Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G061700.1
Synonym Sb09g005160
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z139
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g07620.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G075901 - -
2 Sobic.009G223700 - -
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12 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
13 Sobic.002G285525 - -
14 Sobic.008G136900 expressed protein -
15 Sobic.006G169300 - -
16 Sobic.008G023000 expressed protein -
17 Sobic.001G179680 - -
18 Sobic.001G527400 - -
19 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
20 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G061700 Sobic009G061700 Sobic003G075901 Sobic003G075901 Sobic009G061700--Sobic003G075901 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic009G061700--Sobic009G223700 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic009G061700--Sobic004G108900 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic009G061700--Sobic001G483700 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic009G061700--Sobic002G121701 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic009G061700--Sobic008G134000 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic009G061700--Sobic003G290700 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic009G061700--Sobic001G457100 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G061700--Sobic004G226300 Sobic003G075901--Sobic009G061700 Sobic003G075901--Sobic008G134000 Sobic003G075901--Sobic004G108900 Sobic003G075901--Sobic009G223700 Sobic010G113800 Sobic010G113800 Sobic003G075901--Sobic010G113800 Sobic003G075901--Sobic002G121701 Sobic003G075901--Sobic001G457100 Sobic003G075901--Sobic001G483700 Sobic003G075901--Sobic003G290700 Sobic009G223700--Sobic001G457100 Sobic009G223700--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic009G223700--Sobic007G183000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic009G223700--Sobic002G048250 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic009G223700--Sobic002G285525 Sobic009G223700--Sobic003G290700 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic009G223700--Sobic006G169300 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic009G223700--Sobic001G527400 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic009G223700--Sobic004G347866 Sobic004G108900--Sobic006G169300 Sobic004G108900--Sobic009G223700 Sobic004G108900--Sobic008G134000 Sobic004G108900--Sobic009G061700 Sobic004G108900--Sobic002G285525 Sobic004G128800 Sobic004G128800 Sobic004G108900--Sobic004G128800 Sobic004G108900--Sobic001G457100 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic004G108900--Sobic004G224300 Sobic004G108900--Sobic002G121701 Sobic001G483700--Sobic004G226300 Sobic001G483700--Sobic007G183000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic001G483700--Sobic005G209800 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic001G483700--Sobic001G137200 Sobic001G483700--Sobic002G285525 Sobic001G483700--Sobic001G527400 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic001G483700--Sobic008G002100 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic001G483700--Sobic003G104900 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic001G483700--Sobic008G023000 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic002G121701--Sobic003G337700 Sobic002G121701--Sobic009G223700 Sobic002G121701--Sobic001G457100 Sobic002G121701--Sobic004G224300 Sobic002G120250 Sobic002G120250 Sobic002G121701--Sobic002G120250 Sobic002G121701--Sobic003G290700 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic002G121701--Sobic001G179680 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic002G121701--Sobic008G144100 Sobic002G121701--Sobic009G061700 Sobic008G134000--Sobic004G108900 Sobic008G134000--Sobic003G075901 Sobic008G134000--Sobic009G061700 Sobic008G134000--Sobic002G121701 Sobic008G134000--Sobic008G144100 Sobic008G134000--Sobic009G223700 Sobic008G134000--Sobic006G169300 Sobic008G134000--Sobic001G457100 Sobic001G399501 Sobic001G399501 Sobic008G134000--Sobic001G399501 Sobic003G290700--Sobic002G285525 Sobic003G290700--Sobic004G226300 Sobic003G290700--Sobic007G183000 Sobic003G290700--Sobic001G527400 Sobic003G290700--Sobic008G023000 Sobic003G290700--Sobic002G048250 Sobic003G290700--Sobic008G002100 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic003G290700--Sobic005G231800 Sobic003G290700--Sobic005G209800 Sobic001G457100--Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic004G347866 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G226300 Sobic001G457100--Sobic002G048250 Sobic001G457100--Sobic007G183000 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic005G231800 Sobic001G457100--Sobic003G290700 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic004G226300--Sobic003G173032
Octagon: transcription factors


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