Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G033800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WV06
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g45000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G358200 - -
2 Sobic.009G036366 - -
3 Sobic.004G295900 cell division cycle protein 23, putative, expressed K03355: APC8, anaphase-promoting complex subunit 8
4 Sobic.002G288500 serine/threonine kinase, putative, expressed -
5 Sobic.010G210050 - -
6 Sobic.006G088450 - -
7 Sobic.009G149600 transmembrane protein 18, putative, expressed -
8 Sobic.002G104500 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
9 Sobic.003G159400 - -
10 Sobic.005G135300 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
11 Sobic.005G068400 - -
12 Sobic.002G244901 - -
13 Sobic.008G016400 - -
14 Sobic.006G266850 - -
15 Sobic.006G165700 - -
16 Sobic.005G232100 prenyltransferase, putative, expressed K14137: protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing protein 1
17 Sobic.002G176800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@NAD kinase, putative, expressed K00858: ppnK, NAD+ kinase
18 Sobic.009G223000 - -
19 Sobic.008G131601 - -
20 Sobic.010G196433 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic002G358200 Sobic002G358200 Sobic001G033800--Sobic002G358200 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic001G033800--Sobic009G036366 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic001G033800--Sobic004G295900 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic001G033800--Sobic002G288500 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic001G033800--Sobic010G210050 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic001G033800--Sobic006G088450 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic001G033800--Sobic009G149600 Sobic002G104500 Sobic002G104500 Sobic001G033800--Sobic002G104500 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic001G033800--Sobic003G159400 Sobic009G076000 Sobic009G076000 Sobic002G358200--Sobic009G076000 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic002G358200--Sobic001G391800 Sobic002G358200--Sobic001G033800 Sobic002G006001 Sobic002G006001 Sobic002G358200--Sobic002G006001 Sobic001G288200 Sobic001G288200 Sobic002G358200--Sobic001G288200 Sobic006G046200 Sobic006G046200 Sobic002G358200--Sobic006G046200 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic002G358200--Sobic010G043700 Sobic002G358200--Sobic009G036366 Sobic002G337500 Sobic002G337500 Sobic002G358200--Sobic002G337500 Sobic010G256866 Sobic010G256866 Sobic009G036366--Sobic010G256866 Sobic009G036366--Sobic002G288500 Sobic008G067700 Sobic008G067700 Sobic009G036366--Sobic008G067700 Sobic009G036366--Sobic002G337500 Sobic009G036366--Sobic001G033800 Sobic009G036366--Sobic009G149600 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic009G036366--Sobic001G410300 Sobic009G036366--Sobic010G210050 Sobic009G036366--Sobic002G358200 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic004G295900--Sobic005G068400 Sobic004G295900--Sobic006G088450 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic004G295900--Sobic010G249600 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic004G295900--Sobic007G226000 Sobic004G295900--Sobic009G149600 Sobic004G295900--Sobic002G288500 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic004G295900--Sobic005G135300 Sobic004G295900--Sobic001G033800 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic004G295900--Sobic007G185000 Sobic002G288500--Sobic006G088450 Sobic002G288500--Sobic005G068400 Sobic002G288500--Sobic005G135300 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic009G223000 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic002G288500--Sobic002G051500 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic002G288500--Sobic003G364550 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic002G288500--Sobic008G131601 Sobic002G288500--Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic004G295900 Sobic010G196433 Sobic010G196433 Sobic010G210050--Sobic010G196433 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic010G210050--Sobic002G176800 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic010G210050--Sobic006G266850 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic010G210050--Sobic005G031901 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic010G210050--Sobic002G244901 Sobic006G246400 Sobic006G246400 Sobic010G210050--Sobic006G246400 Sobic010G210050--Sobic001G033800 Sobic010G210050--Sobic009G036366 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic010G210050--Sobic004G358301 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic006G088450--Sobic001G336600 Sobic001G191300 Sobic001G191300 Sobic009G149600--Sobic001G191300 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic009G149600--Sobic001G350300 Sobic009G149600--Sobic010G249600 Sobic004G350600 Sobic004G350600 Sobic009G149600--Sobic004G350600 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic009G149600--Sobic006G249600 Sobic002G399000 Sobic002G399000 Sobic009G149600--Sobic002G399000 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic009G149600--Sobic007G077466 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic009G149600--Sobic009G223900 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic009G149600--Sobic003G155800 Sobic003G418800 Sobic003G418800 Sobic002G104500--Sobic003G418800 Sobic002G104500--Sobic003G159400 Sobic002G350800 Sobic002G350800 Sobic002G104500--Sobic002G350800 Sobic001G140101 Sobic001G140101 Sobic002G104500--Sobic001G140101 Sobic005G232100 Sobic005G232100 Sobic002G104500--Sobic005G232100 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic002G104500--Sobic010G278400 Sobic002G104500--Sobic009G149600 Sobic002G104500--Sobic001G033800 Sobic002G104500--Sobic004G295900 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic003G159400--Sobic005G145700 Sobic003G159400--Sobic001G391800 Sobic004G302500 Sobic004G302500 Sobic003G159400--Sobic004G302500 Sobic003G159400--Sobic002G104500 Sobic003G159400--Sobic009G149600 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic003G159400--Sobic009G054200 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic003G159400--Sobic010G021401 Sobic001G435800 Sobic001G435800 Sobic003G159400--Sobic001G435800 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic003G159400--Sobic004G337700
Octagon: transcription factors


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