Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G233300.1
Synonym Sb03g029090
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XEJ3
Pfam -
Panther DB PTHR33264 PTHR33264:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01516 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g45160.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK08903 , KQK08904
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G019466 - -
2 Sobic.002G331700 expressed protein -
3 Sobic.005G139000 expressed protein -
4 Sobic.001G345366 - -
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10 Sobic.001G311700 - -
11 Sobic.002G331200 - -
12 Sobic.003G043650 - -
13 Sobic.006G201450 - -
14 Sobic.002G065300 OsSub58 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
15 Sobic.002G426650 - -
16 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
17 Sobic.002G346250 - -
18 Sobic.007G119300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endoglucanase, putative, expressed -
19 Sobic.004G200000 expressed protein -
20 Sobic.006G233200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G233300 Sobic003G233300 Sobic008G019466 Sobic008G019466 Sobic003G233300--Sobic008G019466 Sobic002G331700 Sobic002G331700 Sobic003G233300--Sobic002G331700 Sobic005G139000 Sobic005G139000 Sobic003G233300--Sobic005G139000 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic003G233300--Sobic001G345366 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic003G233300--Sobic007G094000 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic003G233300--Sobic005G083866 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic003G233300--Sobic008G112400 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic003G233300--Sobic010G011001 Sobic008G142301 Sobic008G142301 Sobic003G233300--Sobic008G142301 Sobic008G019466--Sobic003G233300 Sobic003G378500 Sobic003G378500 Sobic008G019466--Sobic003G378500 Sobic008G064900 Sobic008G064900 Sobic008G019466--Sobic008G064900 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic008G019466--Sobic008G173700 Sobic008G019466--Sobic002G331700 Sobic004G019700 Sobic004G019700 Sobic008G019466--Sobic004G019700 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic008G019466--Sobic004G177400 Sobic008G019466--Sobic008G112400 Sobic008G019466--Sobic001G345366 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic002G331700--Sobic002G426650 Sobic002G331700--Sobic008G112400 Sobic007G119300 Sobic007G119300 Sobic002G331700--Sobic007G119300 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic002G331700--Sobic002G065300 Sobic002G331700--Sobic003G233300 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic002G331700--Sobic002G285950 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic002G331700--Sobic004G302550 Sobic002G331700--Sobic008G064900 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic002G331700--Sobic007G016300 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic005G139000--Sobic004G184500 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic005G139000--Sobic002G346250 Sobic005G139000--Sobic008G112400 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic005G139000--Sobic001G487250 Sobic005G001600 Sobic005G001600 Sobic005G139000--Sobic005G001600 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic005G139000--Sobic008G166250 Sobic005G139000--Sobic002G065300 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic005G139000--Sobic004G223350 Sobic002G133600 Sobic002G133600 Sobic005G139000--Sobic002G133600 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic001G345366--Sobic004G200000 Sobic001G345366--Sobic007G016300 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic001G345366--Sobic006G152900 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic001G345366--Sobic009G082500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic001G345366--Sobic003G043650 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic001G345366--Sobic002G331200 Sobic001G345366--Sobic005G083866 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G345366--Sobic006G201450 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic001G345366--Sobic002G030001 Sobic003G303800 Sobic003G303800 Sobic007G094000--Sobic003G303800 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic007G094000--Sobic003G305250 Sobic001G283800 Sobic001G283800 Sobic007G094000--Sobic001G283800 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic007G094000--Sobic007G052500 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G094000--Sobic004G260700 Sobic007G099300 Sobic007G099300 Sobic007G094000--Sobic007G099300 Sobic003G194900 Sobic003G194900 Sobic007G094000--Sobic003G194900 Sobic010G150000 Sobic010G150000 Sobic007G094000--Sobic010G150000 Sobic008G013700 Sobic008G013700 Sobic007G094000--Sobic008G013700 Sobic005G083866--Sobic003G043650 Sobic005G083866--Sobic004G200000 Sobic005G083866--Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic002G331200 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic002G030001 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic002G018133 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic005G083866--Sobic007G081400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic005G083866--Sobic010G041500 Sobic008G112400--Sobic005G001600 Sobic008G112400--Sobic002G065300 Sobic008G112400--Sobic002G426650 Sobic008G112400--Sobic009G082500 Sobic008G112400--Sobic002G346250 Sobic008G112400--Sobic007G119300 Sobic008G112400--Sobic004G302550 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G112400--Sobic004G269500 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G112400--Sobic009G174600 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic010G011001--Sobic009G188750 Sobic003G239750 Sobic003G239750 Sobic010G011001--Sobic003G239750 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic010G011001--Sobic008G096300 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic010G011001--Sobic006G109850 Sobic010G011001--Sobic008G142301 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic010G011001--Sobic007G206600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic010G011001--Sobic008G086100 Sobic010G011001--Sobic003G233300 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic010G011001--Sobic009G024133 Sobic008G142301--Sobic010G011001 Sobic008G142301--Sobic003G233300 Sobic008G142301--Sobic009G188750 Sobic006G185700 Sobic006G185700 Sobic008G142301--Sobic006G185700 Sobic008G142301--Sobic005G139000 Sobic008G142301--Sobic009G024133 Sobic008G142301--Sobic005G083866 Sobic003G002900 Sobic003G002900 Sobic008G142301--Sobic003G002900 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic008G142301--Sobic007G203850
Octagon: transcription factors


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