Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G285525.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W639
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31175
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G29500 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37394.1 : OsSAUR44 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014497 , Zm00025a014495
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G527400 - -
3 Sobic.004G226300 expressed protein -
4 Sobic.003G290700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.008G023000 expressed protein -
6 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
7 Sobic.002G048250 - -
8 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
9 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
10 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
11 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
12 Sobic.003G173032 - -
13 Sobic.001G137200 homeobox domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G223700 - -
15 Sobic.010G002850 - -
16 Sobic.006G169300 - -
17 Sobic.001G483700 Cupin domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G089700 - -
19 Sobic.004G347866 - -
20 Sobic.002G173600 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic002G285525--Sobic007G183000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic002G285525--Sobic001G527400 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic002G285525--Sobic004G226300 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic002G285525--Sobic003G290700 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic002G285525--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic002G285525--Sobic008G002100 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic002G285525--Sobic002G048250 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic002G285525--Sobic005G209800 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G285525--Sobic004G224300 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic001G527400--Sobic008G023000 Sobic001G527400--Sobic008G002100 Sobic001G527400--Sobic007G183000 Sobic001G527400--Sobic004G226300 Sobic001G527400--Sobic002G048250 Sobic001G527400--Sobic005G209800 Sobic001G527400--Sobic005G231800 Sobic001G527400--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032 Sobic003G290700--Sobic002G285525 Sobic003G290700--Sobic004G226300 Sobic003G290700--Sobic007G183000 Sobic003G290700--Sobic001G527400 Sobic003G290700--Sobic008G023000 Sobic003G290700--Sobic002G048250 Sobic003G290700--Sobic008G002100 Sobic003G290700--Sobic005G231800 Sobic003G290700--Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic008G002100 Sobic008G023000--Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic007G183000 Sobic008G023000--Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic004G226300 Sobic008G023000--Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic002G048250 Sobic008G023000--Sobic006G171000 Sobic008G002100--Sobic008G023000 Sobic008G002100--Sobic001G527400 Sobic008G002100--Sobic005G209800 Sobic008G002100--Sobic007G183000 Sobic008G002100--Sobic004G226300 Sobic008G002100--Sobic005G231800 Sobic008G002100--Sobic003G173032 Sobic008G002100--Sobic002G048250 Sobic008G002100--Sobic006G171000 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic005G209800--Sobic008G002100 Sobic005G209800--Sobic008G023000 Sobic005G209800--Sobic001G527400 Sobic005G209800--Sobic007G183000 Sobic005G209800--Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic005G231800 Sobic005G209800--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic003G173032 Sobic005G209800--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800
Octagon: transcription factors


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