Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G025800.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R4J8
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cDNA sequences
Sobic.008G025800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G139750 - -
2 Sobic.007G175701 - -
3 Sobic.003G136700 - -
4 Sobic.001G213400 HD domain containing protein 2, putative, expressed K06950: uncharacterized protein
5 Sobic.009G082400 - -
6 Sobic.009G198400 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
7 Sobic.004G354800 - -
8 Sobic.001G130900 expressed protein -
9 Sobic.009G163500 - -
10 Sobic.005G076100 rp3 protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G335200 - -
12 Sobic.007G122300 - -
13 Sobic.006G166601 - -
14 Sobic.001G541900 "similar to Nitrate/chlorate transporter, putative, expressed"(PubMedID : 29862293)@peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
15 Sobic.004G251350 - -
16 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.008G131800 zinc knuckle family protein, expressed -
18 Sobic.010G261300 protein kri1, putative, expressed K14786: protein KRI1
19 Sobic.006G172651 - -
20 Sobic.001G115900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence./late senescence marker (common during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence)"(PubMedID : 27586543)@expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G025800 Sobic008G025800 Sobic001G139750 Sobic001G139750 Sobic008G025800--Sobic001G139750 Sobic007G175701 Sobic007G175701 Sobic008G025800--Sobic007G175701 Sobic003G136700 Sobic003G136700 Sobic008G025800--Sobic003G136700 Sobic001G213400 Sobic001G213400 Sobic008G025800--Sobic001G213400 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic008G025800--Sobic009G082400 Sobic009G198400 Sobic009G198400 Sobic008G025800--Sobic009G198400 Sobic004G354800 Sobic004G354800 Sobic008G025800--Sobic004G354800 Sobic001G130900 Sobic001G130900 Sobic008G025800--Sobic001G130900 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic008G025800--Sobic009G163500 Sobic001G139750--Sobic008G025800 Sobic003G400332 Sobic003G400332 Sobic001G139750--Sobic003G400332 Sobic001G139750--Sobic003G136700 Sobic001G139750--Sobic001G213400 Sobic005G076100 Sobic005G076100 Sobic001G139750--Sobic005G076100 Sobic006G058300 Sobic006G058300 Sobic001G139750--Sobic006G058300 Sobic001G139750--Sobic009G082400 Sobic001G139750--Sobic004G354800 Sobic001G139750--Sobic007G175701 Sobic007G175701--Sobic001G130900 Sobic007G175701--Sobic001G213400 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic007G175701--Sobic007G093400 Sobic007G122300 Sobic007G122300 Sobic007G175701--Sobic007G122300 Sobic003G367401 Sobic003G367401 Sobic007G175701--Sobic003G367401 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic007G175701--Sobic003G120400 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic007G175701--Sobic010G201000 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic007G175701--Sobic001G525000 Sobic007G175701--Sobic009G198400 Sobic003G136700--Sobic009G163500 Sobic003G136700--Sobic004G354800 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic003G136700--Sobic003G109400 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic003G136700--Sobic006G172651 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic003G136700--Sobic004G251350 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic003G136700--Sobic001G537900 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic003G136700--Sobic004G197300 Sobic003G136700--Sobic009G082400 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic003G136700--Sobic008G020300 Sobic001G213400--Sobic007G122300 Sobic001G213400--Sobic007G175701 Sobic001G213400--Sobic001G130900 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic001G213400--Sobic003G368150 Sobic001G213400--Sobic003G367401 Sobic002G430200 Sobic002G430200 Sobic001G213400--Sobic002G430200 Sobic002G387100 Sobic002G387100 Sobic001G213400--Sobic002G387100 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic001G213400--Sobic008G131800 Sobic004G239000 Sobic004G239000 Sobic001G213400--Sobic004G239000 Sobic009G082400--Sobic004G251350 Sobic009G082400--Sobic005G076100 Sobic009G082400--Sobic001G537900 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic009G082400--Sobic004G016600 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic009G082400--Sobic007G204500 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic009G082400--Sobic001G481201 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic009G082400--Sobic008G119000 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic009G082400--Sobic009G085600 Sobic009G082400--Sobic004G354800 Sobic009G198400--Sobic007G175701 Sobic009G198400--Sobic001G130900 Sobic009G198400--Sobic007G093400 Sobic009G198400--Sobic003G367401 Sobic009G198400--Sobic001G213400 Sobic003G065001 Sobic003G065001 Sobic009G198400--Sobic003G065001 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic009G198400--Sobic001G115900 Sobic009G198400--Sobic003G120400 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic009G198400--Sobic003G126400 Sobic004G354800--Sobic009G163500 Sobic004G354800--Sobic001G537900 Sobic004G354800--Sobic003G109400 Sobic004G354800--Sobic008G020300 Sobic004G354800--Sobic003G136700 Sobic004G354800--Sobic004G197300 Sobic004G354800--Sobic008G131800 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic004G354800--Sobic009G152901 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic004G354800--Sobic001G255700 Sobic001G130900--Sobic003G120400 Sobic001G130900--Sobic007G093400 Sobic001G130900--Sobic007G175701 Sobic001G130900--Sobic001G525000 Sobic003G200501 Sobic003G200501 Sobic001G130900--Sobic003G200501 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic001G130900--Sobic002G320900 Sobic001G130900--Sobic003G367401 Sobic002G210200 Sobic002G210200 Sobic001G130900--Sobic002G210200 Sobic001G130900--Sobic007G122300 Sobic009G163500--Sobic004G354800 Sobic009G163500--Sobic003G109400 Sobic009G163500--Sobic001G255700 Sobic009G163500--Sobic008G131800 Sobic009G163500--Sobic004G197300 Sobic009G163500--Sobic003G368150 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic009G163500--Sobic010G179150 Sobic009G163500--Sobic001G537900 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic009G163500--Sobic002G284800
Octagon: transcription factors


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