Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G006001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1S3
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KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G416900 esterase, putative, expressed -
2 Sobic.004G337700 expressed protein -
3 Sobic.009G076000 - -
4 Sobic.009G205900 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.010G043700 transferase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G288200 lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.001G341900 domain of unknown function domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G093500 protein binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G224100 RPA2B - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 2, expressed K10739: RFA2, replication factor A2
10 Sobic.002G358200 - -
11 Sobic.003G139100 - -
12 Sobic.006G044866 - -
13 Sobic.002G282000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G106100 expressed protein -
15 Sobic.004G314100 GS9(Ortholog in rice:Zhao et al.(2018))(PubMedID : 31659890)@expressed protein -
16 Sobic.003G209500 - -
17 Sobic.003G347560 - -
18 Sobic.006G046200 - -
19 Sobic.005G096201 - -
20 Sobic.001G410300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G006001 Sobic002G006001 Sobic003G416900 Sobic003G416900 Sobic002G006001--Sobic003G416900 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic002G006001--Sobic004G337700 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic002G006001--Sobic009G076000 Sobic009G205900 Sobic009G205900 Sobic002G006001--Sobic009G205900 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic002G006001--Sobic010G043700 Sobic001G288200 Sobic001G288200 Sobic002G006001--Sobic001G288200 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic002G006001--Sobic001G341900 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic002G006001--Sobic003G093500 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic002G006001--Sobic004G224100 Sobic003G416900--Sobic002G006001 Sobic003G416900--Sobic004G337700 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic003G416900--Sobic004G257900 Sobic002G282000 Sobic002G282000 Sobic003G416900--Sobic002G282000 Sobic003G416900--Sobic009G076000 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic003G416900--Sobic004G314100 Sobic003G416900--Sobic009G205900 Sobic003G416900--Sobic001G288200 Sobic002G197500 Sobic002G197500 Sobic003G416900--Sobic002G197500 Sobic004G337700--Sobic003G093500 Sobic004G337700--Sobic001G341900 Sobic004G337700--Sobic002G006001 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic004G337700--Sobic003G106100 Sobic004G337700--Sobic004G314100 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic004G337700--Sobic001G191400 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic004G337700--Sobic001G060200 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic004G337700--Sobic005G155001 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic004G337700--Sobic007G061500 Sobic009G076000--Sobic002G006001 Sobic009G076000--Sobic009G205900 Sobic009G076000--Sobic004G337700 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic009G076000--Sobic002G358200 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic009G076000--Sobic001G391800 Sobic006G046200 Sobic006G046200 Sobic009G076000--Sobic006G046200 Sobic009G076000--Sobic003G416900 Sobic009G064832 Sobic009G064832 Sobic009G076000--Sobic009G064832 Sobic009G076000--Sobic010G043700 Sobic009G205900--Sobic009G076000 Sobic009G205900--Sobic002G006001 Sobic009G205900--Sobic004G337700 Sobic001G423000 Sobic001G423000 Sobic009G205900--Sobic001G423000 Sobic009G205900--Sobic003G416900 Sobic009G205900--Sobic001G391800 Sobic009G205900--Sobic010G043700 Sobic009G205900--Sobic006G046200 Sobic009G205900--Sobic001G191400 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic010G043700--Sobic001G410300 Sobic010G043700--Sobic001G341900 Sobic010G043700--Sobic004G337700 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic010G043700--Sobic007G189900 Sobic003G139100 Sobic003G139100 Sobic010G043700--Sobic003G139100 Sobic010G043700--Sobic002G006001 Sobic010G220100 Sobic010G220100 Sobic010G043700--Sobic010G220100 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic010G043700--Sobic009G181900 Sobic010G043700--Sobic004G224100 Sobic001G288200--Sobic002G006001 Sobic001G288200--Sobic003G416900 Sobic001G288200--Sobic002G358200 Sobic001G288200--Sobic006G046200 Sobic001G288200--Sobic004G337700 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic001G288200--Sobic009G036366 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic001G288200--Sobic006G151100 Sobic001G288200--Sobic009G205900 Sobic003G209500 Sobic003G209500 Sobic001G288200--Sobic003G209500 Sobic001G341900--Sobic003G093500 Sobic001G341900--Sobic007G061500 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic001G341900--Sobic009G004500 Sobic001G341900--Sobic004G224100 Sobic001G341900--Sobic004G337700 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic001G341900--Sobic008G192800 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic001G341900--Sobic009G045100 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic001G341900--Sobic001G368000 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G341900--Sobic009G114900 Sobic003G093500--Sobic009G004500 Sobic003G093500--Sobic007G061500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic003G093500--Sobic007G017300 Sobic003G093500--Sobic001G341900 Sobic003G093500--Sobic008G192800 Sobic003G093500--Sobic009G045100 Sobic003G093500--Sobic005G155001 Sobic003G093500--Sobic004G224100 Sobic003G093500--Sobic001G060200 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic004G224100--Sobic005G096201 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic004G224100--Sobic002G013600 Sobic004G224100--Sobic003G093500 Sobic004G224100--Sobic003G139100 Sobic004G224100--Sobic001G341900 Sobic004G224100--Sobic001G060200 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic004G224100--Sobic004G047001 Sobic004G224100--Sobic008G192800 Sobic004G224100--Sobic007G061500
Octagon: transcription factors


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