Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G278400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S7X5
Pfam -
Panther DB PTHR35103
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G28310 : -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050247 , Zm00025a041308 , Zm00025a026615
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G060000 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G406200 - -
3 Sobic.001G283800 - -
4 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G378900 AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G132550 - -
7 Sobic.002G246950 - -
8 Sobic.006G128150 - -
9 Sobic.003G253100 - -
10 Sobic.010G154801 - -
11 Sobic.007G094000 - -
12 Sobic.007G052500 - -
13 Sobic.002G172800 expressed protein -
14 Sobic.001G484500 - -
15 Sobic.002G411700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.003G194900 expressed protein -
17 Sobic.006G233200 - -
18 Sobic.001G036400 expressed protein -
19 Sobic.009G192400 - -
20 Sobic.003G018400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G278400 Sobic001G278400 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic001G278400--Sobic004G060000 Sobic001G406200 Sobic001G406200 Sobic001G278400--Sobic001G406200 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic001G278400--Sobic001G283800 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic001G278400--Sobic003G267600 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G278400--Sobic001G378900 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G278400--Sobic008G132550 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic001G278400--Sobic002G246950 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G278400--Sobic006G128150 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G278400--Sobic003G253100 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic004G060000--Sobic007G044350 Sobic004G060000--Sobic001G278400 Sobic006G233200 Sobic006G233200 Sobic004G060000--Sobic006G233200 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic004G060000--Sobic001G036400 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic004G060000--Sobic002G411700 Sobic004G060000--Sobic001G378900 Sobic006G116600 Sobic006G116600 Sobic004G060000--Sobic006G116600 Sobic001G276500 Sobic001G276500 Sobic004G060000--Sobic001G276500 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic004G060000--Sobic001G104050 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic001G406200--Sobic010G154801 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic001G406200--Sobic004G150300 Sobic001G406200--Sobic006G128150 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic001G406200--Sobic001G352633 Sobic001G406200--Sobic008G132550 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic001G406200--Sobic008G082550 Sobic002G172800 Sobic002G172800 Sobic001G406200--Sobic002G172800 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G406200--Sobic009G192400 Sobic001G406200--Sobic003G253100 Sobic001G283800--Sobic003G253100 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic001G283800--Sobic007G052500 Sobic001G283800--Sobic009G192400 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic001G283800--Sobic007G108600 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic001G283800--Sobic007G094000 Sobic003G313600 Sobic003G313600 Sobic001G283800--Sobic003G313600 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic001G283800--Sobic001G523150 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic001G283800--Sobic008G039200 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic001G283800--Sobic004G260700 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic003G267600--Sobic004G205900 Sobic003G267600--Sobic009G192400 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic003G267600--Sobic002G226200 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic003G267600--Sobic001G283400 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic003G267600--Sobic007G016200 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic003G267600--Sobic007G206400 Sobic007G078900 Sobic007G078900 Sobic003G267600--Sobic007G078900 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic003G267600--Sobic010G155000 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic003G267600--Sobic009G199750 Sobic001G378900--Sobic006G128150 Sobic001G378900--Sobic008G082550 Sobic001G378900--Sobic001G036400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic001G378900--Sobic002G200400 Sobic001G378900--Sobic010G155000 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic001G378900--Sobic002G256250 Sobic001G378900--Sobic001G283400 Sobic001G243800 Sobic001G243800 Sobic001G378900--Sobic001G243800 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic001G378900--Sobic005G019250 Sobic008G132550--Sobic001G406200 Sobic008G132550--Sobic006G128150 Sobic008G132550--Sobic003G267600 Sobic008G132550--Sobic008G082550 Sobic008G132550--Sobic009G192400 Sobic008G132550--Sobic007G206400 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic008G132550--Sobic007G052000 Sobic001G079150 Sobic001G079150 Sobic008G132550--Sobic001G079150 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic008G132550--Sobic004G237900 Sobic002G060750 Sobic002G060750 Sobic002G246950--Sobic002G060750 Sobic003G398900 Sobic003G398900 Sobic002G246950--Sobic003G398900 Sobic003G018400 Sobic003G018400 Sobic002G246950--Sobic003G018400 Sobic003G303800 Sobic003G303800 Sobic002G246950--Sobic003G303800 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic002G246950--Sobic001G378150 Sobic002G246950--Sobic002G411700 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic002G246950--Sobic002G285950 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic002G246950--Sobic002G149550 Sobic002G246950--Sobic007G094000 Sobic006G128150--Sobic001G036400 Sobic006G128150--Sobic002G256250 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic010G028333 Sobic006G128150--Sobic008G082550 Sobic006G128150--Sobic002G200400 Sobic006G128150--Sobic001G079150 Sobic006G128150--Sobic009G192400 Sobic006G128150--Sobic001G378900 Sobic006G128150--Sobic010G155000 Sobic003G253100--Sobic001G283800 Sobic003G253100--Sobic008G039200 Sobic003G253100--Sobic001G523150 Sobic003G253100--Sobic007G052500 Sobic003G253100--Sobic007G108600 Sobic003G253100--Sobic003G313600 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic003G253100--Sobic006G162750 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic003G253100--Sobic001G094550 Sobic003G253100--Sobic006G128150
Octagon: transcription factors


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