Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G335200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YTX9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G417201 - -
2 Sobic.008G025800 - -
3 Sobic.006G046200 - -
4 Sobic.001G139750 - -
5 Sobic.006G166601 - -
6 Sobic.001G391800 - -
7 Sobic.004G302500 thylakoid lumenal protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G140900 methyltransferase domain containing protein, putative, expressed K03183: demethylmenaquinone methyltransferase / 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase
9 Sobic.010G254801 - -
10 Sobic.002G068500 expressed protein -
11 Sobic.008G096900 protein of unknown function DUF502 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G136700 - -
14 Sobic.007G175701 - -
15 Sobic.001G191400 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
16 Sobic.010G242100 cytochrome P450 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G082400 - -
18 Sobic.003G400332 - -
19 Sobic.009G198400 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
20 Sobic.010G261300 protein kri1, putative, expressed K14786: protein KRI1


Gene co-expression network
sample Sobic004G335200 Sobic004G335200 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic004G335200--Sobic002G417201 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic004G335200--Sobic008G025800 Sobic006G046200 Sobic006G046200 Sobic004G335200--Sobic006G046200 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic004G335200--Sobic001G139750 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic004G335200--Sobic006G166601 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic004G335200--Sobic001G391800 Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic004G335200--Sobic004G302500 Sobic006G140900 Sobic006G140900 Sobic004G335200--Sobic006G140900 Sobic010G254801 Sobic010G254801 Sobic004G335200--Sobic010G254801 Sobic002G417201--Sobic004G335200 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic002G417201--Sobic008G096900 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic005G076100 Sobic002G417201--Sobic006G166601 Sobic002G417201--Sobic004G302500 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic002G417201--Sobic007G090406 Sobic002G417201--Sobic008G025800 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic002G417201--Sobic002G234900 Sobic002G417201--Sobic001G139750 Sobic008G025800--Sobic001G139750 Sobic007G175701 Sobic007G175701 Sobic008G025800--Sobic007G175701 Sobic003G136700 Sobic003G136700 Sobic008G025800--Sobic003G136700 Sobic001G213400 Sobic001G213400 Sobic008G025800--Sobic001G213400 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G025800--Sobic009G082400 Sobic009G198400 Sobic009G198400 Sobic008G025800--Sobic009G198400 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic008G025800--Sobic004G354800 Sobic001G130900 Sobic001G130900 Sobic008G025800--Sobic001G130900 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic008G025800--Sobic009G163500 Sobic006G046200--Sobic004G335200 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic006G046200--Sobic009G076000 Sobic006G046200--Sobic001G391800 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic006G046200--Sobic002G358200 Sobic002G006001 Sobic002G006001 Sobic006G046200--Sobic002G006001 Sobic009G205900 Sobic009G205900 Sobic006G046200--Sobic009G205900 Sobic001G288200 Sobic001G288200 Sobic006G046200--Sobic001G288200 Sobic006G046200--Sobic002G417201 Sobic001G423000 Sobic001G423000 Sobic006G046200--Sobic001G423000 Sobic001G139750--Sobic008G025800 Sobic003G400332 Sobic003G400332 Sobic001G139750--Sobic003G400332 Sobic001G139750--Sobic003G136700 Sobic001G139750--Sobic001G213400 Sobic001G139750--Sobic005G076100 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic001G139750--Sobic006G058300 Sobic001G139750--Sobic009G082400 Sobic001G139750--Sobic004G354800 Sobic001G139750--Sobic007G175701 Sobic001G261440 Sobic001G261440 Sobic006G166601--Sobic001G261440 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic006G166601--Sobic006G172651 Sobic003G239700 Sobic003G239700 Sobic006G166601--Sobic003G239700 Sobic006G166601--Sobic003G136700 Sobic006G166601--Sobic001G139750 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic006G166601--Sobic001G145300 Sobic006G166601--Sobic005G076100 Sobic001G422800 Sobic001G422800 Sobic006G166601--Sobic001G422800 Sobic006G166601--Sobic004G354800 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic001G391800--Sobic003G159400 Sobic001G391800--Sobic004G335200 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic001G391800--Sobic004G337700 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic001G391800--Sobic001G191400 Sobic001G391800--Sobic009G076000 Sobic001G391800--Sobic002G358200 Sobic001G391800--Sobic002G417201 Sobic001G391800--Sobic004G302500 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic001G391800--Sobic005G204900 Sobic004G302500--Sobic002G417201 Sobic009G247100 Sobic009G247100 Sobic004G302500--Sobic009G247100 Sobic006G044866 Sobic006G044866 Sobic004G302500--Sobic006G044866 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic004G302500--Sobic009G114900 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic004G302500--Sobic005G145700 Sobic004G302500--Sobic003G159400 Sobic004G302500--Sobic007G090406 Sobic004G302500--Sobic001G423000 Sobic004G302500--Sobic008G096900 Sobic010G242100 Sobic010G242100 Sobic006G140900--Sobic010G242100 Sobic010G197400 Sobic010G197400 Sobic006G140900--Sobic010G197400 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic006G140900--Sobic004G012100 Sobic009G200100 Sobic009G200100 Sobic006G140900--Sobic009G200100 Sobic010G253700 Sobic010G253700 Sobic006G140900--Sobic010G253700 Sobic006G140900--Sobic001G191400 Sobic009G072400 Sobic009G072400 Sobic006G140900--Sobic009G072400 Sobic006G140900--Sobic010G254801 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic006G140900--Sobic001G068901 Sobic010G254801--Sobic001G139750 Sobic010G254801--Sobic005G076100 Sobic010G254801--Sobic006G166601 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic010G254801--Sobic002G326200 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic010G254801--Sobic007G174100 Sobic010G254801--Sobic007G175701 Sobic010G254801--Sobic004G354800 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic010G254801--Sobic009G152901 Sobic010G254801--Sobic003G136700
Octagon: transcription factors


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