Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G068200.2,Sobic.005G068200.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PQL8 , A0A1Z5RH38
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G068200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G030266 - -
2 Sobic.001G249900 - -
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4 Sobic.006G130100 nucleotide-sugar transporter family protein, putative, expressed -
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11 Sobic.007G164101 - -
12 Sobic.007G226300 expressed protein -
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14 Sobic.002G322101 - -
15 Sobic.010G225400 expressed protein -
16 Sobic.005G068300 - -
17 Sobic.006G087250 - -
18 Sobic.007G149750 - -
19 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
20 Sobic.002G397700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G068200 Sobic005G068200 Sobic005G030266 Sobic005G030266 Sobic005G068200--Sobic005G030266 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic005G068200--Sobic001G249900 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic005G068200--Sobic006G147350 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic005G068200--Sobic006G130100 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic005G068200--Sobic006G093550 Sobic003G380800 Sobic003G380800 Sobic005G068200--Sobic003G380800 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic005G068200--Sobic010G133225 Sobic005G166900 Sobic005G166900 Sobic005G068200--Sobic005G166900 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic005G068200--Sobic003G393600 Sobic005G030266--Sobic005G068200 Sobic005G030266--Sobic001G249900 Sobic005G030266--Sobic006G093550 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic005G030266--Sobic010G107901 Sobic005G030266--Sobic010G133225 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic005G030266--Sobic002G397700 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic005G030266--Sobic004G234766 Sobic005G030266--Sobic006G130100 Sobic005G030266--Sobic003G380800 Sobic001G249900--Sobic006G147350 Sobic001G249900--Sobic006G093550 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic001G249900--Sobic002G322101 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic001G249900--Sobic007G149750 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic001G249900--Sobic010G173600 Sobic001G249900--Sobic004G234766 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic001G249900--Sobic003G255850 Sobic001G249900--Sobic002G397700 Sobic001G249900--Sobic010G107901 Sobic006G147350--Sobic010G173600 Sobic006G147350--Sobic001G249900 Sobic006G147350--Sobic003G255850 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic006G147350--Sobic005G093600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic006G147350--Sobic003G128575 Sobic006G147350--Sobic002G322101 Sobic006G147350--Sobic007G149750 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic006G147350--Sobic006G017266 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic006G147350--Sobic006G020350 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic006G130100--Sobic001G054050 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic006G130100--Sobic010G225400 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic006G130100--Sobic001G011600 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic006G130100--Sobic002G390200 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic006G130100--Sobic003G160300 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic006G130100--Sobic003G160400 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic006G130100--Sobic003G113100 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic006G130100--Sobic003G218950 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic006G130100--Sobic003G050100 Sobic006G093550--Sobic002G322101 Sobic006G093550--Sobic004G234766 Sobic006G093550--Sobic002G397700 Sobic006G093550--Sobic010G107901 Sobic006G093550--Sobic001G249900 Sobic006G093550--Sobic007G149750 Sobic006G093550--Sobic006G147350 Sobic006G093550--Sobic010G133225 Sobic006G093550--Sobic010G173600 Sobic003G380800--Sobic005G030266 Sobic003G380800--Sobic005G068200 Sobic003G380800--Sobic001G249900 Sobic003G380800--Sobic006G130100 Sobic003G380800--Sobic006G093550 Sobic003G380800--Sobic004G234766 Sobic003G380800--Sobic010G107901 Sobic003G380800--Sobic001G054050 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic003G380800--Sobic003G172450 Sobic010G133225--Sobic004G234766 Sobic010G133225--Sobic006G093550 Sobic010G133225--Sobic010G107901 Sobic010G133225--Sobic002G397700 Sobic010G133225--Sobic002G322101 Sobic010G133225--Sobic001G249900 Sobic010G133225--Sobic003G255850 Sobic010G133225--Sobic006G147350 Sobic010G133225--Sobic003G172450 Sobic003G097701 Sobic003G097701 Sobic005G166900--Sobic003G097701 Sobic005G166900--Sobic010G225400 Sobic007G141650 Sobic007G141650 Sobic005G166900--Sobic007G141650 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic005G166900--Sobic005G167100 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic005G166900--Sobic010G107601 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic005G166900--Sobic010G201266 Sobic005G166900--Sobic001G054050 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic005G166900--Sobic002G278100 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic005G166900--Sobic003G172400 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic003G393600--Sobic010G254000 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic003G393600--Sobic008G108300 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic003G393600--Sobic003G290050 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic003G393600--Sobic002G044500 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic003G393600--Sobic002G149966 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic003G393600--Sobic001G266000 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G393600--Sobic003G168500 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G393600--Sobic002G222000 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic003G393600--Sobic003G172900
Octagon: transcription factors


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