Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G288200.1
Synonym Sb01g028270
Functional annotation lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed
UniProt C5WRB6
Pfam PF02450
Panther DB PTHR11440 PTHR11440:SF49
NCBI CDD KOG2369; Lecithin:cholesterol acyltransferase (LCAT)/Acyl-ceramide synthase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008374; O-acyltransferase activity GO:0006629lipid metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G27480 : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g71800.1 : lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G547700 , TraesCS7A02G563200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G288200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G410300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G288200 Sobic001G288200 Sobic002G006001 Sobic002G006001 Sobic001G288200--Sobic002G006001 Sobic003G416900 Sobic003G416900 Sobic001G288200--Sobic003G416900 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic001G288200--Sobic002G358200 Sobic006G046200 Sobic006G046200 Sobic001G288200--Sobic006G046200 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic001G288200--Sobic004G337700 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic001G288200--Sobic009G036366 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic001G288200--Sobic006G151100 Sobic009G205900 Sobic009G205900 Sobic001G288200--Sobic009G205900 Sobic003G209500 Sobic003G209500 Sobic001G288200--Sobic003G209500 Sobic002G006001--Sobic003G416900 Sobic002G006001--Sobic004G337700 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic002G006001--Sobic009G076000 Sobic002G006001--Sobic009G205900 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic002G006001--Sobic010G043700 Sobic002G006001--Sobic001G288200 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic002G006001--Sobic001G341900 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic002G006001--Sobic003G093500 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic002G006001--Sobic004G224100 Sobic003G416900--Sobic002G006001 Sobic003G416900--Sobic004G337700 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic003G416900--Sobic004G257900 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic003G416900--Sobic002G282000 Sobic003G416900--Sobic009G076000 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic003G416900--Sobic004G314100 Sobic003G416900--Sobic009G205900 Sobic003G416900--Sobic001G288200 Sobic002G197500 Sobic002G197500 Sobic003G416900--Sobic002G197500 Sobic002G358200--Sobic009G076000 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic002G358200--Sobic001G391800 Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic002G358200--Sobic001G033800 Sobic002G358200--Sobic002G006001 Sobic002G358200--Sobic001G288200 Sobic002G358200--Sobic006G046200 Sobic002G358200--Sobic010G043700 Sobic002G358200--Sobic009G036366 Sobic002G337500 Sobic002G337500 Sobic002G358200--Sobic002G337500 Sobic004G335200 Sobic004G335200 Sobic006G046200--Sobic004G335200 Sobic006G046200--Sobic009G076000 Sobic006G046200--Sobic001G391800 Sobic006G046200--Sobic002G358200 Sobic006G046200--Sobic002G006001 Sobic006G046200--Sobic009G205900 Sobic006G046200--Sobic001G288200 Sobic002G417201 Sobic002G417201 Sobic006G046200--Sobic002G417201 Sobic001G423000 Sobic001G423000 Sobic006G046200--Sobic001G423000 Sobic004G337700--Sobic003G093500 Sobic004G337700--Sobic001G341900 Sobic004G337700--Sobic002G006001 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic004G337700--Sobic003G106100 Sobic004G337700--Sobic004G314100 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic004G337700--Sobic001G191400 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic004G337700--Sobic001G060200 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic004G337700--Sobic005G155001 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic004G337700--Sobic007G061500 Sobic010G256866 Sobic010G256866 Sobic009G036366--Sobic010G256866 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic009G036366--Sobic002G288500 Sobic008G067700 Sobic008G067700 Sobic009G036366--Sobic008G067700 Sobic009G036366--Sobic002G337500 Sobic009G036366--Sobic001G033800 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic009G036366--Sobic009G149600 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic009G036366--Sobic001G410300 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic009G036366--Sobic010G210050 Sobic009G036366--Sobic002G358200 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic006G151100--Sobic006G141400 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic006G151100--Sobic004G358150 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic006G151100--Sobic007G007600 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic006G151100--Sobic007G064000 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic006G151100--Sobic002G086700 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic006G151100--Sobic002G244901 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic006G151100--Sobic002G036500 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic006G151100--Sobic005G031901 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic006G151100--Sobic002G175700 Sobic009G205900--Sobic009G076000 Sobic009G205900--Sobic002G006001 Sobic009G205900--Sobic004G337700 Sobic009G205900--Sobic001G423000 Sobic009G205900--Sobic003G416900 Sobic009G205900--Sobic001G391800 Sobic009G205900--Sobic010G043700 Sobic009G205900--Sobic006G046200 Sobic009G205900--Sobic001G191400 Sobic006G138300 Sobic006G138300 Sobic003G209500--Sobic006G138300 Sobic003G209500--Sobic002G006001 Sobic003G209500--Sobic003G416900 Sobic003G358000 Sobic003G358000 Sobic003G209500--Sobic003G358000 Sobic003G209500--Sobic004G337700 Sobic001G061300 Sobic001G061300 Sobic003G209500--Sobic001G061300 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic003G209500--Sobic002G206900 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic003G209500--Sobic001G513900 Sobic003G209500--Sobic003G106100
Octagon: transcription factors


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