Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G136900.1
Synonym Sb08g018830
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YQ93
Pfam -
Panther DB PTHR36375 PTHR36375:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55420 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025402 , Zm00025a043897
Brachypodium KQJ86257
Barley HORVU5Hr1G021150.1 , HORVU5Hr1G021150.2
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G390300 expressed protein -
2 Sobic.004G061600 expressed protein -
3 Sobic.004G107400 expressed protein -
4 Sobic.001G103400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@FHA domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G158400 DUF617 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G483700 Cupin domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G014900 expressed protein -
8 Sobic.003G104900 methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
9 Sobic.009G028600 expressed protein -
10 Sobic.001G137200 homeobox domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G290700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.002G285525 - -
13 Sobic.009G223700 - -
14 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
15 Sobic.001G062700 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G061700 expressed protein -
17 Sobic.004G226300 expressed protein -
18 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
19 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I


Gene co-expression network
sample Sobic008G136900 Sobic008G136900 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic008G136900--Sobic003G390300 Sobic004G061600 Sobic004G061600 Sobic008G136900--Sobic004G061600 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic008G136900--Sobic004G107400 Sobic001G103400 Sobic001G103400 Sobic008G136900--Sobic001G103400 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic008G136900--Sobic007G158400 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic008G136900--Sobic001G483700 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic008G136900--Sobic010G014900 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic008G136900--Sobic003G104900 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic008G136900--Sobic009G028600 Sobic003G390300--Sobic004G107400 Sobic003G390300--Sobic004G061600 Sobic003G390300--Sobic008G136900 Sobic001G062700 Sobic001G062700 Sobic003G390300--Sobic001G062700 Sobic003G390300--Sobic003G104900 Sobic003G390300--Sobic010G014900 Sobic003G390300--Sobic007G158400 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic003G390300--Sobic001G137200 Sobic003G390300--Sobic009G028600 Sobic004G061600--Sobic003G390300 Sobic004G061600--Sobic007G158400 Sobic004G061600--Sobic008G136900 Sobic004G061600--Sobic010G014900 Sobic004G061600--Sobic001G062700 Sobic004G061600--Sobic004G107400 Sobic005G168500 Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic001G137200 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic004G061600--Sobic006G273500 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic004G107400--Sobic006G171000 Sobic004G107400--Sobic010G014900 Sobic004G107400--Sobic001G137200 Sobic004G107400--Sobic003G390300 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic004G107400--Sobic005G209800 Sobic002G078850 Sobic002G078850 Sobic004G107400--Sobic002G078850 Sobic004G107400--Sobic003G104900 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic004G107400--Sobic005G231800 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic004G107400--Sobic008G002100 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic001G103400--Sobic003G290700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic001G103400--Sobic002G285525 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic001G103400--Sobic009G223700 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic001G103400--Sobic003G142900 Sobic001G103400--Sobic001G483700 Sobic001G103400--Sobic009G028600 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic001G103400--Sobic004G226300 Sobic001G103400--Sobic001G137200 Sobic001G103400--Sobic006G171000 Sobic007G158400--Sobic010G014900 Sobic007G158400--Sobic004G107400 Sobic007G158400--Sobic001G137200 Sobic007G158400--Sobic006G171000 Sobic007G158400--Sobic004G061600 Sobic007G158400--Sobic009G028600 Sobic007G158400--Sobic005G168500 Sobic007G158400--Sobic005G231800 Sobic003G006500 Sobic003G006500 Sobic007G158400--Sobic003G006500 Sobic001G483700--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic001G483700--Sobic007G183000 Sobic001G483700--Sobic005G209800 Sobic001G483700--Sobic001G137200 Sobic001G483700--Sobic002G285525 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic001G483700--Sobic001G527400 Sobic001G483700--Sobic008G002100 Sobic001G483700--Sobic003G104900 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic001G483700--Sobic008G023000 Sobic010G014900--Sobic007G158400 Sobic010G014900--Sobic004G107400 Sobic010G014900--Sobic001G137200 Sobic010G014900--Sobic006G171000 Sobic010G014900--Sobic009G028600 Sobic010G014900--Sobic005G231800 Sobic010G014900--Sobic002G285525 Sobic010G014900--Sobic004G226300 Sobic010G014900--Sobic001G527400 Sobic003G104900--Sobic005G209800 Sobic003G104900--Sobic001G483700 Sobic003G104900--Sobic008G002100 Sobic003G104900--Sobic008G023000 Sobic003G104900--Sobic001G527400 Sobic003G104900--Sobic007G183000 Sobic003G104900--Sobic005G231800 Sobic003G104900--Sobic004G226300 Sobic003G104900--Sobic006G171000 Sobic009G028600--Sobic006G171000 Sobic009G028600--Sobic004G226300 Sobic009G028600--Sobic007G183000 Sobic009G028600--Sobic002G285525 Sobic009G028600--Sobic001G527400 Sobic009G028600--Sobic005G231800 Sobic009G028600--Sobic001G137200 Sobic009G028600--Sobic008G023000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic009G028600--Sobic002G048250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.