Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G062400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHJ0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G027032 - -
2 Sobic.004G357066 - -
3 Sobic.004G344301 - -
4 Sobic.004G357033 - -
5 Sobic.004G225450 - -
6 Sobic.001G543600 tetraspanin family protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G103601 - -
8 Sobic.001G261553 - -
9 Sobic.006G109850 - -
10 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
11 Sobic.005G232200 expressed protein -
12 Sobic.003G239750 - -
13 Sobic.001G139600 - -
14 Sobic.010G096801 - -
15 Sobic.001G220200 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G174600 OsFBX407 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G285800 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR52 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
18 Sobic.001G410800 OsTOP6A3 - Topoisomerase 6 subunit A homolog 3, expressed K10878: meiotic recombination protein SPO11
19 Sobic.010G149900 - -
20 Sobic.010G136601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic005G027032 Sobic005G027032 Sobic001G062400--Sobic005G027032 Sobic004G357066 Sobic004G357066 Sobic001G062400--Sobic004G357066 Sobic004G344301 Sobic004G344301 Sobic001G062400--Sobic004G344301 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic001G062400--Sobic004G357033 Sobic004G225450 Sobic004G225450 Sobic001G062400--Sobic004G225450 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic001G062400--Sobic001G543600 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G062400--Sobic006G103601 Sobic001G261553 Sobic001G261553 Sobic001G062400--Sobic001G261553 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic001G062400--Sobic006G109850 Sobic005G027032--Sobic004G357066 Sobic005G027032--Sobic001G062400 Sobic005G027032--Sobic004G357033 Sobic005G027032--Sobic004G344301 Sobic010G096801 Sobic010G096801 Sobic005G027032--Sobic010G096801 Sobic001G206800 Sobic001G206800 Sobic005G027032--Sobic001G206800 Sobic005G027032--Sobic001G261553 Sobic005G027032--Sobic004G225450 Sobic001G220200 Sobic001G220200 Sobic005G027032--Sobic001G220200 Sobic004G357066--Sobic004G225450 Sobic004G357066--Sobic004G357033 Sobic004G357066--Sobic010G096801 Sobic004G357066--Sobic001G261553 Sobic004G357066--Sobic005G027032 Sobic004G357066--Sobic004G344301 Sobic004G357066--Sobic001G220200 Sobic001G139600 Sobic001G139600 Sobic004G357066--Sobic001G139600 Sobic001G410800 Sobic001G410800 Sobic004G357066--Sobic001G410800 Sobic004G344301--Sobic004G357033 Sobic004G344301--Sobic001G220200 Sobic004G344301--Sobic004G357066 Sobic004G344301--Sobic004G225450 Sobic010G158766 Sobic010G158766 Sobic004G344301--Sobic010G158766 Sobic001G223400 Sobic001G223400 Sobic004G344301--Sobic001G223400 Sobic003G427500 Sobic003G427500 Sobic004G344301--Sobic003G427500 Sobic001G519300 Sobic001G519300 Sobic004G344301--Sobic001G519300 Sobic010G074980 Sobic010G074980 Sobic004G344301--Sobic010G074980 Sobic004G357033--Sobic004G344301 Sobic004G357033--Sobic001G220200 Sobic004G357033--Sobic004G225450 Sobic004G357033--Sobic004G357066 Sobic004G357033--Sobic001G410800 Sobic010G136601 Sobic010G136601 Sobic004G357033--Sobic010G136601 Sobic004G357033--Sobic001G223400 Sobic004G357033--Sobic010G158766 Sobic002G285800 Sobic002G285800 Sobic004G357033--Sobic002G285800 Sobic004G225450--Sobic004G357066 Sobic004G225450--Sobic004G357033 Sobic004G225450--Sobic004G344301 Sobic004G225450--Sobic001G220200 Sobic004G225450--Sobic010G096801 Sobic004G225450--Sobic001G410800 Sobic004G225450--Sobic001G261553 Sobic009G225300 Sobic009G225300 Sobic004G225450--Sobic009G225300 Sobic004G225450--Sobic010G158766 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic001G543600--Sobic009G174600 Sobic004G302400 Sobic004G302400 Sobic001G543600--Sobic004G302400 Sobic001G543600--Sobic006G103601 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic001G543600--Sobic006G280900 Sobic001G543600--Sobic002G285800 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic001G543600--Sobic002G065300 Sobic009G238200 Sobic009G238200 Sobic001G543600--Sobic009G238200 Sobic001G543600--Sobic010G136601 Sobic002G116300 Sobic002G116300 Sobic001G543600--Sobic002G116300 Sobic006G103601--Sobic009G238200 Sobic006G103601--Sobic002G285800 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic006G103601--Sobic010G106400 Sobic006G103601--Sobic002G116300 Sobic006G146400 Sobic006G146400 Sobic006G103601--Sobic006G146400 Sobic006G103601--Sobic009G174600 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic006G103601--Sobic001G537600 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic006G103601--Sobic003G379500 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic006G103601--Sobic009G258150 Sobic004G199000 Sobic004G199000 Sobic001G261553--Sobic004G199000 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic001G261553--Sobic009G004000 Sobic001G261553--Sobic004G357066 Sobic001G261553--Sobic010G096801 Sobic001G261553--Sobic001G139600 Sobic005G232200 Sobic005G232200 Sobic001G261553--Sobic005G232200 Sobic002G140100 Sobic002G140100 Sobic001G261553--Sobic002G140100 Sobic001G261553--Sobic004G225450 Sobic001G261553--Sobic001G220200 Sobic003G239750 Sobic003G239750 Sobic006G109850--Sobic003G239750 Sobic006G109850--Sobic001G062400 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic006G109850--Sobic009G020800 Sobic006G109850--Sobic005G027032 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic006G109850--Sobic008G086100 Sobic006G109850--Sobic006G103601 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic006G109850--Sobic001G400101 Sobic006G109850--Sobic004G344301 Sobic007G165200 Sobic007G165200 Sobic006G109850--Sobic007G165200
Octagon: transcription factors


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