Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G204900.1
Synonym Sb05g025990
Functional annotation Lipase class 3 family protein (At) (PubMedID : 27208977)
lipase class 3 family protein, putative, expressed
UniProt C5Y7F3
Pfam PF01764
Panther DB PTHR21493 PTHR21493:SF147
NCBI CDD KOG2088; Predicted lipase/calmodulin-binding heat-shock protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006629; lipid metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G16070 : Mono-/di-acylglycerol lipase, N-terminal;Lipase, class 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g43760.1 : lipase class 3 family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ87432 , KQJ87433
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G191400 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
2 Sobic.001G513900 - -
3 Sobic.003G030200 phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
4 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G020800 - -
6 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
7 Sobic.010G150600 - -
8 Sobic.008G096300 - -
9 Sobic.001G400101 - -
10 Sobic.010G021401 - -
11 Sobic.001G312801 - -
12 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.002G387000 expressed protein -
14 Sobic.001G060200 - -
15 Sobic.002G360701 - -
16 Sobic.004G337700 expressed protein -
17 Sobic.003G082401 - -
18 Sobic.005G155001 - -
19 Sobic.004G190800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed K14413: beta-1,3-galactosyltransferase
20 Sobic.001G391800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic005G204900--Sobic001G191400 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic005G204900--Sobic001G513900 Sobic003G030200 Sobic003G030200 Sobic005G204900--Sobic003G030200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic005G204900--Sobic001G490600 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic005G204900--Sobic009G020800 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic005G204900--Sobic009G184500 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic005G204900--Sobic010G150600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic005G204900--Sobic008G096300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic005G204900--Sobic001G400101 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic001G191400--Sobic004G337700 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic001G191400--Sobic007G090406 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic001G191400--Sobic005G155001 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G191400--Sobic009G114900 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic001G191400--Sobic010G021401 Sobic001G191400--Sobic003G030200 Sobic001G191400--Sobic005G204900 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic001G191400--Sobic001G341900 Sobic001G191400--Sobic001G490600 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic001G513900--Sobic001G487250 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic001G513900--Sobic004G190800 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic001G513900--Sobic008G024700 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic001G513900--Sobic002G360701 Sobic001G513900--Sobic005G204900 Sobic001G513900--Sobic001G191400 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic001G513900--Sobic001G060200 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic001G513900--Sobic009G049100 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic001G513900--Sobic003G106100 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic003G030200--Sobic001G312801 Sobic003G030200--Sobic001G490600 Sobic009G147600 Sobic009G147600 Sobic003G030200--Sobic009G147600 Sobic003G030200--Sobic001G191400 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic003G030200--Sobic001G368000 Sobic003G030200--Sobic003G106100 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic003G030200--Sobic007G213500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic003G030200--Sobic007G017300 Sobic003G301950 Sobic003G301950 Sobic003G030200--Sobic003G301950 Sobic001G490600--Sobic009G184500 Sobic001G490600--Sobic001G368000 Sobic001G490600--Sobic007G017300 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic001G490600--Sobic009G004500 Sobic001G490600--Sobic001G312801 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic001G490600--Sobic008G185000 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G490600--Sobic009G170301 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic001G490600--Sobic001G483200 Sobic001G490600--Sobic005G155001 Sobic009G020800--Sobic001G400101 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic009G020800--Sobic006G109850 Sobic009G020800--Sobic005G204900 Sobic009G020800--Sobic008G096300 Sobic009G020800--Sobic010G150600 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic009G020800--Sobic009G188750 Sobic009G020800--Sobic001G490600 Sobic009G020800--Sobic009G184500 Sobic009G020800--Sobic001G487250 Sobic009G184500--Sobic001G490600 Sobic009G184500--Sobic007G017300 Sobic009G184500--Sobic001G368000 Sobic009G184500--Sobic009G004500 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic009G184500--Sobic004G288900 Sobic009G184500--Sobic002G360701 Sobic009G184500--Sobic010G150600 Sobic009G184500--Sobic001G483200 Sobic009G184500--Sobic005G155001 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic010G150600--Sobic008G096150 Sobic010G150600--Sobic009G184500 Sobic010G150600--Sobic010G021401 Sobic010G150600--Sobic005G155001 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic002G360701 Sobic010G150600--Sobic001G490600 Sobic003G082401 Sobic003G082401 Sobic010G150600--Sobic003G082401 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic010G150600--Sobic001G309000 Sobic008G096300--Sobic004G288900 Sobic008G096300--Sobic001G312801 Sobic008G096300--Sobic004G190800 Sobic008G096300--Sobic001G400101 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G096300--Sobic004G223350 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic008G096300--Sobic002G142350 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic008G096300--Sobic003G241600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic008G096300--Sobic008G086100 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic008G096300--Sobic002G413800 Sobic001G400101--Sobic009G184500 Sobic001G400101--Sobic001G490600 Sobic001G400101--Sobic009G020800 Sobic001G400101--Sobic008G096300 Sobic001G400101--Sobic010G150600 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic001G400101--Sobic010G060701 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G400101--Sobic009G144050 Sobic001G400101--Sobic009G170301 Sobic001G400101--Sobic004G288900
Octagon: transcription factors


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