Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G234900.1
Synonym NQR
Functional annotation zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2, putative, expressed
UniProt A0A1B6QD29
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G49670 : ARP protein (REF)
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g28570.1 : zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G096150 - -
2 Sobic.003G178400 - -
3 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
4 Sobic.010G150600 - -
5 Sobic.004G160950 - -
6 Sobic.001G309000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
7 Sobic.002G417201 - -
8 Sobic.007G157200 - -
9 Sobic.010G191200 - -
10 Sobic.003G279600 - -
11 Sobic.006G019901 - -
12 Sobic.009G242032 - -
13 Sobic.010G097800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
14 Sobic.001G212701 - -
15 Sobic.010G021401 - -
16 Sobic.008G096900 protein of unknown function DUF502 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G119266 - -
18 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G145700 - -
20 Sobic.010G132300 CDK5RAP3, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic002G234900--Sobic008G096150 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic002G234900--Sobic003G178400 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic002G234900--Sobic007G174100 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic002G234900--Sobic010G150600 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic002G234900--Sobic004G160950 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic002G234900--Sobic001G309000 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic002G234900--Sobic002G417201 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic002G234900--Sobic007G157200 Sobic010G191200 Sobic010G191200 Sobic002G234900--Sobic010G191200 Sobic008G096150--Sobic007G174100 Sobic008G096150--Sobic010G150600 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic008G096150--Sobic001G523300 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic008G096150--Sobic002G326200 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic008G096150--Sobic001G212701 Sobic008G096150--Sobic002G234900 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic008G096150--Sobic009G031300 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic008G096150--Sobic010G200800 Sobic008G096150--Sobic001G309000 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic003G178400--Sobic003G279600 Sobic003G178400--Sobic004G160950 Sobic003G119266 Sobic003G119266 Sobic003G178400--Sobic003G119266 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic003G178400--Sobic002G188100 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic003G178400--Sobic004G069600 Sobic003G178400--Sobic002G234900 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic003G178400--Sobic006G167200 Sobic003G178400--Sobic001G309000 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic003G178400--Sobic006G133650 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic007G174100--Sobic003G008850 Sobic010G150600--Sobic008G096150 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic010G150600--Sobic009G184500 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic010G150600--Sobic010G021401 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic010G150600--Sobic005G155001 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic010G150600--Sobic009G004300 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic010G150600--Sobic002G360701 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic010G150600--Sobic001G490600 Sobic003G082401 Sobic003G082401 Sobic010G150600--Sobic003G082401 Sobic010G150600--Sobic001G309000 Sobic004G160950--Sobic010G132300 Sobic004G160950--Sobic007G174100 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic003G279600 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic004G160950--Sobic008G020300 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic003G149900 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic006G019901 Sobic004G160950--Sobic003G008850 Sobic001G309000--Sobic003G279600 Sobic001G309000--Sobic004G160950 Sobic001G309000--Sobic008G096150 Sobic001G309000--Sobic001G212701 Sobic001G309000--Sobic007G174100 Sobic001G309000--Sobic003G178400 Sobic001G309000--Sobic010G132300 Sobic010G055600 Sobic010G055600 Sobic001G309000--Sobic010G055600 Sobic006G110600 Sobic006G110600 Sobic001G309000--Sobic006G110600 Sobic004G335200 Sobic004G335200 Sobic002G417201--Sobic004G335200 Sobic002G417201--Sobic008G096900 Sobic002G417201--Sobic005G076100 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic006G166601 Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic002G417201--Sobic004G302500 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic002G417201--Sobic007G090406 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic002G417201--Sobic008G025800 Sobic002G417201--Sobic002G234900 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic002G417201--Sobic001G139750 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic001G212701 Sobic007G157200--Sobic003G279600 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic007G157200--Sobic004G184500 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic007G157200--Sobic002G114600 Sobic007G157200--Sobic010G132300 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic007G157200--Sobic001G176800 Sobic007G157200--Sobic009G184500 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic007G157200--Sobic002G018133 Sobic010G191200--Sobic003G178400 Sobic010G191200--Sobic002G234900 Sobic010G191200--Sobic003G279600 Sobic002G396900 Sobic002G396900 Sobic010G191200--Sobic002G396900 Sobic010G191200--Sobic002G188100 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic010G191200--Sobic010G040000 Sobic010G191200--Sobic004G160950 Sobic010G191200--Sobic006G133650 Sobic010G191200--Sobic002G231800
Octagon: transcription factors


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