Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G293600.1
Synonym Sb04g032750
Functional annotation OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5Y1H5
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g23900.1 : OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G086100 - -
2 Sobic.002G345100 expressed protein -
3 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
4 Sobic.003G002800 expressed protein -
5 Sobic.008G045300 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G273200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
7 Sobic.002G103400 - -
8 Sobic.001G152240 - -
9 Sobic.010G091750 - -
10 Sobic.005G144101 - -
11 Sobic.002G260500 - -
12 Sobic.004G173800 - -
13 Sobic.005G025500 expressed protein -
14 Sobic.003G333150 - -
15 Sobic.009G142600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.009G029800 endoglucanase, putative, expressed -
17 Sobic.008G053700 - -
18 Sobic.003G060900 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
20 Sobic.007G087500 hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic001G086100 Sobic001G086100 Sobic004G293600--Sobic001G086100 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic004G293600--Sobic002G345100 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic004G293600--Sobic006G144900 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic004G293600--Sobic003G002800 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic004G293600--Sobic008G045300 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic004G293600--Sobic010G273200 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic004G293600--Sobic002G103400 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic004G293600--Sobic001G152240 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic004G293600--Sobic010G091750 Sobic001G086100--Sobic004G293600 Sobic001G086100--Sobic002G345100 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic001G086100--Sobic002G046400 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic001G086100--Sobic005G025500 Sobic001G086100--Sobic003G002800 Sobic004G328800 Sobic004G328800 Sobic001G086100--Sobic004G328800 Sobic001G086100--Sobic006G144900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic001G086100--Sobic009G142600 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G086100--Sobic005G014600 Sobic002G345100--Sobic002G046400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic009G142600 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic002G345100--Sobic003G210701 Sobic002G345100--Sobic005G025500 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic002G345100--Sobic002G084100 Sobic002G345100--Sobic005G014600 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic002G345100--Sobic001G358101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic002G345100--Sobic004G162800 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic003G002800--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic003G002800--Sobic008G053700 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic003G002800--Sobic004G173800 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic003G002800--Sobic007G087500 Sobic003G002800--Sobic001G152240 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic003G002800--Sobic003G046000 Sobic003G002800--Sobic002G103400 Sobic003G002800--Sobic005G025500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic003G002800--Sobic001G033701 Sobic008G045300--Sobic003G333150 Sobic002G188200 Sobic002G188200 Sobic008G045300--Sobic002G188200 Sobic008G045300--Sobic004G293600 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic008G045300--Sobic009G203600 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic008G045300--Sobic010G196200 Sobic008G045300--Sobic004G328800 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic008G045300--Sobic008G175933 Sobic008G045300--Sobic002G345100 Sobic008G045300--Sobic006G144900 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic010G273200--Sobic005G144101 Sobic010G273200--Sobic001G152240 Sobic010G273200--Sobic002G103400 Sobic010G273200--Sobic010G091750 Sobic003G060900 Sobic003G060900 Sobic010G273200--Sobic003G060900 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic010G273200--Sobic009G029800 Sobic010G273200--Sobic004G173800 Sobic010G273200--Sobic007G087500 Sobic010G273200--Sobic006G004700 Sobic002G103400--Sobic001G152240 Sobic002G103400--Sobic005G144101 Sobic002G103400--Sobic010G273200 Sobic002G103400--Sobic008G053700 Sobic002G103400--Sobic006G004700 Sobic002G103400--Sobic010G091750 Sobic002G103400--Sobic004G173800 Sobic002G103400--Sobic007G087500 Sobic002G103400--Sobic003G046000 Sobic001G152240--Sobic002G103400 Sobic001G152240--Sobic010G273200 Sobic001G152240--Sobic005G144101 Sobic001G152240--Sobic004G173800 Sobic001G152240--Sobic008G053700 Sobic001G152240--Sobic006G004700 Sobic001G152240--Sobic010G091750 Sobic001G152240--Sobic007G087500 Sobic001G152240--Sobic003G046000 Sobic010G091750--Sobic002G103400 Sobic010G091750--Sobic010G273200 Sobic010G091750--Sobic007G087500 Sobic010G091750--Sobic005G144101 Sobic010G091750--Sobic001G152240 Sobic010G091750--Sobic006G004700 Sobic010G091750--Sobic008G053700 Sobic010G091750--Sobic004G173800 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G091750--Sobic001G452300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.