Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G183000.1
Synonym Sb07g025320
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RBF9
Pfam PF00010
Panther DB PTHR11514 PTHR11514:SF41
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17880 : Basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g34330.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003465 , Zm00025a027847 , Zm00025a051819
Brachypodium KQK09396
Barley HORVU3Hr1G066390.1 , HORVU1Hr1G050560.1 , HORVU1Hr1G050560.2
Wheat TraesCS3B02G288700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G226300 expressed protein -
2 Sobic.001G527400 - -
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20 Sobic.001G483700 Cupin domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic008G023000 Sobic001G527400--Sobic008G002100 Sobic001G527400--Sobic007G183000 Sobic001G527400--Sobic004G226300 Sobic001G527400--Sobic002G048250 Sobic001G527400--Sobic005G209800 Sobic001G527400--Sobic005G231800 Sobic001G527400--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic006G171000 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic008G023000--Sobic008G002100 Sobic008G023000--Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic007G183000 Sobic008G023000--Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic004G226300 Sobic008G023000--Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic002G048250 Sobic008G023000--Sobic006G171000 Sobic008G002100--Sobic008G023000 Sobic008G002100--Sobic001G527400 Sobic008G002100--Sobic005G209800 Sobic008G002100--Sobic007G183000 Sobic008G002100--Sobic004G226300 Sobic008G002100--Sobic005G231800 Sobic008G002100--Sobic003G173032 Sobic008G002100--Sobic002G048250 Sobic008G002100--Sobic006G171000 Sobic005G231800--Sobic008G023000 Sobic005G231800--Sobic001G527400 Sobic005G231800--Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic007G183000 Sobic005G231800--Sobic004G226300 Sobic005G231800--Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic002G048250 Sobic005G231800--Sobic003G173032 Sobic005G231800--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic008G002100 Sobic005G209800--Sobic008G023000 Sobic005G209800--Sobic001G527400 Sobic005G209800--Sobic007G183000 Sobic005G209800--Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic005G231800 Sobic005G209800--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic003G173032 Sobic005G209800--Sobic002G048250 Sobic003G173032--Sobic008G023000 Sobic003G173032--Sobic008G002100 Sobic003G173032--Sobic001G527400 Sobic003G173032--Sobic007G183000 Sobic003G173032--Sobic004G226300 Sobic003G173032--Sobic005G209800 Sobic003G173032--Sobic005G231800 Sobic003G173032--Sobic002G048250 Sobic003G173032--Sobic006G171000 Sobic006G171000--Sobic008G023000 Sobic006G171000--Sobic004G226300 Sobic006G171000--Sobic008G002100 Sobic006G171000--Sobic007G183000 Sobic006G171000--Sobic001G527400 Sobic006G171000--Sobic005G209800 Sobic006G171000--Sobic005G231800 Sobic006G171000--Sobic003G173032 Sobic006G171000--Sobic002G048250
Octagon: transcription factors


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