Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G028600.3
Synonym Sb09g002400
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R1C2
Pfam PF14383
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G58630 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g03770.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040708 , Zm00025a052599
Brachypodium KQK07890
Barley -
Wheat TraesCS1A02G069500 , TraesCS1B02G087900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
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19 Sobic.010G002850 - -
20 Sobic.003G104900 methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic009G028600--Sobic006G171000 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G028600--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic009G028600--Sobic007G183000 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic009G028600--Sobic002G285525 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic009G028600--Sobic001G527400 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic009G028600--Sobic005G231800 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic009G028600--Sobic001G137200 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic009G028600--Sobic008G023000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic009G028600--Sobic002G048250 Sobic006G171000--Sobic008G023000 Sobic006G171000--Sobic004G226300 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic006G171000--Sobic008G002100 Sobic006G171000--Sobic007G183000 Sobic006G171000--Sobic001G527400 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic006G171000--Sobic005G209800 Sobic006G171000--Sobic005G231800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic006G171000--Sobic003G173032 Sobic006G171000--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic002G285525--Sobic007G183000 Sobic002G285525--Sobic001G527400 Sobic002G285525--Sobic004G226300 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic002G285525--Sobic003G290700 Sobic002G285525--Sobic008G023000 Sobic002G285525--Sobic008G002100 Sobic002G285525--Sobic002G048250 Sobic002G285525--Sobic005G209800 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G285525--Sobic004G224300 Sobic001G527400--Sobic008G023000 Sobic001G527400--Sobic008G002100 Sobic001G527400--Sobic007G183000 Sobic001G527400--Sobic004G226300 Sobic001G527400--Sobic002G048250 Sobic001G527400--Sobic005G209800 Sobic001G527400--Sobic005G231800 Sobic001G527400--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic006G171000 Sobic005G231800--Sobic008G023000 Sobic005G231800--Sobic001G527400 Sobic005G231800--Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic007G183000 Sobic005G231800--Sobic004G226300 Sobic005G231800--Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic002G048250 Sobic005G231800--Sobic003G173032 Sobic005G231800--Sobic006G171000 Sobic001G137200--Sobic002G285525 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic001G137200--Sobic010G152700 Sobic001G137200--Sobic006G171000 Sobic001G137200--Sobic005G209800 Sobic001G137200--Sobic004G226300 Sobic001G137200--Sobic008G002100 Sobic001G137200--Sobic007G183000 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic001G137200--Sobic001G483700 Sobic001G137200--Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic008G002100 Sobic008G023000--Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic007G183000 Sobic008G023000--Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic004G226300 Sobic008G023000--Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic002G048250 Sobic008G023000--Sobic006G171000 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic002G048250--Sobic004G224300
Octagon: transcription factors


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