Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G068300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQL5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.005G068300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G172450 - -
2 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
3 Sobic.004G234766 - -
4 Sobic.002G397700 - -
5 Sobic.006G093550 - -
6 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.010G225400 expressed protein -
8 Sobic.001G249900 - -
9 Sobic.005G030266 - -
10 Sobic.006G139200 zinc knuckle family protein, expressed -
11 Sobic.010G133225 - -
12 Sobic.002G040550 - -
13 Sobic.008G024900 expressed protein -
14 Sobic.002G322101 - -
15 Sobic.005G096500 - -
16 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.006G130100 nucleotide-sugar transporter family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G054050 - -
19 Sobic.007G149750 - -
20 Sobic.008G140050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G068300 Sobic005G068300 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic005G068300--Sobic003G172450 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic005G068300--Sobic010G107901 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic005G068300--Sobic004G234766 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic005G068300--Sobic002G397700 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic005G068300--Sobic006G093550 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic005G068300--Sobic003G337200 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic005G068300--Sobic010G225400 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic005G068300--Sobic001G249900 Sobic005G030266 Sobic005G030266 Sobic005G068300--Sobic005G030266 Sobic003G172450--Sobic010G107901 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic002G397700 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic004G234766 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic006G093550 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic003G172450--Sobic008G024900 Sobic003G172450--Sobic010G225400 Sobic010G107901--Sobic002G397700 Sobic010G107901--Sobic004G234766 Sobic010G107901--Sobic003G172450 Sobic010G107901--Sobic006G093550 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic010G107901--Sobic002G322101 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic008G024900 Sobic010G107901--Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic001G249900 Sobic004G234766--Sobic010G107901 Sobic004G234766--Sobic002G397700 Sobic004G234766--Sobic006G093550 Sobic004G234766--Sobic002G322101 Sobic004G234766--Sobic003G172450 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic004G234766--Sobic007G149750 Sobic004G234766--Sobic001G249900 Sobic004G234766--Sobic010G133225 Sobic004G234766--Sobic003G337200 Sobic002G397700--Sobic010G107901 Sobic002G397700--Sobic004G234766 Sobic002G397700--Sobic006G093550 Sobic002G397700--Sobic003G172450 Sobic002G397700--Sobic002G322101 Sobic002G397700--Sobic010G133225 Sobic002G397700--Sobic007G149750 Sobic002G397700--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic003G337200 Sobic006G093550--Sobic002G322101 Sobic006G093550--Sobic004G234766 Sobic006G093550--Sobic002G397700 Sobic006G093550--Sobic010G107901 Sobic006G093550--Sobic001G249900 Sobic006G093550--Sobic007G149750 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic006G093550--Sobic006G147350 Sobic006G093550--Sobic010G133225 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic006G093550--Sobic010G173600 Sobic003G337200--Sobic004G234766 Sobic003G337200--Sobic010G107901 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic003G337200--Sobic004G268600 Sobic003G337200--Sobic002G397700 Sobic003G337200--Sobic006G093550 Sobic003G337200--Sobic002G322101 Sobic003G337200--Sobic003G172450 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic003G337200--Sobic003G255850 Sobic003G337200--Sobic007G149750 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic010G225400--Sobic010G201266 Sobic007G141650 Sobic007G141650 Sobic010G225400--Sobic007G141650 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic010G225400--Sobic005G167100 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic010G225400--Sobic002G278100 Sobic005G096500 Sobic005G096500 Sobic010G225400--Sobic005G096500 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic010G225400--Sobic010G107601 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic010G225400--Sobic008G140050 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic010G225400--Sobic003G172400 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic010G225400--Sobic009G104850 Sobic001G249900--Sobic006G147350 Sobic001G249900--Sobic006G093550 Sobic001G249900--Sobic002G322101 Sobic001G249900--Sobic007G149750 Sobic001G249900--Sobic010G173600 Sobic001G249900--Sobic004G234766 Sobic001G249900--Sobic003G255850 Sobic001G249900--Sobic002G397700 Sobic001G249900--Sobic010G107901 Sobic005G068200 Sobic005G068200 Sobic005G030266--Sobic005G068200 Sobic005G030266--Sobic001G249900 Sobic005G030266--Sobic006G093550 Sobic005G030266--Sobic010G107901 Sobic005G030266--Sobic010G133225 Sobic005G030266--Sobic002G397700 Sobic005G030266--Sobic004G234766 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic005G030266--Sobic006G130100 Sobic003G380800 Sobic003G380800 Sobic005G030266--Sobic003G380800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.