Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G484500.1
Synonym Sb01g045350
Functional annotation -
UniProt C5WVU2
Pfam -
Panther DB PTHR39113 PTHR39113:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G42725 : Putative membrane lipoprotein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000898
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G398900 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
2 Sobic.009G160300 - -
3 Sobic.007G052500 - -
4 Sobic.005G161000 expressed protein -
5 Sobic.003G303800 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G246950 - -
7 Sobic.001G283800 - -
8 Sobic.006G247400 transferase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G278400 expressed protein -
10 Sobic.003G253100 - -
11 Sobic.007G094000 - -
12 Sobic.002G411700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.010G277400 GASR8 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
14 Sobic.002G274300 - -
15 Sobic.001G540250 - -
16 Sobic.003G419000 - -
17 Sobic.007G084400 - -
18 Sobic.001G523150 - -
19 Sobic.009G029100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
20 Sobic.008G039200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G484500 Sobic001G484500 Sobic003G398900 Sobic003G398900 Sobic001G484500--Sobic003G398900 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic001G484500--Sobic009G160300 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic001G484500--Sobic007G052500 Sobic005G161000 Sobic005G161000 Sobic001G484500--Sobic005G161000 Sobic003G303800 Sobic003G303800 Sobic001G484500--Sobic003G303800 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic001G484500--Sobic002G246950 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic001G484500--Sobic001G283800 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic001G484500--Sobic006G247400 Sobic001G278400 Sobic001G278400 Sobic001G484500--Sobic001G278400 Sobic003G398900--Sobic002G246950 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic003G398900--Sobic002G411700 Sobic003G398900--Sobic005G161000 Sobic003G398900--Sobic001G484500 Sobic003G336400 Sobic003G336400 Sobic003G398900--Sobic003G336400 Sobic003G398900--Sobic003G303800 Sobic002G060750 Sobic002G060750 Sobic003G398900--Sobic002G060750 Sobic003G398900--Sobic009G160300 Sobic006G116600 Sobic006G116600 Sobic003G398900--Sobic006G116600 Sobic009G160300--Sobic007G052500 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic009G160300--Sobic008G039200 Sobic001G089900 Sobic001G089900 Sobic009G160300--Sobic001G089900 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic009G160300--Sobic010G154801 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic009G160300--Sobic003G253100 Sobic010G277400 Sobic010G277400 Sobic009G160300--Sobic010G277400 Sobic009G160300--Sobic001G283800 Sobic009G209150 Sobic009G209150 Sobic009G160300--Sobic009G209150 Sobic009G160300--Sobic001G484500 Sobic007G052500--Sobic003G253100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic007G052500--Sobic001G523150 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic007G052500--Sobic009G029100 Sobic007G052500--Sobic008G039200 Sobic007G052500--Sobic001G283800 Sobic007G052500--Sobic009G160300 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic007G052500--Sobic007G094000 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic007G052500--Sobic004G044401 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic007G052500--Sobic003G412500 Sobic005G161000--Sobic003G398900 Sobic005G161000--Sobic001G484500 Sobic005G161000--Sobic003G336400 Sobic005G161000--Sobic006G247400 Sobic010G258600 Sobic010G258600 Sobic005G161000--Sobic010G258600 Sobic005G161000--Sobic002G246950 Sobic007G084400 Sobic007G084400 Sobic005G161000--Sobic007G084400 Sobic005G161000--Sobic009G160300 Sobic005G161000--Sobic002G411700 Sobic003G303800--Sobic007G094000 Sobic003G303800--Sobic007G052500 Sobic003G303800--Sobic002G246950 Sobic003G303800--Sobic001G283800 Sobic003G303800--Sobic002G060750 Sobic002G274300 Sobic002G274300 Sobic003G303800--Sobic002G274300 Sobic003G303800--Sobic009G160300 Sobic003G303800--Sobic003G398900 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic003G303800--Sobic001G540250 Sobic002G246950--Sobic002G060750 Sobic002G246950--Sobic003G398900 Sobic003G018400 Sobic003G018400 Sobic002G246950--Sobic003G018400 Sobic002G246950--Sobic003G303800 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic002G246950--Sobic001G378150 Sobic002G246950--Sobic002G411700 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic002G246950--Sobic002G285950 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic002G246950--Sobic002G149550 Sobic002G246950--Sobic007G094000 Sobic001G283800--Sobic003G253100 Sobic001G283800--Sobic007G052500 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G283800--Sobic009G192400 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic001G283800--Sobic007G108600 Sobic001G283800--Sobic007G094000 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G283800--Sobic003G313600 Sobic001G283800--Sobic001G523150 Sobic001G283800--Sobic008G039200 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic001G283800--Sobic004G260700 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic006G247400--Sobic001G448350 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic006G247400--Sobic001G048300 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic006G247400--Sobic007G085966 Sobic006G247400--Sobic007G084400 Sobic006G247400--Sobic005G161000 Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic006G247400--Sobic003G123500 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic006G247400--Sobic005G008101 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic006G247400--Sobic004G201800 Sobic005G017900 Sobic005G017900 Sobic006G247400--Sobic005G017900 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic001G278400--Sobic004G060000 Sobic001G406200 Sobic001G406200 Sobic001G278400--Sobic001G406200 Sobic001G278400--Sobic001G283800 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic001G278400--Sobic003G267600 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G278400--Sobic001G378900 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G278400--Sobic008G132550 Sobic001G278400--Sobic002G246950 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G278400--Sobic006G128150 Sobic001G278400--Sobic003G253100
Octagon: transcription factors


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