Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G254801.4,Sobic.010G254801.3,Sobic.010G254801.2,Sobic.010G254801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VUT5
Pfam -
Panther DB PTHR36006 PTHR36006:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78995 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g49070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018402
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G139750 - -
2 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G166601 - -
4 Sobic.002G326200 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
5 Sobic.007G174100 carrier, putative, expressed -
6 Sobic.007G175701 - -
7 Sobic.004G354800 - -
8 Sobic.009G152901 - -
9 Sobic.003G136700 - -
10 Sobic.001G115900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence./late senescence marker (common during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence)"(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.008G025800 - -
12 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.003G239700 proteins of unknown function domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G149900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G058300 expressed protein -
16 Sobic.002G373200 strictosidine synthase, putative, expressed -
17 Sobic.010G200800 protein kinase domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G082400 - -
19 Sobic.001G213400 HD domain containing protein 2, putative, expressed K06950: uncharacterized protein
20 Sobic.003G379500 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G254801 Sobic010G254801 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic010G254801--Sobic001G139750 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic010G254801--Sobic005G076100 Sobic006G166601 Sobic006G166601 Sobic010G254801--Sobic006G166601 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic010G254801--Sobic002G326200 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic010G254801--Sobic007G174100 Sobic007G175701 Sobic007G175701 Sobic010G254801--Sobic007G175701 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic010G254801--Sobic004G354800 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic010G254801--Sobic009G152901 Sobic003G136700 Sobic003G136700 Sobic010G254801--Sobic003G136700 Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic001G139750--Sobic008G025800 Sobic003G400332 Sobic003G400332 Sobic001G139750--Sobic003G400332 Sobic001G139750--Sobic003G136700 Sobic001G213400 Sobic001G213400 Sobic001G139750--Sobic001G213400 Sobic001G139750--Sobic005G076100 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic001G139750--Sobic006G058300 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic001G139750--Sobic009G082400 Sobic001G139750--Sobic004G354800 Sobic001G139750--Sobic007G175701 Sobic005G076100--Sobic009G082400 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic005G076100--Sobic004G016600 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic005G076100--Sobic001G537900 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic005G076100--Sobic003G008850 Sobic005G076100--Sobic007G174100 Sobic005G076100--Sobic004G354800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic005G076100--Sobic002G165401 Sobic003G149900 Sobic003G149900 Sobic005G076100--Sobic003G149900 Sobic005G076100--Sobic006G058300 Sobic001G261440 Sobic001G261440 Sobic006G166601--Sobic001G261440 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic006G166601--Sobic006G172651 Sobic003G239700 Sobic003G239700 Sobic006G166601--Sobic003G239700 Sobic006G166601--Sobic003G136700 Sobic006G166601--Sobic001G139750 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic006G166601--Sobic001G145300 Sobic006G166601--Sobic005G076100 Sobic001G422800 Sobic001G422800 Sobic006G166601--Sobic001G422800 Sobic006G166601--Sobic004G354800 Sobic002G326200--Sobic007G174100 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic002G326200--Sobic010G200800 Sobic002G326200--Sobic005G076100 Sobic002G326200--Sobic003G149900 Sobic002G326200--Sobic006G058300 Sobic002G326200--Sobic003G008850 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic002G326200--Sobic010G257300 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic002G326200--Sobic001G115900 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic002G326200--Sobic009G258150 Sobic007G174100--Sobic005G076100 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic010G132300 Sobic007G174100--Sobic003G149900 Sobic007G174100--Sobic002G326200 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic007G174100--Sobic004G160950 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic008G096150 Sobic007G174100--Sobic006G058300 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic008G096900 Sobic007G174100--Sobic003G008850 Sobic001G130900 Sobic001G130900 Sobic007G175701--Sobic001G130900 Sobic007G175701--Sobic001G213400 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic007G175701--Sobic007G093400 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic007G175701--Sobic007G122300 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic007G175701--Sobic003G367401 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic007G175701--Sobic003G120400 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic007G175701--Sobic010G201000 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic007G175701--Sobic001G525000 Sobic009G198400 Sobic009G198400 Sobic007G175701--Sobic009G198400 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic004G354800--Sobic009G163500 Sobic004G354800--Sobic001G537900 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic004G354800--Sobic003G109400 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic004G354800--Sobic008G020300 Sobic004G354800--Sobic003G136700 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic004G354800--Sobic004G197300 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic004G354800--Sobic008G131800 Sobic004G354800--Sobic009G152901 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic004G354800--Sobic001G255700 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic009G152901--Sobic004G239000 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic009G152901--Sobic001G016900 Sobic009G152901--Sobic003G367401 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic009G152901--Sobic001G120100 Sobic009G152901--Sobic004G016600 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic009G152901--Sobic003G368150 Sobic009G152901--Sobic004G197300 Sobic009G152901--Sobic001G537900 Sobic009G152901--Sobic010G201000 Sobic003G136700--Sobic009G163500 Sobic003G136700--Sobic004G354800 Sobic003G136700--Sobic003G109400 Sobic003G136700--Sobic006G172651 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic003G136700--Sobic004G251350 Sobic003G136700--Sobic001G537900 Sobic003G136700--Sobic004G197300 Sobic003G136700--Sobic009G082400 Sobic003G136700--Sobic008G020300
Octagon: transcription factors


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