Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G336600.1,Sobic.001G336600.2
Synonym Sb01g032460, COBL1
Functional annotation COBRA-like protein precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6QMJ5 , A0A1Z5S8Z3
Pfam PF04833
Panther DB PTHR31673 PTHR31673:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016049; cell growth GO:0010215cellulose microfibril organization


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G02210 : COBRA-like protein 1 precursor
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g41310.1 : COBRA, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT77242
Barley HORVU4Hr1G014530.3 , HORVU4Hr1G014530.2 , HORVU4Hr1G014530.1 , HORVU4Hr1G014530.7 , HORVU4Hr1G014530.6 , HORVU4Hr1G014530.5 , HORVU4Hr1G014530.4 , HORVU4Hr1G014530.9 , HORVU4Hr1G014530.8 , HORVU4Hr1G014530.13 , HORVU4Hr1G014530.11 , HORVU4Hr1G014530.15 , HORVU4Hr1G014530.14
Wheat TraesCS4A02G231200 , TraesCS4B02G084800 , TraesCS4D02G082700
Populus PNS96138 , PNS96139 , PNS96137


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic001G336600--Sobic007G193900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic003G352750 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic001G336600--Sobic008G131601 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic001G336600--Sobic009G160900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G336600--Sobic006G144900 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G336600--Sobic009G203600 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic001G336600--Sobic002G260500 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic003G387400 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G336600--Sobic002G345100 Sobic007G193900--Sobic001G336600 Sobic007G193900--Sobic009G160900 Sobic007G193900--Sobic002G260500 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic007G193900--Sobic004G013400 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic007G193900--Sobic008G175933 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic007G193900--Sobic003G210701 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G193900--Sobic009G258200 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic007G193900--Sobic005G201800 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic007G193900--Sobic007G027400 Sobic003G352750--Sobic001G336600 Sobic004G096000 Sobic004G096000 Sobic003G352750--Sobic004G096000 Sobic001G086100 Sobic001G086100 Sobic003G352750--Sobic001G086100 Sobic009G162550 Sobic009G162550 Sobic003G352750--Sobic009G162550 Sobic003G352750--Sobic008G131601 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic003G352750--Sobic004G293600 Sobic003G352750--Sobic006G144900 Sobic003G352750--Sobic009G160900 Sobic003G352750--Sobic009G203600 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic001G336600 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic008G131601--Sobic002G091500 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic008G131601--Sobic005G068400 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic008G131601--Sobic006G088450 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic008G131601--Sobic003G364550 Sobic008G131601--Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic003G352750 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic008G131601--Sobic006G266850 Sobic009G160900--Sobic002G260500 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic009G160900--Sobic004G173800 Sobic009G160900--Sobic004G013400 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic009G160900--Sobic006G004700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic009G160900--Sobic002G063500 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic009G160900--Sobic008G053700 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic009G160900--Sobic007G087500 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic009G160900--Sobic008G069901 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic009G160900--Sobic003G046000 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic009G203600--Sobic006G144900 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic009G203600--Sobic008G045300 Sobic009G203600--Sobic003G333150 Sobic009G203600--Sobic002G345100 Sobic009G203600--Sobic004G293600 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic009G203600--Sobic002G076200 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic009G203600--Sobic003G243750 Sobic009G203600--Sobic001G336600 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic009G203600--Sobic003G250340 Sobic002G260500--Sobic004G173800 Sobic002G260500--Sobic008G053700 Sobic002G260500--Sobic006G004700 Sobic002G260500--Sobic003G046000 Sobic002G260500--Sobic008G069901 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G260500--Sobic006G076700 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G260500--Sobic004G184900 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G260500--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic002G260500--Sobic001G160300 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic003G387400--Sobic009G174833 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic003G387400--Sobic004G173900 Sobic003G387400--Sobic006G144900 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic003G387400--Sobic007G201300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic003G387400--Sobic003G118750 Sobic003G387400--Sobic002G260500 Sobic003G387400--Sobic003G210701 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G387400--Sobic004G200501 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic003G387400--Sobic008G139200 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic002G345100--Sobic002G046400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic009G142600 Sobic002G345100--Sobic003G210701 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic002G345100--Sobic005G025500 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic002G345100--Sobic002G084100 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic002G345100--Sobic005G014600 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic002G345100--Sobic001G358101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic002G345100--Sobic004G162800
Octagon: transcription factors


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