Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G174000.1
Synonym
Functional annotation OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PEA6
Pfam PF07734 PF00646
Panther DB PTHR31790 PTHR31790:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10340 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g42340.1 : OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G091500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
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18 Sobic.007G193900 expressed protein -
19 Sobic.007G107900 expressed protein -
20 Sobic.002G288500 serine/threonine kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G174000 Sobic008G174000 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic008G174000--Sobic002G091500 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic008G174000--Sobic008G131601 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic008G174000--Sobic005G135300 Sobic009G069400 Sobic009G069400 Sobic008G174000--Sobic009G069400 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic008G174000--Sobic006G266850 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic008G174000--Sobic001G336600 Sobic009G253500 Sobic009G253500 Sobic008G174000--Sobic009G253500 Sobic010G196433 Sobic010G196433 Sobic008G174000--Sobic010G196433 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic008G174000--Sobic006G088450 Sobic002G091500--Sobic008G131601 Sobic002G091500--Sobic006G266850 Sobic002G091500--Sobic005G135300 Sobic002G091500--Sobic008G174000 Sobic002G091500--Sobic001G336600 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic002G091500--Sobic003G315000 Sobic002G091500--Sobic006G088450 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic002G091500--Sobic005G068400 Sobic002G091500--Sobic009G069400 Sobic008G131601--Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic001G336600 Sobic008G131601--Sobic002G091500 Sobic008G131601--Sobic005G068400 Sobic008G131601--Sobic006G088450 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic008G131601--Sobic003G364550 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic007G193900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic008G131601--Sobic003G352750 Sobic008G131601--Sobic006G266850 Sobic005G135300--Sobic005G068400 Sobic005G135300--Sobic008G131601 Sobic005G135300--Sobic006G088450 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic003G364550 Sobic005G135300--Sobic001G336600 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic005G135300--Sobic002G051500 Sobic005G135300--Sobic002G091500 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic005G135300--Sobic004G295900 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic009G069400--Sobic003G308900 Sobic009G069400--Sobic005G135300 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic009G069400--Sobic002G296800 Sobic004G045900 Sobic004G045900 Sobic009G069400--Sobic004G045900 Sobic009G069400--Sobic002G091500 Sobic009G069400--Sobic009G253500 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic009G069400--Sobic004G304900 Sobic009G069400--Sobic008G131601 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic009G069400--Sobic010G265100 Sobic006G266850--Sobic002G091500 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic006G266850--Sobic010G210050 Sobic006G246400 Sobic006G246400 Sobic006G266850--Sobic006G246400 Sobic006G266850--Sobic008G131601 Sobic006G266850--Sobic003G315000 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic006G266850--Sobic002G176800 Sobic006G266850--Sobic005G135300 Sobic006G266850--Sobic006G088450 Sobic006G266850--Sobic010G196433 Sobic001G336600--Sobic007G193900 Sobic001G336600--Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic008G131601 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic001G336600--Sobic009G160900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G336600--Sobic006G144900 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G336600--Sobic009G203600 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic001G336600--Sobic002G260500 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic003G387400 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G336600--Sobic002G345100 Sobic002G275050 Sobic002G275050 Sobic009G253500--Sobic002G275050 Sobic002G319700 Sobic002G319700 Sobic009G253500--Sobic002G319700 Sobic009G253500--Sobic001G336600 Sobic009G253500--Sobic009G069400 Sobic008G014900 Sobic008G014900 Sobic009G253500--Sobic008G014900 Sobic009G253500--Sobic008G131601 Sobic009G253500--Sobic002G051500 Sobic009G253500--Sobic007G193900 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic009G253500--Sobic003G118750 Sobic010G196433--Sobic010G210050 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic010G196433--Sobic002G244901 Sobic010G196433--Sobic006G266850 Sobic010G196433--Sobic002G176800 Sobic008G079733 Sobic008G079733 Sobic010G196433--Sobic008G079733 Sobic003G375800 Sobic003G375800 Sobic010G196433--Sobic003G375800 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic010G196433--Sobic006G151100 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic010G196433--Sobic008G139250 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic010G196433--Sobic005G031901 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic001G336600
Octagon: transcription factors


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