Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G391800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QNL3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G159400 - -
2 Sobic.004G335200 - -
3 Sobic.004G337700 expressed protein -
4 Sobic.001G191400 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
5 Sobic.009G076000 - -
6 Sobic.002G358200 - -
7 Sobic.002G417201 - -
8 Sobic.004G302500 thylakoid lumenal protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G204900 Lipase class 3 family protein (At)(PubMedID : 27208977)@lipase class 3 family protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G043700 transferase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G054200 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.009G205900 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.006G046200 - -
14 Sobic.001G423000 expressed protein -
15 Sobic.010G220100 cell cycle control protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G185000 - -
17 Sobic.010G021401 - -
18 Sobic.006G140900 methyltransferase domain containing protein, putative, expressed K03183: demethylmenaquinone methyltransferase / 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase
19 Sobic.004G205400 - -
20 Sobic.001G435800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding EF hand family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic001G391800--Sobic003G159400 Sobic004G335200 Sobic004G335200 Sobic001G391800--Sobic004G335200 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic001G391800--Sobic004G337700 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic001G391800--Sobic001G191400 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic001G391800--Sobic009G076000 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic001G391800--Sobic002G358200 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic001G391800--Sobic002G417201 Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic001G391800--Sobic004G302500 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic001G391800--Sobic005G204900 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic003G159400--Sobic005G145700 Sobic003G159400--Sobic001G391800 Sobic003G159400--Sobic004G302500 Sobic002G104500 Sobic002G104500 Sobic003G159400--Sobic002G104500 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic003G159400--Sobic009G149600 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic003G159400--Sobic009G054200 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic003G159400--Sobic010G021401 Sobic001G435800 Sobic001G435800 Sobic003G159400--Sobic001G435800 Sobic003G159400--Sobic004G337700 Sobic004G335200--Sobic002G417201 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic004G335200--Sobic008G025800 Sobic006G046200 Sobic006G046200 Sobic004G335200--Sobic006G046200 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic004G335200--Sobic001G139750 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic004G335200--Sobic006G166601 Sobic004G335200--Sobic001G391800 Sobic004G335200--Sobic004G302500 Sobic006G140900 Sobic006G140900 Sobic004G335200--Sobic006G140900 Sobic010G254801 Sobic010G254801 Sobic004G335200--Sobic010G254801 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic004G337700--Sobic003G093500 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic004G337700--Sobic001G341900 Sobic002G006001 Sobic002G006001 Sobic004G337700--Sobic002G006001 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic004G337700--Sobic003G106100 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic004G337700--Sobic004G314100 Sobic004G337700--Sobic001G191400 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic004G337700--Sobic001G060200 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic004G337700--Sobic005G155001 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic004G337700--Sobic007G061500 Sobic001G191400--Sobic004G337700 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic001G191400--Sobic007G090406 Sobic001G191400--Sobic005G155001 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G191400--Sobic009G114900 Sobic001G191400--Sobic010G021401 Sobic003G030200 Sobic003G030200 Sobic001G191400--Sobic003G030200 Sobic001G191400--Sobic005G204900 Sobic001G191400--Sobic001G341900 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic001G191400--Sobic001G490600 Sobic009G076000--Sobic002G006001 Sobic009G205900 Sobic009G205900 Sobic009G076000--Sobic009G205900 Sobic009G076000--Sobic004G337700 Sobic009G076000--Sobic002G358200 Sobic009G076000--Sobic001G391800 Sobic009G076000--Sobic006G046200 Sobic003G416900 Sobic003G416900 Sobic009G076000--Sobic003G416900 Sobic009G064832 Sobic009G064832 Sobic009G076000--Sobic009G064832 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic009G076000--Sobic010G043700 Sobic002G358200--Sobic009G076000 Sobic002G358200--Sobic001G391800 Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic002G358200--Sobic001G033800 Sobic002G358200--Sobic002G006001 Sobic001G288200 Sobic001G288200 Sobic002G358200--Sobic001G288200 Sobic002G358200--Sobic006G046200 Sobic002G358200--Sobic010G043700 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic002G358200--Sobic009G036366 Sobic002G337500 Sobic002G337500 Sobic002G358200--Sobic002G337500 Sobic002G417201--Sobic004G335200 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic002G417201--Sobic008G096900 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic004G302500 Sobic002G417201--Sobic007G090406 Sobic002G417201--Sobic008G025800 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic002G417201--Sobic002G234900 Sobic002G417201--Sobic001G139750 Sobic004G302500--Sobic002G417201 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic004G302500--Sobic009G247100 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic004G302500--Sobic006G044866 Sobic004G302500--Sobic009G114900 Sobic004G302500--Sobic005G145700 Sobic004G302500--Sobic003G159400 Sobic004G302500--Sobic007G090406 Sobic001G423000 Sobic001G423000 Sobic004G302500--Sobic001G423000 Sobic004G302500--Sobic008G096900 Sobic005G204900--Sobic001G191400 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic005G204900--Sobic001G513900 Sobic005G204900--Sobic003G030200 Sobic005G204900--Sobic001G490600 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic005G204900--Sobic009G020800 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic005G204900--Sobic009G184500 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic005G204900--Sobic010G150600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic005G204900--Sobic008G096300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic005G204900--Sobic001G400101
Octagon: transcription factors


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