Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G025500.1
Synonym Sb05g002120
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y428
Pfam -
Panther DB PTHR36392 PTHR36392:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G09225 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g04174.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033399
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G026630.1 , HORVU4Hr1G026630.3 , HORVU4Hr1G026630.2
Wheat TraesCS4D02G125400 , TraesCS4A02G188000 , TraesCS4B02G130200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G008601 - -
2 Sobic.005G014600 OsMan09 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
3 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
4 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
5 Sobic.008G069901 - -
6 Sobic.008G008701 - -
7 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G046500 gibberellin 20 oxidase 1-B, putative, expressed -
10 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G033701 - -
12 Sobic.009G113300 - -
13 Sobic.002G289601 - -
14 Sobic.001G045300 ubiquitin family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G081500 - -
16 Sobic.003G046000 - -
17 Sobic.005G013700 - -
18 Sobic.002G084100 - -
19 Sobic.007G027400 MBTB16 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
20 Sobic.001G160300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic005G025500--Sobic008G008601 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic005G025500--Sobic005G014600 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic005G025500--Sobic004G122700 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic005G025500--Sobic004G090900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic005G025500--Sobic008G069901 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G025500--Sobic008G008701 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G025500--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic005G025500--Sobic001G452300 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic005G025500--Sobic002G046500 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic005G014600--Sobic002G289601 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic005G014600--Sobic009G113300 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic005G014600--Sobic002G084100 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic005G014600--Sobic010G081500 Sobic005G014600--Sobic002G046500 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic005G014600--Sobic003G245101 Sobic005G014600--Sobic004G090900 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic005G014600--Sobic009G159800 Sobic005G014600--Sobic008G069901 Sobic004G122700--Sobic008G008701 Sobic004G122700--Sobic004G090900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic004G122700--Sobic001G138500 Sobic004G122700--Sobic008G008601 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic004G122700--Sobic001G045300 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G122700--Sobic005G207550 Sobic004G122700--Sobic002G046500 Sobic004G122700--Sobic001G033701 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic004G122700--Sobic007G027400 Sobic004G090900--Sobic002G046500 Sobic004G090900--Sobic001G045300 Sobic004G090900--Sobic007G027400 Sobic004G090900--Sobic008G008701 Sobic004G090900--Sobic002G084100 Sobic004G090900--Sobic005G014600 Sobic004G090900--Sobic004G122700 Sobic004G090900--Sobic001G033701 Sobic004G090900--Sobic003G245101 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic008G069901--Sobic003G046000 Sobic008G069901--Sobic004G184900 Sobic008G069901--Sobic009G113300 Sobic008G069901--Sobic010G081500 Sobic008G069901--Sobic002G289601 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic008G069901--Sobic001G160300 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic008G069901--Sobic006G258200 Sobic008G069901--Sobic002G063500 Sobic008G069901--Sobic005G014600 Sobic008G008701--Sobic004G122700 Sobic008G008701--Sobic004G090900 Sobic008G008701--Sobic001G045300 Sobic008G008701--Sobic001G138500 Sobic008G008701--Sobic002G046500 Sobic008G008701--Sobic007G027400 Sobic008G008701--Sobic005G207550 Sobic008G008701--Sobic001G033701 Sobic008G008701--Sobic008G008601 Sobic002G063500--Sobic008G069901 Sobic002G063500--Sobic001G160300 Sobic002G063500--Sobic003G046000 Sobic002G063500--Sobic004G184900 Sobic002G063500--Sobic009G113300 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic002G063500--Sobic006G004700 Sobic002G063500--Sobic005G014600 Sobic002G063500--Sobic002G289601 Sobic002G063500--Sobic010G081500 Sobic001G452300--Sobic008G008601 Sobic001G452300--Sobic007G087500 Sobic001G452300--Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic008G069901 Sobic001G452300--Sobic002G063500 Sobic001G452300--Sobic004G184900 Sobic001G452300--Sobic008G008701 Sobic001G452300--Sobic004G090900 Sobic001G452300--Sobic001G033701 Sobic002G046500--Sobic004G090900 Sobic002G046500--Sobic001G045300 Sobic002G046500--Sobic007G027400 Sobic002G046500--Sobic002G084100 Sobic002G046500--Sobic003G245101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic002G046500--Sobic004G162800 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic002G046500--Sobic001G358101 Sobic002G046500--Sobic002G289601 Sobic002G046500--Sobic005G014600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.