Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G108900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YNZ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G169300 - -
2 Sobic.009G223700 - -
3 Sobic.008G134000 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G061700 expressed protein -
5 Sobic.002G285525 - -
6 Sobic.004G128800 FAD-binding and arabino-lactone oxidase domains containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G457100 - -
8 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
9 Sobic.002G121701 - -
10 Sobic.010G002850 - -
11 Sobic.003G075901 - -
12 Sobic.004G226300 expressed protein -
13 Sobic.003G290700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.001G483700 Cupin domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G179680 - -
17 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
18 Sobic.002G048250 - -
19 Sobic.008G023000 expressed protein -
20 Sobic.001G527400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic004G108900--Sobic006G169300 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic004G108900--Sobic009G223700 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic004G108900--Sobic008G134000 Sobic009G061700 Sobic009G061700 Sobic004G108900--Sobic009G061700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic004G108900--Sobic002G285525 Sobic004G128800 Sobic004G128800 Sobic004G108900--Sobic004G128800 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic004G108900--Sobic001G457100 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic004G108900--Sobic004G224300 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic004G108900--Sobic002G121701 Sobic006G169300--Sobic009G223700 Sobic006G169300--Sobic002G285525 Sobic006G169300--Sobic004G224300 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G169300--Sobic010G002850 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic006G169300--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic006G169300--Sobic007G183000 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic006G169300--Sobic006G171000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic006G169300--Sobic001G527400 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic006G169300--Sobic002G048250 Sobic009G223700--Sobic001G457100 Sobic009G223700--Sobic004G226300 Sobic009G223700--Sobic007G183000 Sobic009G223700--Sobic002G048250 Sobic009G223700--Sobic002G285525 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic009G223700--Sobic003G290700 Sobic009G223700--Sobic006G169300 Sobic009G223700--Sobic001G527400 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic009G223700--Sobic004G347866 Sobic008G134000--Sobic004G108900 Sobic003G075901 Sobic003G075901 Sobic008G134000--Sobic003G075901 Sobic008G134000--Sobic009G061700 Sobic008G134000--Sobic002G121701 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic008G134000--Sobic008G144100 Sobic008G134000--Sobic009G223700 Sobic008G134000--Sobic006G169300 Sobic008G134000--Sobic001G457100 Sobic001G399501 Sobic001G399501 Sobic008G134000--Sobic001G399501 Sobic009G061700--Sobic003G075901 Sobic009G061700--Sobic009G223700 Sobic009G061700--Sobic004G108900 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic009G061700--Sobic001G483700 Sobic009G061700--Sobic002G121701 Sobic009G061700--Sobic008G134000 Sobic009G061700--Sobic003G290700 Sobic009G061700--Sobic001G457100 Sobic009G061700--Sobic004G226300 Sobic002G285525--Sobic007G183000 Sobic002G285525--Sobic001G527400 Sobic002G285525--Sobic004G226300 Sobic002G285525--Sobic003G290700 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic002G285525--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic002G285525--Sobic008G002100 Sobic002G285525--Sobic002G048250 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic002G285525--Sobic005G209800 Sobic002G285525--Sobic004G224300 Sobic004G128800--Sobic006G169300 Sobic004G128800--Sobic009G223700 Sobic004G128800--Sobic001G457100 Sobic004G128800--Sobic001G483700 Sobic004G128800--Sobic002G285525 Sobic004G128800--Sobic010G002850 Sobic004G128800--Sobic004G108900 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic004G128800--Sobic009G028600 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic004G128800--Sobic001G137200 Sobic001G457100--Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic004G347866 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G226300 Sobic001G457100--Sobic002G048250 Sobic001G457100--Sobic007G183000 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic007G157550 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic001G457100--Sobic005G231800 Sobic001G457100--Sobic003G290700 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800 Sobic002G121701--Sobic003G337700 Sobic002G121701--Sobic009G223700 Sobic002G121701--Sobic001G457100 Sobic002G121701--Sobic004G224300 Sobic002G120250 Sobic002G120250 Sobic002G121701--Sobic002G120250 Sobic002G121701--Sobic003G290700 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic002G121701--Sobic001G179680 Sobic002G121701--Sobic008G144100 Sobic002G121701--Sobic009G061700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.