Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G046200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PK69
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G335200 - -
2 Sobic.009G076000 - -
3 Sobic.001G391800 - -
4 Sobic.002G358200 - -
5 Sobic.002G006001 - -
6 Sobic.009G205900 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.001G288200 lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.002G417201 - -
9 Sobic.001G423000 expressed protein -
10 Sobic.004G302500 thylakoid lumenal protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G416900 esterase, putative, expressed -
12 Sobic.004G337700 expressed protein -
13 Sobic.009G247100 OsSCP31 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09645: vitellogenic carboxypeptidase-like protein
14 Sobic.008G025800 - -
15 Sobic.003G209500 - -
16 Sobic.003G159400 - -
17 Sobic.001G191400 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
18 Sobic.006G166601 - -
19 Sobic.006G140900 methyltransferase domain containing protein, putative, expressed K03183: demethylmenaquinone methyltransferase / 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase
20 Sobic.003G119266 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G046200 Sobic006G046200 Sobic004G335200 Sobic004G335200 Sobic006G046200--Sobic004G335200 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic006G046200--Sobic009G076000 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic006G046200--Sobic001G391800 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic006G046200--Sobic002G358200 Sobic002G006001 Sobic002G006001 Sobic006G046200--Sobic002G006001 Sobic009G205900 Sobic009G205900 Sobic006G046200--Sobic009G205900 Sobic001G288200 Sobic001G288200 Sobic006G046200--Sobic001G288200 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic006G046200--Sobic002G417201 Sobic001G423000 Sobic001G423000 Sobic006G046200--Sobic001G423000 Sobic004G335200--Sobic002G417201 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic004G335200--Sobic008G025800 Sobic004G335200--Sobic006G046200 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic004G335200--Sobic001G139750 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic004G335200--Sobic006G166601 Sobic004G335200--Sobic001G391800 Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic004G335200--Sobic004G302500 Sobic006G140900 Sobic006G140900 Sobic004G335200--Sobic006G140900 Sobic010G254801 Sobic010G254801 Sobic004G335200--Sobic010G254801 Sobic009G076000--Sobic002G006001 Sobic009G076000--Sobic009G205900 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic009G076000--Sobic004G337700 Sobic009G076000--Sobic002G358200 Sobic009G076000--Sobic001G391800 Sobic009G076000--Sobic006G046200 Sobic003G416900 Sobic003G416900 Sobic009G076000--Sobic003G416900 Sobic009G064832 Sobic009G064832 Sobic009G076000--Sobic009G064832 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic009G076000--Sobic010G043700 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic001G391800--Sobic003G159400 Sobic001G391800--Sobic004G335200 Sobic001G391800--Sobic004G337700 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic001G391800--Sobic001G191400 Sobic001G391800--Sobic009G076000 Sobic001G391800--Sobic002G358200 Sobic001G391800--Sobic002G417201 Sobic001G391800--Sobic004G302500 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic001G391800--Sobic005G204900 Sobic002G358200--Sobic009G076000 Sobic002G358200--Sobic001G391800 Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic002G358200--Sobic001G033800 Sobic002G358200--Sobic002G006001 Sobic002G358200--Sobic001G288200 Sobic002G358200--Sobic006G046200 Sobic002G358200--Sobic010G043700 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic002G358200--Sobic009G036366 Sobic002G337500 Sobic002G337500 Sobic002G358200--Sobic002G337500 Sobic002G006001--Sobic003G416900 Sobic002G006001--Sobic004G337700 Sobic002G006001--Sobic009G076000 Sobic002G006001--Sobic009G205900 Sobic002G006001--Sobic010G043700 Sobic002G006001--Sobic001G288200 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic002G006001--Sobic001G341900 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic002G006001--Sobic003G093500 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic002G006001--Sobic004G224100 Sobic009G205900--Sobic009G076000 Sobic009G205900--Sobic002G006001 Sobic009G205900--Sobic004G337700 Sobic009G205900--Sobic001G423000 Sobic009G205900--Sobic003G416900 Sobic009G205900--Sobic001G391800 Sobic009G205900--Sobic010G043700 Sobic009G205900--Sobic006G046200 Sobic009G205900--Sobic001G191400 Sobic001G288200--Sobic002G006001 Sobic001G288200--Sobic003G416900 Sobic001G288200--Sobic002G358200 Sobic001G288200--Sobic006G046200 Sobic001G288200--Sobic004G337700 Sobic001G288200--Sobic009G036366 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic001G288200--Sobic006G151100 Sobic001G288200--Sobic009G205900 Sobic003G209500 Sobic003G209500 Sobic001G288200--Sobic003G209500 Sobic002G417201--Sobic004G335200 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic002G417201--Sobic008G096900 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic004G302500 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic002G417201--Sobic007G090406 Sobic002G417201--Sobic008G025800 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic002G417201--Sobic002G234900 Sobic002G417201--Sobic001G139750 Sobic001G423000--Sobic004G302500 Sobic001G423000--Sobic009G205900 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic001G423000--Sobic001G527900 Sobic001G423000--Sobic002G417201 Sobic001G423000--Sobic003G159400 Sobic001G423000--Sobic001G391800 Sobic001G423000--Sobic004G337700 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic001G423000--Sobic005G155001 Sobic001G423000--Sobic002G234900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.