Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G253500.1
Synonym Sb09g030410
Functional annotation OsFBX259 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R426
Pfam PF08268 PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF157
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19940 : F-box and associated interaction domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47160.1 : OsFBX259 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G073490.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G275050 - K17604: zinc finger SWIM domain-containing protein 3
2 Sobic.002G319700 BCS1 protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G336600 COBRA-like protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.009G069400 - -
5 Sobic.008G014900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
6 Sobic.008G131601 - -
7 Sobic.002G051500 expressed protein -
8 Sobic.007G193900 expressed protein -
9 Sobic.003G118750 - -
10 Sobic.003G387400 - -
11 Sobic.002G091500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G160900 expressed protein -
13 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
14 Sobic.003G352750 - -
15 Sobic.006G102600 - -
16 Sobic.005G106900 expressed protein K17757: ATP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase
17 Sobic.005G135300 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
18 Sobic.005G059300 ctr copper transporter family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G260500 - -
20 Sobic.008G174000 OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G253500 Sobic009G253500 Sobic002G275050 Sobic002G275050 Sobic009G253500--Sobic002G275050 Sobic002G319700 Sobic002G319700 Sobic009G253500--Sobic002G319700 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic009G253500--Sobic001G336600 Sobic009G069400 Sobic009G069400 Sobic009G253500--Sobic009G069400 Sobic008G014900 Sobic008G014900 Sobic009G253500--Sobic008G014900 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic009G253500--Sobic008G131601 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic009G253500--Sobic002G051500 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic009G253500--Sobic007G193900 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic009G253500--Sobic003G118750 Sobic003G118700 Sobic003G118700 Sobic002G275050--Sobic003G118700 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic002G275050--Sobic003G326100 Sobic002G275050--Sobic007G193900 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic002G275050--Sobic002G188800 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic002G275050--Sobic004G181100 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic002G275050--Sobic008G096401 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic002G275050--Sobic004G052700 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic002G275050--Sobic006G042800 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic002G275050--Sobic001G060001 Sobic002G319700--Sobic008G014900 Sobic002G319700--Sobic003G118700 Sobic006G163066 Sobic006G163066 Sobic002G319700--Sobic006G163066 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic002G319700--Sobic005G201800 Sobic002G237600 Sobic002G237600 Sobic002G319700--Sobic002G237600 Sobic003G318650 Sobic003G318650 Sobic002G319700--Sobic003G318650 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic002G319700--Sobic002G067050 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic002G319700--Sobic005G059300 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic002G319700--Sobic005G014600 Sobic001G336600--Sobic007G193900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic008G131601 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic001G336600--Sobic009G160900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G336600--Sobic006G144900 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G336600--Sobic009G203600 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic001G336600--Sobic002G260500 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic003G387400 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G336600--Sobic002G345100 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic009G069400--Sobic003G308900 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic009G069400--Sobic005G135300 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic009G069400--Sobic002G296800 Sobic004G045900 Sobic004G045900 Sobic009G069400--Sobic004G045900 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic009G069400--Sobic002G091500 Sobic009G069400--Sobic009G253500 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic009G069400--Sobic004G304900 Sobic009G069400--Sobic008G131601 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic009G069400--Sobic010G265100 Sobic008G014900--Sobic002G319700 Sobic007G095850 Sobic007G095850 Sobic008G014900--Sobic007G095850 Sobic003G060900 Sobic003G060900 Sobic008G014900--Sobic003G060900 Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic008G014900--Sobic007G215300 Sobic001G213150 Sobic001G213150 Sobic008G014900--Sobic001G213150 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic008G014900--Sobic009G029800 Sobic002G226600 Sobic002G226600 Sobic008G014900--Sobic002G226600 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic008G014900--Sobic003G141400 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic008G014900--Sobic010G273200 Sobic008G131601--Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic001G336600 Sobic008G131601--Sobic002G091500 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic008G131601--Sobic005G068400 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic008G131601--Sobic006G088450 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic008G131601--Sobic003G364550 Sobic008G131601--Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic003G352750 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic008G131601--Sobic006G266850 Sobic002G051500--Sobic005G068400 Sobic002G051500--Sobic003G364550 Sobic002G051500--Sobic006G088450 Sobic002G051500--Sobic005G135300 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic002G051500--Sobic002G288500 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic008G131601 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic002G051500--Sobic007G072200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic002G051500--Sobic009G240300 Sobic007G193900--Sobic001G336600 Sobic007G193900--Sobic009G160900 Sobic007G193900--Sobic002G260500 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic007G193900--Sobic004G013400 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic007G193900--Sobic008G175933 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic007G193900--Sobic003G210701 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G193900--Sobic009G258200 Sobic007G193900--Sobic005G201800 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic007G193900--Sobic007G027400 Sobic003G118750--Sobic003G141400 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic003G118750--Sobic004G173900 Sobic003G118750--Sobic005G059300 Sobic003G118750--Sobic009G029800 Sobic003G118750--Sobic001G213150 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic003G118750--Sobic010G091750 Sobic003G118750--Sobic010G273200 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic003G118750--Sobic010G010100 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic003G118750--Sobic002G103400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.