087250--Sobic003G393600 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic001G195550--Sobic004G346700 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic001G195550--Sobic002G174000 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic001G195550--Sobic001G417100 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic001G195550--Sobic001G365332 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic001G195550--Sobic007G115050 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic001G195550--Sobic008G139100 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic001G195550--Sobic001G260900 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic001G195550--Sobic003G168350 Sobic001G195550--Sobic004G346800 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic003G290050--Sobic006G124850 Sobic003G290050--Sobic002G149966 Sobic003G290050--Sobic002G150032 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic003G290050--Sobic002G044500 Sobic003G290050--Sobic001G266000 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic003G290050--Sobic003G169400 Sobic003G290050--Sobic002G014900 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G290050--Sobic003G168500 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic003G290050--Sobic003G172850 Sobic001G266000--Sobic002G150032 Sobic001G266000--Sobic003G172900 Sobic001G266000--Sobic002G149966 Sobic001G266000--Sobic003G172850 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic001G266000--Sobic003G173266 Sobic001G266000--Sobic002G014900 Sobic001G266000--Sobic002G044500 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic001G266000--Sobic002G222000 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic001G266000--Sobic006G123800 Sobic001G448350--Sobic001G195550 Sobic001G448350--Sobic004G346700 Sobic001G448350--Sobic002G174000 Sobic001G448350--Sobic001G260900 Sobic001G448350--Sobic007G115050 Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic001G448350--Sobic003G123500 Sobic001G448350--Sobic008G139100 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic001G448350--Sobic002G288800 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic001G448350--Sobic004G198701 Sobic002G014900--Sobic002G150032 Sobic002G014900--Sobic001G266000 Sobic002G014900--Sobic002G149966 Sobic002G014900--Sobic003G172900 Sobic002G014900--Sobic003G172850 Sobic002G014900--Sobic002G044500 Sobic002G014900--Sobic006G124850 Sobic002G014900--Sobic004G251400 Sobic002G014900--Sobic003G290050 Sobic002G150032--Sobic002G149966 Sobic002G150032--Sobic002G014900 Sobic002G150032--Sobic001G266000 Sobic002G150032--Sobic003G172900 Sobic002G150032--Sobic002G044500 Sobic002G150032--Sobic003G172850 Sobic002G150032--Sobic003G290050 Sobic002G150032--Sobic006G124850 Sobic002G150032--Sobic004G251400 Sobic002G149966--Sobic002G150032 Sobic002G149966--Sobic002G044500 Sobic002G149966--Sobic006G124850 Sobic002G149966--Sobic001G266000 Sobic002G149966--Sobic003G290050 Sobic002G149966--Sobic002G014900 Sobic002G149966--Sobic003G172900 Sobic002G149966--Sobic003G168500 Sobic002G149966--Sobic003G172850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.