Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G191200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YK76
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G178400 - -
2 Sobic.002G234900 zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2, putative, expressed -
3 Sobic.003G279600 - -
4 Sobic.002G396900 csAtPR5, putative, expressed -
5 Sobic.002G188100 - -
6 Sobic.010G040000 expressed protein -
7 Sobic.004G160950 - -
8 Sobic.006G133650 - -
9 Sobic.002G231800 purine permease, putative, expressed -
10 Sobic.001G309000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
11 Sobic.006G019901 - -
12 Sobic.009G031300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G096150 - -
14 Sobic.010G249500 CGMC_MAPKCMGC_2_SLT2y_ERK.2 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
15 Sobic.003G075901 - -
16 Sobic.001G523300 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G039400 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G069600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G061700 expressed protein -
20 Sobic.006G167200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G191200 Sobic010G191200 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic010G191200--Sobic003G178400 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic010G191200--Sobic002G234900 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic010G191200--Sobic003G279600 Sobic002G396900 Sobic002G396900 Sobic010G191200--Sobic002G396900 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic010G191200--Sobic002G188100 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic010G191200--Sobic010G040000 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic010G191200--Sobic004G160950 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic010G191200--Sobic006G133650 Sobic002G231800 Sobic002G231800 Sobic010G191200--Sobic002G231800 Sobic003G178400--Sobic003G279600 Sobic003G178400--Sobic004G160950 Sobic003G119266 Sobic003G119266 Sobic003G178400--Sobic003G119266 Sobic003G178400--Sobic002G188100 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic003G178400--Sobic004G069600 Sobic003G178400--Sobic002G234900 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic003G178400--Sobic006G167200 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic003G178400--Sobic001G309000 Sobic003G178400--Sobic006G133650 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic002G234900--Sobic008G096150 Sobic002G234900--Sobic003G178400 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic002G234900--Sobic007G174100 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic002G234900--Sobic010G150600 Sobic002G234900--Sobic004G160950 Sobic002G234900--Sobic001G309000 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic002G234900--Sobic002G417201 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic002G234900--Sobic007G157200 Sobic002G234900--Sobic010G191200 Sobic003G279600--Sobic003G178400 Sobic003G279600--Sobic004G160950 Sobic003G279600--Sobic001G309000 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic003G279600--Sobic002G284701 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic003G279600--Sobic010G132300 Sobic003G279600--Sobic007G157200 Sobic003G279600--Sobic002G188100 Sobic003G279600--Sobic004G069600 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic003G279600--Sobic001G212701 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic002G396900--Sobic009G031300 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic002G396900--Sobic001G523300 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic002G396900--Sobic006G037000 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic002G396900--Sobic010G200800 Sobic003G406240 Sobic003G406240 Sobic002G396900--Sobic003G406240 Sobic002G396900--Sobic002G231800 Sobic002G396900--Sobic008G096150 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic002G396900--Sobic003G149900 Sobic002G396900--Sobic007G174100 Sobic002G188100--Sobic006G133650 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic002G188100--Sobic010G045300 Sobic002G188100--Sobic006G167200 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic002G188100--Sobic009G039400 Sobic002G188100--Sobic010G040000 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic002G188100--Sobic010G029200 Sobic002G188100--Sobic004G069600 Sobic010G122533 Sobic010G122533 Sobic002G188100--Sobic010G122533 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic002G188100--Sobic003G081400 Sobic010G040000--Sobic002G188100 Sobic010G040000--Sobic006G167200 Sobic010G040000--Sobic009G039400 Sobic006G178700 Sobic006G178700 Sobic010G040000--Sobic006G178700 Sobic010G040000--Sobic006G133650 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic010G040000--Sobic006G019901 Sobic010G040000--Sobic010G045300 Sobic010G040000--Sobic002G231800 Sobic010G040000--Sobic003G081400 Sobic004G160950--Sobic010G132300 Sobic004G160950--Sobic007G174100 Sobic004G160950--Sobic002G231800 Sobic004G160950--Sobic003G279600 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic004G160950--Sobic008G020300 Sobic004G160950--Sobic002G284701 Sobic004G160950--Sobic003G149900 Sobic004G160950--Sobic006G019901 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic004G160950--Sobic003G008850 Sobic006G133650--Sobic009G039400 Sobic006G133650--Sobic002G188100 Sobic006G133650--Sobic010G029200 Sobic006G133650--Sobic006G167200 Sobic006G133650--Sobic004G069600 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic006G133650--Sobic010G208300 Sobic006G133650--Sobic010G045300 Sobic006G133650--Sobic010G122533 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic006G133650--Sobic003G142900 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic002G231800--Sobic003G109400 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic002G231800--Sobic004G354800 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic002G231800--Sobic001G537900 Sobic002G231800--Sobic008G020300 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic002G231800--Sobic007G001300 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic002G231800--Sobic002G156300 Sobic002G231800--Sobic006G019901 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic002G231800--Sobic010G114400 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic002G231800--Sobic009G127600
Octagon: transcription factors


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