Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G103400.1
Synonym Sb01g009230
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
FHA domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S539
Pfam PF00498
Panther DB PTHR23308 PTHR23308:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G14490 : SMAD/FHA domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g51870.1 : FHA domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016878 , Zm00025a008010
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G103400 Sobic001G103400 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic001G103400--Sobic003G290700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic001G103400--Sobic002G285525 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic001G103400--Sobic009G223700 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic001G103400--Sobic003G142900 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic001G103400--Sobic001G483700 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic001G103400--Sobic009G028600 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic001G103400--Sobic004G226300 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic001G103400--Sobic001G137200 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic001G103400--Sobic006G171000 Sobic003G290700--Sobic002G285525 Sobic003G290700--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic003G290700--Sobic007G183000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic003G290700--Sobic001G527400 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic003G290700--Sobic008G023000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic003G290700--Sobic002G048250 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic003G290700--Sobic008G002100 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic003G290700--Sobic005G231800 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic003G290700--Sobic005G209800 Sobic002G285525--Sobic007G183000 Sobic002G285525--Sobic001G527400 Sobic002G285525--Sobic004G226300 Sobic002G285525--Sobic003G290700 Sobic002G285525--Sobic008G023000 Sobic002G285525--Sobic008G002100 Sobic002G285525--Sobic002G048250 Sobic002G285525--Sobic005G209800 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G285525--Sobic004G224300 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic009G223700--Sobic001G457100 Sobic009G223700--Sobic004G226300 Sobic009G223700--Sobic007G183000 Sobic009G223700--Sobic002G048250 Sobic009G223700--Sobic002G285525 Sobic009G223700--Sobic003G290700 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic009G223700--Sobic006G169300 Sobic009G223700--Sobic001G527400 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic009G223700--Sobic004G347866 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic003G142900--Sobic010G029200 Sobic003G142900--Sobic008G023000 Sobic003G142900--Sobic008G002100 Sobic003G142900--Sobic001G527400 Sobic003G142900--Sobic004G226300 Sobic003G142900--Sobic007G183000 Sobic003G142900--Sobic005G209800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic003G142900--Sobic003G173032 Sobic003G142900--Sobic005G231800 Sobic001G483700--Sobic004G226300 Sobic001G483700--Sobic007G183000 Sobic001G483700--Sobic005G209800 Sobic001G483700--Sobic001G137200 Sobic001G483700--Sobic002G285525 Sobic001G483700--Sobic001G527400 Sobic001G483700--Sobic008G002100 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic001G483700--Sobic003G104900 Sobic001G483700--Sobic008G023000 Sobic009G028600--Sobic006G171000 Sobic009G028600--Sobic004G226300 Sobic009G028600--Sobic007G183000 Sobic009G028600--Sobic002G285525 Sobic009G028600--Sobic001G527400 Sobic009G028600--Sobic005G231800 Sobic009G028600--Sobic001G137200 Sobic009G028600--Sobic008G023000 Sobic009G028600--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032 Sobic001G137200--Sobic002G285525 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic001G137200--Sobic010G152700 Sobic001G137200--Sobic006G171000 Sobic001G137200--Sobic005G209800 Sobic001G137200--Sobic004G226300 Sobic001G137200--Sobic008G002100 Sobic001G137200--Sobic007G183000 Sobic001G137200--Sobic001G483700 Sobic001G137200--Sobic001G527400 Sobic006G171000--Sobic008G023000 Sobic006G171000--Sobic004G226300 Sobic006G171000--Sobic008G002100 Sobic006G171000--Sobic007G183000 Sobic006G171000--Sobic001G527400 Sobic006G171000--Sobic005G209800 Sobic006G171000--Sobic005G231800 Sobic006G171000--Sobic003G173032 Sobic006G171000--Sobic002G048250
Octagon: transcription factors


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