Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G033701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S449
Pfam -
Panther DB PTHR33377
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g60660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
2 Sobic.002G046500 gibberellin 20 oxidase 1-B, putative, expressed -
3 Sobic.001G045300 ubiquitin family protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G289601 - -
5 Sobic.005G014600 OsMan09 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
6 Sobic.002G084100 - -
7 Sobic.007G027400 MBTB16 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
8 Sobic.008G008701 - -
9 Sobic.009G113300 - -
10 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
11 Sobic.003G245101 - -
12 Sobic.010G081500 - -
13 Sobic.008G069901 - -
14 Sobic.004G162800 - -
15 Sobic.001G358101 - -
16 Sobic.009G159800 - -
17 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G160300 - -
19 Sobic.006G258200 - -
20 Sobic.008G008601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic001G033701--Sobic004G090900 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic001G033701--Sobic002G046500 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic001G033701--Sobic001G045300 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic001G033701--Sobic002G289601 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G033701--Sobic005G014600 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic001G033701--Sobic002G084100 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic001G033701--Sobic007G027400 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic001G033701--Sobic008G008701 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic001G033701--Sobic009G113300 Sobic004G090900--Sobic002G046500 Sobic004G090900--Sobic001G045300 Sobic004G090900--Sobic007G027400 Sobic004G090900--Sobic008G008701 Sobic004G090900--Sobic002G084100 Sobic004G090900--Sobic005G014600 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G090900--Sobic004G122700 Sobic004G090900--Sobic001G033701 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic004G090900--Sobic003G245101 Sobic002G046500--Sobic004G090900 Sobic002G046500--Sobic001G045300 Sobic002G046500--Sobic007G027400 Sobic002G046500--Sobic002G084100 Sobic002G046500--Sobic003G245101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic002G046500--Sobic004G162800 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic002G046500--Sobic001G358101 Sobic002G046500--Sobic002G289601 Sobic002G046500--Sobic005G014600 Sobic001G045300--Sobic007G027400 Sobic001G045300--Sobic002G046500 Sobic001G045300--Sobic004G090900 Sobic001G045300--Sobic001G358101 Sobic001G045300--Sobic004G162800 Sobic001G045300--Sobic003G245101 Sobic001G045300--Sobic002G084100 Sobic001G045300--Sobic008G008701 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic001G045300--Sobic003G190701 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic002G289601--Sobic010G081500 Sobic002G289601--Sobic009G113300 Sobic002G289601--Sobic002G084100 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic002G289601--Sobic009G159800 Sobic002G289601--Sobic003G245101 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G289601--Sobic006G258200 Sobic002G289601--Sobic005G014600 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic002G289601--Sobic001G160300 Sobic002G289601--Sobic004G162800 Sobic005G014600--Sobic002G289601 Sobic005G014600--Sobic009G113300 Sobic005G014600--Sobic002G084100 Sobic005G014600--Sobic010G081500 Sobic005G014600--Sobic002G046500 Sobic005G014600--Sobic003G245101 Sobic005G014600--Sobic004G090900 Sobic005G014600--Sobic009G159800 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic005G014600--Sobic008G069901 Sobic002G084100--Sobic003G245101 Sobic002G084100--Sobic002G289601 Sobic002G084100--Sobic009G159800 Sobic002G084100--Sobic004G162800 Sobic002G084100--Sobic010G081500 Sobic002G084100--Sobic002G046500 Sobic002G084100--Sobic009G113300 Sobic002G084100--Sobic001G358101 Sobic002G084100--Sobic005G014600 Sobic007G027400--Sobic001G045300 Sobic007G027400--Sobic002G046500 Sobic007G027400--Sobic001G358101 Sobic007G027400--Sobic004G090900 Sobic007G027400--Sobic004G162800 Sobic007G027400--Sobic003G245101 Sobic007G027400--Sobic002G084100 Sobic007G027400--Sobic003G190701 Sobic007G027400--Sobic008G008701 Sobic008G008701--Sobic004G122700 Sobic008G008701--Sobic004G090900 Sobic008G008701--Sobic001G045300 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic008G008701--Sobic001G138500 Sobic008G008701--Sobic002G046500 Sobic008G008701--Sobic007G027400 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic008G008701--Sobic005G207550 Sobic008G008701--Sobic001G033701 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic008G008701--Sobic008G008601 Sobic009G113300--Sobic010G081500 Sobic009G113300--Sobic002G289601 Sobic009G113300--Sobic006G258200 Sobic009G113300--Sobic001G160300 Sobic009G113300--Sobic002G084100 Sobic009G113300--Sobic009G159800 Sobic009G113300--Sobic008G069901 Sobic009G113300--Sobic005G014600 Sobic009G113300--Sobic003G245101
Octagon: transcription factors


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