Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G131601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R7I4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g17290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G135300 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
2 Sobic.001G336600 COBRA-like protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.002G091500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G068400 - -
5 Sobic.006G088450 - -
6 Sobic.003G364550 - -
7 Sobic.007G193900 expressed protein -
8 Sobic.003G352750 - -
9 Sobic.006G266850 - -
10 Sobic.002G288500 serine/threonine kinase, putative, expressed -
11 Sobic.002G051500 expressed protein -
12 Sobic.009G162550 - -
13 Sobic.008G174000 OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G176800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@NAD kinase, putative, expressed K00858: ppnK, NAD+ kinase
15 Sobic.009G160900 expressed protein -
16 Sobic.009G069400 - -
17 Sobic.001G139200 - -
18 Sobic.003G387400 - -
19 Sobic.009G253500 OsFBX259 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G315000 homeobox-leucine zipper protein ATHB-54, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic005G135300 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic008G131601--Sobic001G336600 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic008G131601--Sobic002G091500 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic008G131601--Sobic005G068400 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic008G131601--Sobic006G088450 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic008G131601--Sobic003G364550 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic007G193900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic008G131601--Sobic003G352750 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic008G131601--Sobic006G266850 Sobic005G135300--Sobic005G068400 Sobic005G135300--Sobic008G131601 Sobic005G135300--Sobic006G088450 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic003G364550 Sobic005G135300--Sobic001G336600 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic005G135300--Sobic002G051500 Sobic005G135300--Sobic002G091500 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic005G135300--Sobic004G295900 Sobic001G336600--Sobic007G193900 Sobic001G336600--Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic008G131601 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic001G336600--Sobic009G160900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G336600--Sobic006G144900 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G336600--Sobic009G203600 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic001G336600--Sobic002G260500 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic003G387400 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G336600--Sobic002G345100 Sobic002G091500--Sobic008G131601 Sobic002G091500--Sobic006G266850 Sobic002G091500--Sobic005G135300 Sobic008G174000 Sobic008G174000 Sobic002G091500--Sobic008G174000 Sobic002G091500--Sobic001G336600 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic002G091500--Sobic003G315000 Sobic002G091500--Sobic006G088450 Sobic002G091500--Sobic005G068400 Sobic009G069400 Sobic009G069400 Sobic002G091500--Sobic009G069400 Sobic005G068400--Sobic006G088450 Sobic005G068400--Sobic005G135300 Sobic005G068400--Sobic002G288500 Sobic005G068400--Sobic008G131601 Sobic005G068400--Sobic002G051500 Sobic005G068400--Sobic003G364550 Sobic005G068400--Sobic001G336600 Sobic005G068400--Sobic004G295900 Sobic005G068400--Sobic003G352750 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic001G336600 Sobic003G364550--Sobic001G336600 Sobic003G364550--Sobic005G135300 Sobic003G364550--Sobic005G068400 Sobic003G364550--Sobic008G131601 Sobic003G364550--Sobic002G051500 Sobic003G364550--Sobic006G088450 Sobic003G364550--Sobic002G288500 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic003G364550--Sobic002G296800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G364550--Sobic010G025200 Sobic007G193900--Sobic001G336600 Sobic007G193900--Sobic009G160900 Sobic007G193900--Sobic002G260500 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic007G193900--Sobic004G013400 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic007G193900--Sobic008G175933 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic007G193900--Sobic003G210701 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G193900--Sobic009G258200 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic007G193900--Sobic005G201800 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic007G193900--Sobic007G027400 Sobic003G352750--Sobic001G336600 Sobic004G096000 Sobic004G096000 Sobic003G352750--Sobic004G096000 Sobic001G086100 Sobic001G086100 Sobic003G352750--Sobic001G086100 Sobic009G162550 Sobic009G162550 Sobic003G352750--Sobic009G162550 Sobic003G352750--Sobic008G131601 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic003G352750--Sobic004G293600 Sobic003G352750--Sobic006G144900 Sobic003G352750--Sobic009G160900 Sobic003G352750--Sobic009G203600 Sobic006G266850--Sobic002G091500 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic006G266850--Sobic010G210050 Sobic006G246400 Sobic006G246400 Sobic006G266850--Sobic006G246400 Sobic006G266850--Sobic008G131601 Sobic006G266850--Sobic003G315000 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic006G266850--Sobic002G176800 Sobic006G266850--Sobic005G135300 Sobic006G266850--Sobic006G088450 Sobic010G196433 Sobic010G196433 Sobic006G266850--Sobic010G196433
Octagon: transcription factors


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