Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G302500.1
Synonym Sb04g033580
Functional annotation thylakoid lumenal protein, putative, expressed
UniProt C5XS54
Pfam PF13599
Panther DB PTHR14136 PTHR14136:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G12250 : Pentapeptide repeat-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g42960.1 : thylakoid lumenal protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020965
Brachypodium KQK00526
Barley HORVU6Hr1G060810.6 , HORVU6Hr1G060810.1 , HORVU6Hr1G060810.3 , HORVU6Hr1G060810.5 , HORVU6Hr1G060810.4 , HORVU6Hr1G060810.2
Wheat TraesCS6D02G220500 , TraesCS6B02G286300 , TraesCS6A02G237800 , TraesCS6A02G237800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G302500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic004G302500--Sobic002G417201 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic004G302500--Sobic009G247100 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic004G302500--Sobic006G044866 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic004G302500--Sobic009G114900 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic004G302500--Sobic005G145700 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic004G302500--Sobic003G159400 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic004G302500--Sobic007G090406 Sobic001G423000 Sobic001G423000 Sobic004G302500--Sobic001G423000 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic004G302500--Sobic008G096900 Sobic004G335200 Sobic004G335200 Sobic002G417201--Sobic004G335200 Sobic002G417201--Sobic008G096900 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic005G076100 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic004G302500 Sobic002G417201--Sobic007G090406 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic002G417201--Sobic008G025800 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic002G417201--Sobic002G234900 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic002G417201--Sobic001G139750 Sobic009G247100--Sobic006G044866 Sobic009G247100--Sobic004G302500 Sobic001G353700 Sobic001G353700 Sobic009G247100--Sobic001G353700 Sobic001G501500 Sobic001G501500 Sobic009G247100--Sobic001G501500 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic009G247100--Sobic004G230500 Sobic001G344450 Sobic001G344450 Sobic009G247100--Sobic001G344450 Sobic009G247100--Sobic003G159400 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic009G247100--Sobic004G337700 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic009G247100--Sobic010G009532 Sobic006G044866--Sobic009G247100 Sobic006G044866--Sobic001G353700 Sobic006G044866--Sobic004G302500 Sobic006G044866--Sobic001G344450 Sobic006G044866--Sobic001G501500 Sobic006G044866--Sobic004G337700 Sobic006G044866--Sobic004G230500 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic006G044866--Sobic003G139100 Sobic008G120066 Sobic008G120066 Sobic006G044866--Sobic008G120066 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic009G114900--Sobic005G155001 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic009G114900--Sobic010G021401 Sobic009G114900--Sobic007G090406 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic009G114900--Sobic002G252700 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic009G114900--Sobic009G004500 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic009G114900--Sobic006G093400 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic009G114900--Sobic008G192800 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic009G114900--Sobic001G527900 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic009G114900--Sobic001G483200 Sobic005G145700--Sobic010G021401 Sobic005G145700--Sobic009G004500 Sobic005G145700--Sobic003G159400 Sobic005G145700--Sobic009G114900 Sobic006G260101 Sobic006G260101 Sobic005G145700--Sobic006G260101 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic005G145700--Sobic010G278400 Sobic001G435800 Sobic001G435800 Sobic005G145700--Sobic001G435800 Sobic005G145700--Sobic002G252700 Sobic005G145700--Sobic008G096900 Sobic003G159400--Sobic005G145700 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic003G159400--Sobic001G391800 Sobic003G159400--Sobic004G302500 Sobic002G104500 Sobic002G104500 Sobic003G159400--Sobic002G104500 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic003G159400--Sobic009G149600 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic003G159400--Sobic009G054200 Sobic003G159400--Sobic010G021401 Sobic003G159400--Sobic001G435800 Sobic003G159400--Sobic004G337700 Sobic007G090406--Sobic008G192800 Sobic007G090406--Sobic009G114900 Sobic007G090406--Sobic005G155001 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic007G090406--Sobic001G176800 Sobic007G090406--Sobic009G004500 Sobic007G090406--Sobic010G021401 Sobic006G280900 Sobic006G280900 Sobic007G090406--Sobic006G280900 Sobic009G083100 Sobic009G083100 Sobic007G090406--Sobic009G083100 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic007G090406--Sobic004G184500 Sobic001G423000--Sobic004G302500 Sobic009G205900 Sobic009G205900 Sobic001G423000--Sobic009G205900 Sobic001G423000--Sobic001G527900 Sobic001G423000--Sobic002G417201 Sobic001G423000--Sobic003G159400 Sobic001G423000--Sobic001G391800 Sobic001G423000--Sobic004G337700 Sobic001G423000--Sobic005G155001 Sobic001G423000--Sobic002G234900 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic008G096900--Sobic006G037000 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic008G096900--Sobic007G174100 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic008G096900--Sobic010G257300 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic008G096900--Sobic001G537600 Sobic008G096900--Sobic005G076100 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic008G096900--Sobic004G012100 Sobic010G253700 Sobic010G253700 Sobic008G096900--Sobic010G253700 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic008G096900--Sobic009G031300 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic008G096900--Sobic002G326200
Octagon: transcription factors


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