Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G423000.2
Synonym Sb01g039770
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WQ15
Pfam -
Panther DB PTHR36735 PTHR36735:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29180 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g16470.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016711
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G060140.5 , HORVU4Hr1G060140.4
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G423000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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4 Sobic.002G417201 - -
5 Sobic.003G159400 - -
6 Sobic.001G391800 - -
7 Sobic.004G337700 expressed protein -
8 Sobic.005G155001 - -
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11 Sobic.004G335200 - -
12 Sobic.001G435800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding EF hand family protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G021401 - -
14 Sobic.009G114900 - -
15 Sobic.009G004500 expressed protein -
16 Sobic.003G178400 - -
17 Sobic.007G090406 - -
18 Sobic.010G097800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.002G314950 - -
20 Sobic.001G060200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G423000 Sobic001G423000 Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic001G423000--Sobic004G302500 Sobic009G205900 Sobic009G205900 Sobic001G423000--Sobic009G205900 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic001G423000--Sobic001G527900 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic001G423000--Sobic002G417201 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic001G423000--Sobic003G159400 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic001G423000--Sobic001G391800 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic001G423000--Sobic004G337700 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic001G423000--Sobic005G155001 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic001G423000--Sobic002G234900 Sobic004G302500--Sobic002G417201 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic004G302500--Sobic009G247100 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic004G302500--Sobic006G044866 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic004G302500--Sobic009G114900 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic004G302500--Sobic005G145700 Sobic004G302500--Sobic003G159400 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic004G302500--Sobic007G090406 Sobic004G302500--Sobic001G423000 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic004G302500--Sobic008G096900 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic009G205900--Sobic009G076000 Sobic002G006001 Sobic002G006001 Sobic009G205900--Sobic002G006001 Sobic009G205900--Sobic004G337700 Sobic009G205900--Sobic001G423000 Sobic003G416900 Sobic003G416900 Sobic009G205900--Sobic003G416900 Sobic009G205900--Sobic001G391800 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic009G205900--Sobic010G043700 Sobic006G046200 Sobic006G046200 Sobic009G205900--Sobic006G046200 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic009G205900--Sobic001G191400 Sobic001G527900--Sobic005G155001 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic001G527900--Sobic001G483200 Sobic001G527900--Sobic009G114900 Sobic002G314950 Sobic002G314950 Sobic001G527900--Sobic002G314950 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic001G527900--Sobic009G004500 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic001G527900--Sobic010G021401 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic001G527900--Sobic001G060200 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic001G527900--Sobic007G017300 Sobic001G527900--Sobic007G090406 Sobic004G335200 Sobic004G335200 Sobic002G417201--Sobic004G335200 Sobic002G417201--Sobic008G096900 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic005G076100 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic004G302500 Sobic002G417201--Sobic007G090406 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic002G417201--Sobic008G025800 Sobic002G417201--Sobic002G234900 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic002G417201--Sobic001G139750 Sobic003G159400--Sobic005G145700 Sobic003G159400--Sobic001G391800 Sobic003G159400--Sobic004G302500 Sobic002G104500 Sobic002G104500 Sobic003G159400--Sobic002G104500 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic003G159400--Sobic009G149600 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic003G159400--Sobic009G054200 Sobic003G159400--Sobic010G021401 Sobic001G435800 Sobic001G435800 Sobic003G159400--Sobic001G435800 Sobic003G159400--Sobic004G337700 Sobic001G391800--Sobic003G159400 Sobic001G391800--Sobic004G335200 Sobic001G391800--Sobic004G337700 Sobic001G391800--Sobic001G191400 Sobic001G391800--Sobic009G076000 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic001G391800--Sobic002G358200 Sobic001G391800--Sobic002G417201 Sobic001G391800--Sobic004G302500 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic001G391800--Sobic005G204900 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic004G337700--Sobic003G093500 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic004G337700--Sobic001G341900 Sobic004G337700--Sobic002G006001 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic004G337700--Sobic003G106100 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic004G337700--Sobic004G314100 Sobic004G337700--Sobic001G191400 Sobic004G337700--Sobic001G060200 Sobic004G337700--Sobic005G155001 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic004G337700--Sobic007G061500 Sobic005G155001--Sobic001G483200 Sobic005G155001--Sobic009G114900 Sobic005G155001--Sobic009G004500 Sobic005G155001--Sobic007G017300 Sobic005G155001--Sobic010G021401 Sobic005G155001--Sobic001G527900 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic005G155001--Sobic001G368000 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic005G155001--Sobic008G185000 Sobic005G155001--Sobic007G090406 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic002G234900--Sobic008G096150 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic002G234900--Sobic003G178400 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic002G234900--Sobic007G174100 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic002G234900--Sobic010G150600 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic002G234900--Sobic004G160950 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic002G234900--Sobic001G309000 Sobic002G234900--Sobic002G417201 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic002G234900--Sobic007G157200 Sobic010G191200 Sobic010G191200 Sobic002G234900--Sobic010G191200
Octagon: transcription factors


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