Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G213400.1
Synonym Sb01g018860
Functional annotation HD domain containing protein 2, putative, expressed
UniProt C5WYA3
Pfam PF01966
Panther DB PTHR33594 PTHR33594:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology K06950; uncharacterized protein
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G17330 : Metal-dependent phosphohydrolase
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34470.1 : HD domain containing protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006546
Brachypodium KQJ97189
Barley HORVU1Hr1G042820.3 , HORVU1Hr1G042820.2 , HORVU1Hr1G042820.1 , HORVU1Hr1G042820.5 , HORVU1Hr1G042820.4
Wheat TraesCS1A02G161300 , TraesCS1D02G158300 , TraesCS1B02G177800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G213400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G213400 Sobic001G213400 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic001G213400--Sobic007G122300 Sobic007G175701 Sobic007G175701 Sobic001G213400--Sobic007G175701 Sobic001G130900 Sobic001G130900 Sobic001G213400--Sobic001G130900 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic001G213400--Sobic003G368150 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic001G213400--Sobic003G367401 Sobic002G430200 Sobic002G430200 Sobic001G213400--Sobic002G430200 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic001G213400--Sobic002G387100 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic001G213400--Sobic008G131800 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic001G213400--Sobic004G239000 Sobic007G122300--Sobic002G430200 Sobic007G122300--Sobic002G387100 Sobic007G122300--Sobic003G368150 Sobic007G122300--Sobic004G239000 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G122300--Sobic003G099500 Sobic007G122300--Sobic003G367401 Sobic007G122300--Sobic008G131800 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic007G122300--Sobic002G284800 Sobic001G441800 Sobic001G441800 Sobic007G122300--Sobic001G441800 Sobic007G175701--Sobic001G130900 Sobic007G175701--Sobic001G213400 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic007G175701--Sobic007G093400 Sobic007G175701--Sobic007G122300 Sobic007G175701--Sobic003G367401 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic007G175701--Sobic003G120400 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic007G175701--Sobic010G201000 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic007G175701--Sobic001G525000 Sobic009G198400 Sobic009G198400 Sobic007G175701--Sobic009G198400 Sobic001G130900--Sobic003G120400 Sobic001G130900--Sobic007G093400 Sobic001G130900--Sobic007G175701 Sobic001G130900--Sobic001G525000 Sobic003G200501 Sobic003G200501 Sobic001G130900--Sobic003G200501 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic001G130900--Sobic002G320900 Sobic001G130900--Sobic003G367401 Sobic002G210200 Sobic002G210200 Sobic001G130900--Sobic002G210200 Sobic001G130900--Sobic007G122300 Sobic003G368150--Sobic002G284800 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic003G368150--Sobic001G255700 Sobic003G368150--Sobic008G131800 Sobic003G368150--Sobic007G122300 Sobic003G368150--Sobic004G239000 Sobic008G133100 Sobic008G133100 Sobic003G368150--Sobic008G133100 Sobic003G368150--Sobic002G387100 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic003G368150--Sobic004G197300 Sobic003G368150--Sobic003G099500 Sobic003G367401--Sobic002G430200 Sobic003G367401--Sobic010G201000 Sobic003G367401--Sobic001G525000 Sobic003G367401--Sobic002G387100 Sobic003G367401--Sobic007G122300 Sobic003G367401--Sobic007G093400 Sobic003G367401--Sobic004G239000 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic003G367401--Sobic001G016900 Sobic003G367401--Sobic003G120400 Sobic002G430200--Sobic002G387100 Sobic002G430200--Sobic007G122300 Sobic002G430200--Sobic003G099500 Sobic002G430200--Sobic003G367401 Sobic002G430200--Sobic001G525000 Sobic002G430200--Sobic004G239000 Sobic002G430200--Sobic003G120400 Sobic002G430200--Sobic010G201000 Sobic002G430200--Sobic002G284800 Sobic002G387100--Sobic002G430200 Sobic002G387100--Sobic007G122300 Sobic002G387100--Sobic003G099500 Sobic002G387100--Sobic004G239000 Sobic002G387100--Sobic001G525000 Sobic002G387100--Sobic003G367401 Sobic002G387100--Sobic002G284800 Sobic002G387100--Sobic003G368150 Sobic002G387100--Sobic003G120400 Sobic008G131800--Sobic004G239000 Sobic008G131800--Sobic002G284800 Sobic008G131800--Sobic001G255700 Sobic008G131800--Sobic003G368150 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic008G131800--Sobic007G111600 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic008G131800--Sobic010G179150 Sobic008G131800--Sobic007G122300 Sobic008G131800--Sobic003G099500 Sobic008G131800--Sobic001G016900 Sobic004G239000--Sobic003G099500 Sobic004G239000--Sobic008G131800 Sobic004G239000--Sobic002G284800 Sobic004G239000--Sobic002G430200 Sobic004G239000--Sobic001G016900 Sobic004G239000--Sobic003G368150 Sobic004G239000--Sobic001G255700 Sobic004G239000--Sobic002G387100 Sobic004G239000--Sobic007G122300
Octagon: transcription factors


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