Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G179680.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S676
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G078850 - K14514: ethylene-insensitive protein 3
2 Sobic.002G048250 - -
3 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
4 Sobic.004G347866 - -
5 Sobic.007G157550 - -
6 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G223700 - -
8 Sobic.001G457100 - -
9 Sobic.004G226300 expressed protein -
10 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
11 Sobic.001G527400 - -
12 Sobic.004G089700 - -
13 Sobic.008G023000 expressed protein -
14 Sobic.003G337700 WRKY20, expressed -
15 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
16 Sobic.003G290700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
18 Sobic.002G285525 - -
19 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
20 Sobic.003G173032 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic002G078850 Sobic002G078850 Sobic001G179680--Sobic002G078850 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic001G179680--Sobic002G048250 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic001G179680--Sobic004G224300 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic001G179680--Sobic004G347866 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic001G179680--Sobic007G157550 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic001G179680--Sobic007G183000 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic001G179680--Sobic009G223700 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic001G179680--Sobic001G457100 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic001G179680--Sobic004G226300 Sobic002G078850--Sobic001G179680 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic002G078850--Sobic004G107400 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic002G078850--Sobic006G171000 Sobic002G078850--Sobic002G048250 Sobic002G078850--Sobic007G183000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic002G078850--Sobic001G527400 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic002G078850--Sobic008G023000 Sobic002G078850--Sobic004G226300 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic002G078850--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800 Sobic004G347866--Sobic007G157550 Sobic004G347866--Sobic002G048250 Sobic004G347866--Sobic007G183000 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic004G347866--Sobic004G089700 Sobic004G347866--Sobic001G457100 Sobic004G347866--Sobic004G226300 Sobic004G347866--Sobic009G223700 Sobic004G347866--Sobic001G527400 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic004G347866--Sobic002G339250 Sobic007G157550--Sobic004G347866 Sobic007G157550--Sobic002G048250 Sobic007G157550--Sobic001G457100 Sobic007G157550--Sobic004G089700 Sobic007G157550--Sobic007G183000 Sobic007G157550--Sobic009G223700 Sobic007G157550--Sobic001G179680 Sobic007G157550--Sobic002G339250 Sobic007G157550--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic009G223700--Sobic001G457100 Sobic009G223700--Sobic004G226300 Sobic009G223700--Sobic007G183000 Sobic009G223700--Sobic002G048250 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic009G223700--Sobic002G285525 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic009G223700--Sobic003G290700 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic009G223700--Sobic006G169300 Sobic009G223700--Sobic001G527400 Sobic009G223700--Sobic004G347866 Sobic001G457100--Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic004G347866 Sobic001G457100--Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G226300 Sobic001G457100--Sobic002G048250 Sobic001G457100--Sobic007G183000 Sobic001G457100--Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic005G231800 Sobic001G457100--Sobic003G290700 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.