Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G023000.1
Synonym Sb08g002040
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YR31
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g38360.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
2 Sobic.001G527400 - -
3 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
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8 Sobic.002G048250 - -
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13 Sobic.004G089700 - -
14 Sobic.003G337700 WRKY20, expressed -
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18 Sobic.009G223700 - -
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Gene co-expression network
sample Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic008G023000--Sobic008G002100 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic001G527400 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic008G023000--Sobic007G183000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic005G209800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic008G023000--Sobic004G226300 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic003G173032 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic005G231800 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic008G023000--Sobic002G048250 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic008G023000--Sobic006G171000 Sobic008G002100--Sobic008G023000 Sobic008G002100--Sobic001G527400 Sobic008G002100--Sobic005G209800 Sobic008G002100--Sobic007G183000 Sobic008G002100--Sobic004G226300 Sobic008G002100--Sobic005G231800 Sobic008G002100--Sobic003G173032 Sobic008G002100--Sobic002G048250 Sobic008G002100--Sobic006G171000 Sobic001G527400--Sobic008G023000 Sobic001G527400--Sobic008G002100 Sobic001G527400--Sobic007G183000 Sobic001G527400--Sobic004G226300 Sobic001G527400--Sobic002G048250 Sobic001G527400--Sobic005G209800 Sobic001G527400--Sobic005G231800 Sobic001G527400--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic006G171000 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic008G002100 Sobic005G209800--Sobic008G023000 Sobic005G209800--Sobic001G527400 Sobic005G209800--Sobic007G183000 Sobic005G209800--Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic005G231800 Sobic005G209800--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic003G173032 Sobic005G209800--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032 Sobic003G173032--Sobic008G023000 Sobic003G173032--Sobic008G002100 Sobic003G173032--Sobic001G527400 Sobic003G173032--Sobic007G183000 Sobic003G173032--Sobic004G226300 Sobic003G173032--Sobic005G209800 Sobic003G173032--Sobic005G231800 Sobic003G173032--Sobic002G048250 Sobic003G173032--Sobic006G171000 Sobic005G231800--Sobic008G023000 Sobic005G231800--Sobic001G527400 Sobic005G231800--Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic007G183000 Sobic005G231800--Sobic004G226300 Sobic005G231800--Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic002G048250 Sobic005G231800--Sobic003G173032 Sobic005G231800--Sobic006G171000 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic006G171000--Sobic008G023000 Sobic006G171000--Sobic004G226300 Sobic006G171000--Sobic008G002100 Sobic006G171000--Sobic007G183000 Sobic006G171000--Sobic001G527400 Sobic006G171000--Sobic005G209800 Sobic006G171000--Sobic005G231800 Sobic006G171000--Sobic003G173032 Sobic006G171000--Sobic002G048250
Octagon: transcription factors


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