Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G139000.1
Synonym SRC2, (AT)SRC2, Sb05g020330
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y3R3
Pfam PF00168
Panther DB PTHR32246 PTHR32246:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09070 : soybean gene regulated by cold-2
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g31867.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033573
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G104470.2 , HORVU2Hr1G104470.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G139000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G184500 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
2 Sobic.002G346250 - -
3 Sobic.008G112400 - -
4 Sobic.001G487250 - -
5 Sobic.005G001600 IBR domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G166250 - -
7 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
8 Sobic.004G223350 - -
9 Sobic.002G133600 - -
10 Sobic.003G155350 - -
11 Sobic.003G101600 - -
12 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
13 Sobic.005G083866 - -
14 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
15 Sobic.009G144050 - -
16 Sobic.002G331200 - -
17 Sobic.003G233300 expressed protein -
18 Sobic.002G114600 - -
19 Sobic.009G174600 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G018133 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G139000 Sobic005G139000 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G139000--Sobic004G184500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic005G139000--Sobic002G346250 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic005G139000--Sobic008G112400 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic005G139000--Sobic001G487250 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic005G139000--Sobic005G001600 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic005G139000--Sobic008G166250 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic005G139000--Sobic002G065300 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic005G139000--Sobic004G223350 Sobic002G133600 Sobic002G133600 Sobic005G139000--Sobic002G133600 Sobic004G184500--Sobic008G166250 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic004G184500--Sobic003G155350 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic004G184500--Sobic005G094500 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic004G184500--Sobic001G176800 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic004G184500--Sobic001G212701 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic004G184500--Sobic002G114600 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic004G184500--Sobic001G468200 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic004G184500--Sobic003G202900 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic004G184500--Sobic004G314750 Sobic002G346250--Sobic005G001600 Sobic002G346250--Sobic008G112400 Sobic002G346250--Sobic003G155350 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic002G346250--Sobic009G082500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic002G013600 Sobic002G346250--Sobic004G184500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G346250--Sobic003G043650 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G346250--Sobic004G288900 Sobic002G346250--Sobic004G223350 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic001G487250--Sobic003G155350 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic001G487250--Sobic001G513900 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G487250--Sobic009G144050 Sobic004G230800 Sobic004G230800 Sobic001G487250--Sobic004G230800 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic001G487250--Sobic008G024700 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic001G487250--Sobic009G004300 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic001G487250--Sobic002G360701 Sobic001G487250--Sobic005G139000 Sobic001G487250--Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic008G112400 Sobic005G001600--Sobic002G346250 Sobic005G001600--Sobic001G176800 Sobic005G001600--Sobic004G184500 Sobic005G001600--Sobic007G119300 Sobic005G001600--Sobic009G082500 Sobic001G096800 Sobic001G096800 Sobic005G001600--Sobic001G096800 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic005G001600--Sobic008G192800 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic005G001600--Sobic006G280900 Sobic008G166250--Sobic004G184500 Sobic008G166250--Sobic005G094500 Sobic008G166250--Sobic003G155350 Sobic008G166250--Sobic004G314750 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic008G166250--Sobic001G204200 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic008G166250--Sobic008G054400 Sobic008G166250--Sobic002G114600 Sobic008G166250--Sobic001G212701 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic008G166250--Sobic009G094000 Sobic002G065300--Sobic009G174600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic002G065300--Sobic004G302400 Sobic006G222650 Sobic006G222650 Sobic002G065300--Sobic006G222650 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic002G116300 Sobic002G065300--Sobic004G302550 Sobic002G065300--Sobic008G112400 Sobic002G065300--Sobic004G269500 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G065300--Sobic004G177400 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic002G065300--Sobic001G543600 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic004G223350--Sobic008G096300 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic002G133600--Sobic003G101600 Sobic002G271900 Sobic002G271900 Sobic002G133600--Sobic002G271900 Sobic002G133600--Sobic004G314750 Sobic006G229600 Sobic006G229600 Sobic002G133600--Sobic006G229600 Sobic004G152501 Sobic004G152501 Sobic002G133600--Sobic004G152501 Sobic003G313700 Sobic003G313700 Sobic002G133600--Sobic003G313700 Sobic006G257500 Sobic006G257500 Sobic002G133600--Sobic006G257500 Sobic002G133600--Sobic009G004300 Sobic002G133600--Sobic008G166250
Octagon: transcription factors


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