Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G017900.1,Sobic.005G017900.2,Sobic.005G017900.3
Synonym Sb05g001530
Functional annotation OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt C5Y3L5 , A0A1Z5RGD4 , A0A1Z5RG99
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF61
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02760.1 : OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G017900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G247400 transferase family protein, putative, expressed -
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17 Sobic.004G201800 expressed protein -
18 Sobic.003G309500 PTAC12(PubMedID : 24676859)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@PTAC12, putative, expressed -
19 Sobic.005G068300 - -
20 Sobic.007G149750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G017900 Sobic005G017900 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic005G017900--Sobic006G247400 Sobic007G084400 Sobic007G084400 Sobic005G017900--Sobic007G084400 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic005G017900--Sobic001G048300 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic005G017900--Sobic005G008101 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic005G017900--Sobic006G087250 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic005G017900--Sobic003G137300 Sobic003G159000 Sobic003G159000 Sobic005G017900--Sobic003G159000 Sobic003G089700 Sobic003G089700 Sobic005G017900--Sobic003G089700 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic005G017900--Sobic009G069450 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic006G247400--Sobic001G448350 Sobic006G247400--Sobic001G048300 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic006G247400--Sobic007G085966 Sobic006G247400--Sobic007G084400 Sobic005G161000 Sobic005G161000 Sobic006G247400--Sobic005G161000 Sobic003G123500 Sobic003G123500 Sobic006G247400--Sobic003G123500 Sobic006G247400--Sobic005G008101 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic006G247400--Sobic004G201800 Sobic006G247400--Sobic005G017900 Sobic007G084400--Sobic003G159000 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic007G084400--Sobic009G160300 Sobic005G048300 Sobic005G048300 Sobic007G084400--Sobic005G048300 Sobic007G084400--Sobic003G137300 Sobic007G084400--Sobic006G247400 Sobic002G246950 Sobic002G246950 Sobic007G084400--Sobic002G246950 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic007G084400--Sobic007G052500 Sobic001G540250 Sobic001G540250 Sobic007G084400--Sobic001G540250 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic007G084400--Sobic003G194900 Sobic001G048300--Sobic004G201800 Sobic001G048300--Sobic006G087250 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic001G048300--Sobic001G195550 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic001G048300--Sobic003G290050 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic001G048300--Sobic001G266000 Sobic001G048300--Sobic001G448350 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic001G048300--Sobic002G014900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic001G048300--Sobic002G150032 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic001G048300--Sobic002G149966 Sobic005G008101--Sobic004G201800 Sobic005G008101--Sobic003G290050 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic005G008101--Sobic006G078450 Sobic005G008101--Sobic003G089700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic005G008101--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic005G008101--Sobic006G020350 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G008101--Sobic006G124850 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic005G008101--Sobic008G035633 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic005G008101--Sobic006G017266 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic006G087250--Sobic007G135301 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic006G087250--Sobic004G346800 Sobic006G087250--Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic003G137300 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic001G071250 Sobic007G226300 Sobic007G226300 Sobic006G087250--Sobic007G226300 Sobic006G087250--Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic009G069450 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic006G087250--Sobic003G393600 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G137300--Sobic009G029100 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic003G137300--Sobic003G412500 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic006G087250 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G137300--Sobic003G423400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic001G217800 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic003G137300--Sobic008G108300 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G137300--Sobic002G165200 Sobic005G169900 Sobic005G169900 Sobic003G159000--Sobic005G169900 Sobic003G159000--Sobic003G194900 Sobic003G159000--Sobic007G084400 Sobic003G159000--Sobic003G137300 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic003G159000--Sobic009G250000 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic003G159000--Sobic001G353700 Sobic009G177901 Sobic009G177901 Sobic003G159000--Sobic009G177901 Sobic007G114401 Sobic007G114401 Sobic003G159000--Sobic007G114401 Sobic003G159000--Sobic006G087250 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic003G089700--Sobic008G157700 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic003G089700--Sobic001G365332 Sobic003G089700--Sobic006G017266 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic003G089700--Sobic003G128575 Sobic003G089700--Sobic005G183450 Sobic003G089700--Sobic006G124850 Sobic003G089700--Sobic006G020350 Sobic003G089700--Sobic005G008101 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic003G089700--Sobic005G093600 Sobic009G069450--Sobic005G183450 Sobic009G069450--Sobic006G020350 Sobic009G069450--Sobic006G017266 Sobic009G069450--Sobic003G128575 Sobic009G069450--Sobic008G157700 Sobic009G069450--Sobic006G124850 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic009G069450--Sobic006G147350 Sobic009G069450--Sobic005G093600 Sobic009G069450--Sobic003G290050
Octagon: transcription factors


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