Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G084400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PGT1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G159000 - -
2 Sobic.009G160300 - -
3 Sobic.005G048300 - -
4 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
5 Sobic.006G247400 transferase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G246950 - -
7 Sobic.007G052500 - -
8 Sobic.001G540250 - -
9 Sobic.003G194900 expressed protein -
10 Sobic.005G161000 expressed protein -
11 Sobic.005G017900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G125701 - -
13 Sobic.002G322100 - -
14 Sobic.009G029100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
15 Sobic.003G303800 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G060750 - -
17 Sobic.001G169950 - -
18 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
19 Sobic.009G215350 - -
20 Sobic.003G398900 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G084400 Sobic007G084400 Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic007G084400--Sobic003G159000 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic007G084400--Sobic009G160300 Sobic005G048300 Sobic005G048300 Sobic007G084400--Sobic005G048300 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic007G084400--Sobic003G137300 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic007G084400--Sobic006G247400 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic007G084400--Sobic002G246950 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic007G084400--Sobic007G052500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic007G084400--Sobic001G540250 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic007G084400--Sobic003G194900 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic003G159000--Sobic005G169900 Sobic003G159000--Sobic003G194900 Sobic003G159000--Sobic007G084400 Sobic003G159000--Sobic003G137300 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic003G159000--Sobic009G250000 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic003G159000--Sobic001G353700 Sobic009G177901 Sobic009G177901 Sobic003G159000--Sobic009G177901 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic003G159000--Sobic007G114401 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic003G159000--Sobic006G087250 Sobic009G160300--Sobic007G052500 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic009G160300--Sobic008G039200 Sobic001G089900 Sobic001G089900 Sobic009G160300--Sobic001G089900 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic009G160300--Sobic010G154801 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic009G160300--Sobic003G253100 Sobic010G277400 Sobic010G277400 Sobic009G160300--Sobic010G277400 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic009G160300--Sobic001G283800 Sobic009G209150 Sobic009G209150 Sobic009G160300--Sobic009G209150 Sobic001G484500 Sobic001G484500 Sobic009G160300--Sobic001G484500 Sobic006G152100 Sobic006G152100 Sobic005G048300--Sobic006G152100 Sobic005G048300--Sobic007G084400 Sobic005G084850 Sobic005G084850 Sobic005G048300--Sobic005G084850 Sobic001G541232 Sobic001G541232 Sobic005G048300--Sobic001G541232 Sobic005G048300--Sobic006G247400 Sobic005G048300--Sobic007G114401 Sobic002G322100 Sobic002G322100 Sobic005G048300--Sobic002G322100 Sobic001G163000 Sobic001G163000 Sobic005G048300--Sobic001G163000 Sobic008G024550 Sobic008G024550 Sobic005G048300--Sobic008G024550 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G137300--Sobic009G029100 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic003G137300--Sobic003G412500 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic005G101400 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic006G087250 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G137300--Sobic003G423400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic001G217800 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic003G137300--Sobic008G108300 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G137300--Sobic002G165200 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic006G247400--Sobic001G448350 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic006G247400--Sobic001G048300 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic006G247400--Sobic007G085966 Sobic006G247400--Sobic007G084400 Sobic005G161000 Sobic005G161000 Sobic006G247400--Sobic005G161000 Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic006G247400--Sobic003G123500 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic006G247400--Sobic005G008101 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic006G247400--Sobic004G201800 Sobic005G017900 Sobic005G017900 Sobic006G247400--Sobic005G017900 Sobic002G060750 Sobic002G060750 Sobic002G246950--Sobic002G060750 Sobic003G398900 Sobic003G398900 Sobic002G246950--Sobic003G398900 Sobic003G018400 Sobic003G018400 Sobic002G246950--Sobic003G018400 Sobic003G303800 Sobic003G303800 Sobic002G246950--Sobic003G303800 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic002G246950--Sobic001G378150 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic002G246950--Sobic002G411700 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic002G246950--Sobic002G285950 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic002G246950--Sobic002G149550 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic002G246950--Sobic007G094000 Sobic007G052500--Sobic003G253100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic007G052500--Sobic001G523150 Sobic007G052500--Sobic009G029100 Sobic007G052500--Sobic008G039200 Sobic007G052500--Sobic001G283800 Sobic007G052500--Sobic009G160300 Sobic007G052500--Sobic007G094000 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic007G052500--Sobic004G044401 Sobic007G052500--Sobic003G412500 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic001G540250--Sobic003G249300 Sobic001G540250--Sobic001G217800 Sobic001G540250--Sobic005G101400 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G540250--Sobic004G125701 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic001G540250--Sobic001G302100 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic001G540250--Sobic002G341600 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic001G540250--Sobic009G104850 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic001G540250--Sobic005G167450 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic001G540250--Sobic008G013700 Sobic006G142700 Sobic006G142700 Sobic003G194900--Sobic006G142700 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic003G194900--Sobic010G150000 Sobic003G194900--Sobic007G094000 Sobic002G038200 Sobic002G038200 Sobic003G194900--Sobic002G038200 Sobic003G194900--Sobic009G250000 Sobic001G124500 Sobic001G124500 Sobic003G194900--Sobic001G124500 Sobic003G194900--Sobic005G169900 Sobic004G342600 Sobic004G342600 Sobic003G194900--Sobic004G342600 Sobic003G194900--Sobic007G052500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.