Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G303800.1,Sobic.003G303800.2
Synonym Sb03g035240
Functional annotation tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q675 , A0A1B6Q687
Pfam PF03638
Panther DB PTHR12446 PTHR12446:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G29000 : Tesmin/TSO1-like CXC domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g55580.1 : tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027484 , Zm00025a039977
Brachypodium KQK09848 , KQK09849 , KQK09846 , KQK09847 , KQK09851 , KQK09850 , KQK09853 , KQK09852
Barley HORVU3Hr1G073470.8 , HORVU3Hr1G073470.2 , HORVU3Hr1G073470.3 , HORVU3Hr1G073470.1 , HORVU3Hr1G073470.6 , HORVU3Hr1G073470.7 , HORVU3Hr1G073470.4 , HORVU3Hr1G073470.5
Wheat TraesCS3B02G331700 , TraesCS3D02G297000 , TraesCS3D02G297000 , TraesCS3A02G304800
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.003G303800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G094000 - -
2 Sobic.007G052500 - -
3 Sobic.002G246950 - -
4 Sobic.001G283800 - -
5 Sobic.002G060750 - -
6 Sobic.002G274300 - -
7 Sobic.009G160300 - -
8 Sobic.003G398900 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
9 Sobic.001G540250 - -
10 Sobic.003G194900 expressed protein -
11 Sobic.001G484500 - -
12 Sobic.007G099300 - -
13 Sobic.003G253100 - -
14 Sobic.002G341600 lipase, putative, expressed -
15 Sobic.010G277400 GASR8 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.008G013700 - -
17 Sobic.001G523932 - -
18 Sobic.001G523150 - -
19 Sobic.001G302100 holliday junction resolvase, putative, expressed K07447: putative holliday junction resolvase
20 Sobic.004G125701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G303800 Sobic003G303800 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic003G303800--Sobic007G094000 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic003G303800--Sobic007G052500 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic003G303800--Sobic002G246950 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic003G303800--Sobic001G283800 Sobic002G060750 Sobic002G060750 Sobic003G303800--Sobic002G060750 Sobic002G274300 Sobic002G274300 Sobic003G303800--Sobic002G274300 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic003G303800--Sobic009G160300 Sobic003G398900 Sobic003G398900 Sobic003G303800--Sobic003G398900 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic003G303800--Sobic001G540250 Sobic007G094000--Sobic003G303800 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic007G094000--Sobic003G305250 Sobic007G094000--Sobic001G283800 Sobic007G094000--Sobic007G052500 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G094000--Sobic004G260700 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic007G094000--Sobic007G099300 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic007G094000--Sobic003G194900 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic007G094000--Sobic010G150000 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic007G094000--Sobic008G013700 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic007G052500--Sobic003G253100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic007G052500--Sobic001G523150 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic007G052500--Sobic009G029100 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic007G052500--Sobic008G039200 Sobic007G052500--Sobic001G283800 Sobic007G052500--Sobic009G160300 Sobic007G052500--Sobic007G094000 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic007G052500--Sobic004G044401 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic007G052500--Sobic003G412500 Sobic002G246950--Sobic002G060750 Sobic002G246950--Sobic003G398900 Sobic003G018400 Sobic003G018400 Sobic002G246950--Sobic003G018400 Sobic002G246950--Sobic003G303800 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic002G246950--Sobic001G378150 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic002G246950--Sobic002G411700 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic002G246950--Sobic002G285950 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic002G246950--Sobic002G149550 Sobic002G246950--Sobic007G094000 Sobic001G283800--Sobic003G253100 Sobic001G283800--Sobic007G052500 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G283800--Sobic009G192400 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic001G283800--Sobic007G108600 Sobic001G283800--Sobic007G094000 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G283800--Sobic003G313600 Sobic001G283800--Sobic001G523150 Sobic001G283800--Sobic008G039200 Sobic001G283800--Sobic004G260700 Sobic002G060750--Sobic002G246950 Sobic001G275400 Sobic001G275400 Sobic002G060750--Sobic001G275400 Sobic002G060750--Sobic003G303800 Sobic002G060750--Sobic003G398900 Sobic002G060750--Sobic003G018400 Sobic002G060750--Sobic007G094000 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic002G060750--Sobic001G302100 Sobic002G060750--Sobic002G274300 Sobic002G264700 Sobic002G264700 Sobic002G060750--Sobic002G264700 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic002G274300--Sobic001G094550 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic002G274300--Sobic001G358366 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic002G274300--Sobic004G207800 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic002G274300--Sobic008G171200 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic002G274300--Sobic001G331650 Sobic002G274300--Sobic001G523150 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic002G274300--Sobic001G476800 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic002G274300--Sobic001G037033 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic002G274300--Sobic007G113566 Sobic009G160300--Sobic007G052500 Sobic009G160300--Sobic008G039200 Sobic001G089900 Sobic001G089900 Sobic009G160300--Sobic001G089900 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic009G160300--Sobic010G154801 Sobic009G160300--Sobic003G253100 Sobic010G277400 Sobic010G277400 Sobic009G160300--Sobic010G277400 Sobic009G160300--Sobic001G283800 Sobic009G209150 Sobic009G209150 Sobic009G160300--Sobic009G209150 Sobic001G484500 Sobic001G484500 Sobic009G160300--Sobic001G484500 Sobic003G398900--Sobic002G246950 Sobic003G398900--Sobic002G411700 Sobic005G161000 Sobic005G161000 Sobic003G398900--Sobic005G161000 Sobic003G398900--Sobic001G484500 Sobic003G336400 Sobic003G336400 Sobic003G398900--Sobic003G336400 Sobic003G398900--Sobic003G303800 Sobic003G398900--Sobic002G060750 Sobic003G398900--Sobic009G160300 Sobic006G116600 Sobic006G116600 Sobic003G398900--Sobic006G116600 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic001G540250--Sobic003G249300 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic001G540250--Sobic001G217800 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic001G540250--Sobic005G101400 Sobic004G125701 Sobic004G125701 Sobic001G540250--Sobic004G125701 Sobic001G540250--Sobic001G302100 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic001G540250--Sobic002G341600 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic001G540250--Sobic009G104850 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic001G540250--Sobic005G167450 Sobic001G540250--Sobic008G013700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.