Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G007500.1
Synonym Sb01g000760
Functional annotation exosome complex exonuclease, putative, expressed
UniProt C5WS01
Pfam PF01138
Panther DB PTHR11953 PTHR11953:SF1
NCBI CDD KOG1069; Exosomal 3'-5' exoribonuclease complex, subunit Rrp46
KEGG Orthology K12590; RRP46, exosome complex component RRP46
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46210 : Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g63720.1 : exosome complex exonuclease, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016311
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G123690.8 , HORVU5Hr1G123690.9 , HORVU5Hr1G123690.2 , HORVU5Hr1G123690.3 , HORVU5Hr1G123690.1 , HORVU5Hr1G123690.6 , HORVU5Hr1G123690.7 , HORVU5Hr1G123690.4 , HORVU5Hr1G123690.5
Wheat TraesCS5D02G553600 , TraesCS5B02G555900 , TraesCS4A02G322500
Populus PNS92605


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G007500 Sobic001G007500 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic001G007500--Sobic008G054400 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic001G007500--Sobic001G204200 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic001G007500--Sobic008G166250 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G007500--Sobic004G184500 Sobic009G250800 Sobic009G250800 Sobic001G007500--Sobic009G250800 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic001G007500--Sobic002G076932 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic001G007500--Sobic005G094500 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G007500--Sobic009G170301 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G007500--Sobic006G103601 Sobic008G054400--Sobic008G166250 Sobic008G054400--Sobic002G076932 Sobic008G054400--Sobic005G094500 Sobic008G054400--Sobic001G204200 Sobic008G054400--Sobic004G184500 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G054400--Sobic002G065300 Sobic008G054400--Sobic009G170301 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic008G054400--Sobic009G094000 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic008G054400--Sobic010G244701 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic001G204200--Sobic009G258150 Sobic001G204200--Sobic009G250800 Sobic001G204200--Sobic006G103601 Sobic001G204200--Sobic010G244701 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic001G204200--Sobic010G257300 Sobic001G204200--Sobic002G076932 Sobic001G204200--Sobic008G166250 Sobic001G204200--Sobic005G094500 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic001G204200--Sobic003G379500 Sobic008G166250--Sobic004G184500 Sobic008G166250--Sobic005G094500 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic008G166250--Sobic003G155350 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic008G166250--Sobic004G314750 Sobic008G166250--Sobic001G204200 Sobic008G166250--Sobic008G054400 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic008G166250--Sobic002G114600 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic008G166250--Sobic001G212701 Sobic008G166250--Sobic009G094000 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic009G250800--Sobic003G379500 Sobic009G250800--Sobic010G244701 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic009G250800--Sobic002G285800 Sobic009G250800--Sobic009G258150 Sobic009G250800--Sobic001G204200 Sobic009G250800--Sobic006G103601 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic009G250800--Sobic006G146400 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic009G250800--Sobic004G269500 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic009G250800--Sobic002G116300 Sobic002G076932--Sobic009G170301 Sobic002G076932--Sobic005G094500 Sobic002G076932--Sobic001G204200 Sobic002G076932--Sobic008G054400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic002G076932--Sobic010G041500 Sobic002G076932--Sobic008G166250 Sobic002G076932--Sobic004G184500 Sobic002G076932--Sobic003G202900 Sobic002G076932--Sobic001G212701 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic005G094500--Sobic002G395900 Sobic005G094500--Sobic004G184500 Sobic005G094500--Sobic003G202900 Sobic005G094500--Sobic003G155350 Sobic005G094500--Sobic002G076932 Sobic005G094500--Sobic009G170301 Sobic005G094500--Sobic001G176800 Sobic005G094500--Sobic008G166250 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic005G094500--Sobic007G017300 Sobic009G170301--Sobic002G076932 Sobic009G170301--Sobic005G094500 Sobic009G170301--Sobic010G041500 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic009G170301--Sobic001G368000 Sobic009G170301--Sobic003G202900 Sobic009G170301--Sobic002G395900 Sobic009G170301--Sobic001G468200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic009G170301--Sobic001G490600 Sobic009G170301--Sobic007G017300 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic006G103601--Sobic009G238200 Sobic006G103601--Sobic002G285800 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic006G103601--Sobic010G106400 Sobic006G103601--Sobic002G116300 Sobic006G103601--Sobic006G146400 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic006G103601--Sobic009G174600 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic006G103601--Sobic001G537600 Sobic006G103601--Sobic003G379500 Sobic006G103601--Sobic009G258150
Octagon: transcription factors


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